Table 2.
The algorithm for designating bacterial strains based on analytical specificity of assay-sets to their targets.
| 6A | 6B | 6C | 6D | 10A | 10B | 11E | 12A/F/44 | 18A | 18B | 18C | 18F | 19B | 19F | 22A | 22F | 23A | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6A/B/C/D | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 6A/C | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 6C/D | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 10A/B | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 10B | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 11A/B/C/D/E/F | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 11A/D | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 11B/C | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 11F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 12A/B/F/44/46 | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 12B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 16F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 16F/18F/28AF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − |
| 17A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 17A/34/37 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 18A/B/C | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − |
| 18BCF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − |
| 18CF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − |
| 19B/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − |
| 19F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
| 22AF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − |
| 22F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − |
| 23A/B/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + |
| 23B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 23F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 25A/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 25A/F/38 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 28A/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 33A/F/37 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 33B/C | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 33B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 34 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 35F/47F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 46 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 47A/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| IS481 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| PtxS1 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| hIS1001 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| pIS1001 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| IgA1 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| BexA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| BexB | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Hin−b | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 25A/F | 33A/F | 33B | 33C | 35F | 37 | 38 | 47A | 47F | B.pertussis | B.holmesii | B.parapertussis | B.bronchiseptica | H. influenzae | H.influenzae−b | NTHI | ||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6A/B/C/D | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 6A/C | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 6C/D | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 10A/B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 10B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 11A/B/C/D/E/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 11A/D | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 11B/C | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 11F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 12A/B/F/44/46 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 12B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 16F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 16F/18F/28AF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 17A | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 17A/34/37 | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 18A/B/C | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 18BCF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 18CF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 19B/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 19F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 22AF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 22F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 23A/B/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 23B | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 23F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 25A/F | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 25A/F/38 | + | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
| 28A/F | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 33A/F/37 | − | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 33B/C | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 33B | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 34 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 35F/47F | − | − | − | − | + | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | |
| 46 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| 47A/F | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | |
| IS481 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | |
| PtxS1 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | |
| hIS1001 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | |
| pIS1001 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | |
| IgA1 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | |
| BexA | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | |
| BexB | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | |
| Hin−b | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | |