Table 5.
Target | Ligand | Cluster | Hydrogen Bond |
Hydrophobic Interaction |
Halogen Bonds |
Salt Bridge |
|||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Residue | Sidechain | Distance (H-A, Å) | Distance (D-A, Å) | Residue | Distance (Å) | Residue | Sidechain | Distance (Å) | Residue | Distance (Å) | |||
I7L |
Batefenterol |
C2 |
GLU108 | FALSE | 2.09 | 2.97 | LEU109 | 3.70 | |||||
ASN295 | TRUE | 3.51 | 3.88 | TYR238 | 3.63 | ||||||||
LYS243 | 3.78 | ||||||||||||
ILE298 |
3.73 |
||||||||||||
C3 |
SER078 | FALSE | 2.52 | 3.46 | LEU077 | 3.87 | |||||||
SER078 | TRUE | 2.41 | 3.21 | ARG099 | 3.73 | GLU108 | TRUE | 2.87 | |||||
SER078 | TRUE | 2.96 | 3.81 | PRO264 | 3.66 | ||||||||
ARG099 | TRUE | 3.40 | 4.10 | PHE267 | 3.64 | ||||||||
TYR100 | TRUE | 2.47 | 3.35 | PHE275 | 3.70 | ||||||||
GLU108 | FALSE | 1.79 | 2.76 | PHE278 | 3.83 | ||||||||
ILE298 | 3.77 | ||||||||||||
ILE316 |
3.62 |
||||||||||||
C4 |
HIS076 | FALSE | 2.89 | 3.41 | ARG099 | 3.81 | GLU108 | TRUE | 2.62 | ||||
SER078 | FALSE | 3.25 | 3.69 | LEU109 | 3.53 | ||||||||
SER078 | TRUE | 2.37 | 3.21 | ASN262 | 3.97 | ||||||||
SER078 | TRUE | 3.13 | 4.06 | PHE267 | 3.89 | ||||||||
ARG099 | TRUE | 3.02 | 3.44 | PHE275 | 3.89 | ||||||||
ARG099 | TRUE | 3.08 | 4.06 | ILE316 | 3.76 | ||||||||
ASN262 |
TRUE |
3.37 |
4.04 |
||||||||||
Burixafor |
C2 |
THR111 | TRUE | 2.74 | 3.55 | VAL047 | 3.55 | ASP297 | 4.61 | ||||
SER200 | FALSE | 3.03 | 4.01 | PRO064 | 3.91 | ||||||||
LYS206 | TRUE | 2.65 | 3.38 | ||||||||||
LYS243 | TRUE | 3.23 | 3.76 | ||||||||||
ASN293 | FALSE | 2.13 | 2.96 | ||||||||||
THR294 | TRUE | 3.03 | 3.94 | ||||||||||
ASN295 |
TRUE |
1.81 |
2.77 |
||||||||||
C3 |
THR111 | TRUE | 2.86 | 3.59 | TYR046 | 3.49 | |||||||
THR111 | TRUE | 2.99 | 3.59 | LYS050 | 3.55 | ||||||||
LYS243 | TRUE | 3.63 | 4.08 | TYR051 | 3.58 | ||||||||
VAL060 | 3.97 | ||||||||||||
PRO064 |
3.84 |
||||||||||||
Eluxadoline |
C2 |
THR111 | TRUE | 1.99 | 2.89 | LYS243 | 5.00 | ||||||
SER240 |
FALSE |
2.20 |
3.18 |
||||||||||
C3 |
SER240 | FALSE | 2.04 | 3.02 | TYR046 | 3.81 | LYS243 | 4.37 | |||||
HIS241 | FALSE | 3.16 | 3.48 | ILE113 | 3.64 | ||||||||
TYR238 | 3.76 | ||||||||||||
LEU239 | 3.70 | ||||||||||||
LEU239 |
3.83 |
||||||||||||
Top1B |
Batefenterol |
C1 |
ARG223 | TRUE | 3.42 | 3.87 | LEU122 | 3.94 | |||||
ARG223 | FALSE | 3.06 | 3.85 | LEU122 | 3.67 | ||||||||
HIS265 | TRUE | 3.02 | 3.48 | PHE131 | 3.40 | ||||||||
TYR274 | FALSE | 1.78 | 2.76 | PHE131 | 3.90 | ||||||||
LEU146 | 3.90 | ||||||||||||
GLU205 | 3.66 | ||||||||||||
VAL208 | 3.78 | ||||||||||||
VAL208 | 3.79 | ||||||||||||
ARG223 | 3.32 | ||||||||||||
VAL227 |
3.96 |
||||||||||||
C2 |
MET126 | FALSE | 2.30 | 3.26 | LEU122 | 3.84 | |||||||
ILE129 | FALSE | 2.03 | 2.90 | ARG130 | 3.88 | ||||||||
