Table 2.
Affinity binding score of docked secondary metabolites from MVFE with CD36, LOX1, and SRA-1.
| The receptor | Secondary metabolites (Pubchem ID) | Binding Afinity (kcal/mol) | Hydrogen Bond | Hydrophobic Bond Interaction |
|---|---|---|---|---|
| CD36 | Simvastatin (54454) | −5.3 | SER A:168, ASN A:139, PHE A:170, SER A:167 | PRO A:185 |
| Retusin (5352005) | −6.4 | GLN A:74, SER A:167, VAL A:172, ASP A:184 | GLN A;171, PRO A:185, PHE A:170, PRO A:73, MET A:77 | |
| Ayanin (5280682) | −6.2 | GLN A:74, SER A:167, VAL A:172, SER A:168, ASP A:184 | GLN A:171, PRO A:185 | |
| Apigenin (5280443) | −6.1 | SER A:167, VAL A:172 | ||
| Kaempferide (5281666) | −5.9 | SER A:167, ASP A:184, VAL A:172 | PRO A:185 | |
| 15(16)EpODE (16061062) | −5.0 | ASN A:139, SER A:167, ASP A:184 | PRO A:73. VAL A:172 | |
| Gamma-Glutamyl-S-Allylcysteine (11346811) | −4.9 | PHE A:170, SER A:167, ASN A:139, SER A:168 | ||
| Capsaicin (1548943) | −4.9 | THR B:663, PRO A:191, LEU A:161, LYS A:164, | ||
| Linoleic Acid (5280934) | −4.7 | LYS A:164, LEU A:189, LEU A:161, PRO A:191, LEU B:669 | ||
| Oleamide (5283387) | −3.2 | GLN A:171 | PRO A:73, VAL A:172, ARG A:173 | |
| LOX1 | Simvastatin (54454) | −7,2 | PHE A:158 | LEU A:157 |
| Apigenin (5280443) | −8,4 | TYR A:197, SER A:160 | ILE B:149, PHE A:158, ALA B:194, LEU A:157 | |
| Kaempferide (5281666) | −7,6 | ASP A:147, SER A:160 | ILE B:149, PHE A:158, ILE A:149, TYR A:197, ALA B:194, LEU A:157 | |
| Ayanin (5280682) | −7,4 | PHE B:190 | LEU A:157, PHE A:158, ALA B:194, ILE B:149, LEU A:175, ILE A:149, SER A:160 | |
| Retusin (5352005) | −7,4 | SER A:160 | LEU A:157, PHE A:158, LEU A:175, ALA B:194, ILE A:149, ILE B:149 | |
| Capsaicin (1548943) | −7,3 | PHE A:158, ASP A:147 | ALA A:194, PHE A:190, ILE A:149, ILE B:149, PHE B:158, TYR A:197, ALA B:194 | |
| 15(16)EpODE (16061062) | −6,2 | PHE A:158, ASP A:147, SER A:160 | PHE A:158, PHE B:190, ALA B:194, ILE B:149, LEU A:175 | |
| Linoleic Acid (5280934) | −6,2 | SER A:160, LEU A:157 | PHE A:158, ILE B:149, LEU A:157, LEU A:175, ALA B:194, PHE B:190 | |
| Gamma-Glutamyl-S-Allylcysteine (11346811) | −5,9 | ASP A:147, ALA B:194, TYR B:197 | TRP A:148, LEU A:157 | |
| Oleamide (5283387) | −5,8 | ASP A:147, TYR A:156, PHE A:158 | PHE A:158, TRP A:148, LEU A:157, PHE B:190, ALA B:194, TYR B:197 | |
| SRA1 | Simvastatin (54454) | +35 | ASP A:29, GLU A:96, LYS A:54, ASP:30 | |
| Retusin (5352005) | −6,4 | ASP A:29, GLU A:96, ASP A:30, LYS A:54 | ||
| Ayanin (5280682) | −6,2 | ASP A:29, TRP A:32 | GLU A:96, ASP A:29, LYS A:54, ASP A:30 | |
| Apigenin (5280443) | −6,1 | ASP A:29. GLU A:96, LYS A:54, ASP A:30 | ||
| Kaempferide (5281666) | −5,9 | TRP A:32. ASP A:29 | GLU A:96, ALA A:55, LYS A:54, ASP A:30 | |
| Linoleic Acid (5280934) | −4,7 | GLU A:96 | LYS A:54, ALA A:55 | |
| Oleamide (5283387) | −4,2 | LYS A:54, ALA A:55 | ||
| Gamma-Glutamyl-S-Allylcysteine (11346811) | −2.8 | ASP A:30, SER A:95, GLU A:96 | LYS A:53, ALA A:55 | |
| Capsaicin (1548943) | −1.8 | ASP A:30, GLU A:96 | ASP A:29, LYS A:54 | |
| 15(16)EpODE (16061062) | −0.5 | ALA A:91, ASP A:30, CYS A:92 | ALA A:55, LYS A:54 |