Skip to main content
. 2023 Mar 29;30(20):58569–58587. doi: 10.1007/s11356-023-26517-0

Table 2.

Primers sequences, target genes, and cycling conditions for RT-PCR

Target gene Primers sequences Product size (bp) Reverse transcription Primary
denaturation
Amplification (40 cycles) Dissociation curve
(1 cycle)
Reference
Secondary denaturation Annealing
(Optics on)
Extension Secondary denaturation Annealing Final denaturation

β-actin

(EU887951)

CCACACAGTGCCCATCTACGA CCACGCTCTGTCAGGATCTTCA 89

50 °C

30 min

94 °C

5 min

94 °C

15 s

62 °C

30 s

72 °C

30 s

94 °C

1 min

62 °C

1 min

94 °C

1 min

Qiang et al. 2014

TGF-β

(XM_003459454)

GTTTGAACTTCGGCGGTACTG

TCCTGCTCATAGTCCCAGAGA

80

50 °C

30 min

94 °C

5 min

94 °C

15 s

60 °C

30 s

72 °C

30 s

94 °C

1 min

60 °C

1 min

94 °C

1 min

Standen et al. 2016

IL-1β

(XM_005457887)

TGGTGACTCTCCTGGTCTGA GCACAACTTTATCGGCTTCCA 86

50 °C

30 min

94 °C

5 min

94 °C

15 s

62 °C

30 s

72 °C

30 s

94 °C

1 min

62 °C

1 min

94 °C

1 min

Standen et al. 2016

IL-10β

(XM_003441366)

CTGCTAGATCAGTCCGTCGAA

GCAGAACCGTGTCCAGGTAA

94

50 °C

30 min

94 °C

5 min

94 °C

15 s

60 °C

30 s

72 °C

30 s

94 °C

1 min

60 °C

1 min

94 °C

1 min

Standen et al. 2016

TNF-α

(AY428948)

CCAGAAGCACTAAAGGCGAAGA

CCTTGGCTTTGCTGCTGATC

82

50 °C

30 min

94 °C

5 min

94 °C

15 s

60 °C

30 s

72 °C

30 s

94 °C

1 min

60 °C

1 min

94 °C

1 min

Standen et al. 2016