ARG130 | TRUE | 3.17 | 3.76 | PHE131 | 3.58 | ||||||||
ARG130 | TRUE | 3.18 | 3.76 | VAL208 | 3.47 | ||||||||
PHE131 | FALSE | 2.46 | 3.39 | ILE212 | 3.63 | ||||||||
GLY132 | FALSE | 2.33 | 3.09 | LEU222 | 3.53 | ||||||||
TYR136 | TRUE | 3.07 | 4.00 | ||||||||||
TYR136 | TRUE | 3.40 | 4.00 | ||||||||||
GLU261 |
FALSE |
2.75 |
3.24 |
||||||||||
Burixafor |
C1 |
PHE128 | FALSE | 3.18 | 3.85 | PHE128 | 3.57 | ||||||
ARG130 | TRUE | 2.88 | 3.44 | PHE128 | 3.85 | ||||||||
HIS172 | TRUE | 2.31 | 3.06 | ILE129 | 3.79 | ||||||||
PHE164 | 3.29 | ||||||||||||
HIS172 | 3.97 | ||||||||||||
PHE174 | 3.99 | ||||||||||||
TYR233 |
3.74 |
||||||||||||
C2 |
MET126 | FALSE | 2.02 | 2.97 | ILE129 | 3.92 | |||||||
ARG130 | FALSE | 2.75 | 3.39 | PHE164 | 3.62 | ||||||||
GLU173 | FALSE | 2.02 | 2.94 | VAL175 | 3.60 | ||||||||
ARG223 | TRUE | 1.80 | 2.75 | ||||||||||
ARG223 |
TRUE |
1.89 |
2.80 |
||||||||||
Eluxadoline |
C1 |
ARG130 | FALSE | 3.06 | 3.56 | HIS172 | 3.87 | ||||||
PHE131 | FALSE | 2.02 | 3.02 | ||||||||||
ARG223 | TRUE | 3.17 | 4.03 | ||||||||||
THR230 | TRUE | 1.86 | 2.84 | ||||||||||
VAL262 |
FALSE |
1.86 |
2.73 |
||||||||||
C2 |
ARG130 | FALSE | 2.81 | 3.30 | |||||||||
PHE131 | FALSE | 1.71 | 2.69 | ARG223 | 4.80 | ||||||||
ARG223 | TRUE | 2.22 | 3.01 | ||||||||||
VAL262 | FALSE | 2.22 | 2.90 | ||||||||||
GLY264 |
FALSE |
2.49 |
3.15 |
||||||||||
C5 |
ARG130 | FALSE | 2.24 | 2.97 | ARG130 | 3.80 | |||||||
PHE131 | FALSE | 2.22 | 3.20 | PHE164 | 3.88 | ||||||||
VAL262 | FALSE | 1.93 | 2.91 | HIS172 | 3.72 | ||||||||
VAL263 |
FALSE |
2.80 |
3.79 |
||||||||||
VETFS | Batefenterol |
C1 |
ARG262 | TRUE | 1.65 | 2.65 | PHE271 | 3.47 | ASP443 | 5.20 | |||
ASP272 | FALSE | 2.38 | 3.36 | TYR276 | 3.90 | ||||||||
TYR276 | 3.92 | ||||||||||||
THR444 |
3.78 |
||||||||||||
C2 |
TYR258 | TRUE | 1.97 | 2.88 | ASP272 | 3.72 | ASP443 | 5.07 | |||||
ARG262 | TRUE | 3.14 | 3.84 | MET275 | 3.78 | ||||||||
ARG262 | TRUE | 2.38 | 3.30 | TYR477 | 3.61 | ||||||||
ASP272 |
FALSE |
2.10 |
3.06 |
||||||||||
C3 |
ARG262 | TRUE | 1.86 | 2.82 | PHE271 | 3.60 | LYS273 | TRUE | 3.59 | ASP443 | 5.25 | ||
ASP272 | FALSE | 2.10 | 3.09 | TYR276 | 3.53 | ||||||||
TYR276 | 3.62 | ||||||||||||
ASP443 | 3.91 | ||||||||||||
TYR477 |
3.54 |
||||||||||||
Burixafor |
C3 |
ASN170 | TRUE | 2.93 | 3.63 | PHE445 | 3.88 | ||||||
ASN497 |
FALSE |
3.12 |
4.05 |
||||||||||
C4 |
SER166 | FALSE | 1.82 | 2.79 | |||||||||
GLU494 | TRUE | 2.69 | 3.52 | PHE445 | 3.88 | ||||||||
GLU494 | TRUE | 2.62 | 3.52 | ||||||||||
ASN497 |
FALSE |
2.25 |
3.09 |
||||||||||
Eluxadoline | C3 | ARG262 | TRUE | 1.95 | 2.88 | PHE271 | 3.83 | ||||||
ARG262 | TRUE | 3.34 | 3.93 | PHE271 | 3.68 | ||||||||
MET275 | 3.67 | ||||||||||||
TYR477 | 3.70 |