Table 2.
Bacterial and fungal families identified separately by multi-linear (lm) and clustering analyses (fclust) as key actors in basal soil respiration (soil), straw mineralization (straw), and the priming effect.
| Mineralisation | Incubation Time | Model | Bacteria | Unknown | Planctomycetaceae | Acidobacteria_Gp1 | Acidobacteria_Gp2 | Thermomonosporaceae | Ktedonobacteraceae | Undefined | Bradyrhizobiaceae | Acidobacteria_Gp4 | Hyphomicrobiaceae | Acetobacteraceae | Chitinophagaceae | Conexibacteraceae | Cystobacteraceae | Mycobacteriaceae | Pseudonocardiaceae | Burkholderiaceae | Oxalobacteraceae | Polyangiaceae | Gemmatimonadaceae | Chloroplast | Acidobacteria_Gp6 | Chthonomonadaceae | Acidobacteria_Gp7 | Streptomycetaceae | Rhodospirillaceae | Micromonosporaceae | Fervidicoccaceae | Acidimicrobineae_incertae_sedis | Paenibacillaceae | Xanthomonadaceae | Beijerinckiaceae | Bacillaceae | Comamonadaceae | Catenulisporaceae | Nocardioidaceae | Caulobacteraceae | Actinospicaceae | Acidobacteria_Gp13 | Bdellovibrionaceae | Solirubrobacteraceae | Acidobacteria_Gp5 | Rubrobacteraceae | Haliangiaceae | Planococcaceae | Sinobacteraceae | Coxiellaceae | Cyanobacteria.Chloroplast_F1 | Methylocystaceae | Geodermatophilaceae | Rhizobiales_incertae_sedis | Armatimonadaceae | Acidobacteria_Gp3 | Xanthobacteraceae | Flavobacteriaceae | Pasteuriaceae | Phyllobacteriaceae | Methylobacteriaceae | Nitrospiraceae | Microbacteriaceae |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| soil | 7 d | lm | *** | *** | . | *** | *** | *** | . | *** | *** | . | *** | *** | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | *** | *** | . | *** | . | . | *** | . | *** | . | |||||||||||||||||||||||||||||
| − | − | − | − | + | − | − | − | + | − | − | − | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| fclust | *** | *** | *** | *** | *** | *** | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| D | E | C− | A+ | C− | E | E | E | E | D | B+ | E | D | E | A+ | C− | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 42 d | lm | *** | *** | *** | *** | . | *** | . | . | *** | *** | *** | *** | . | *** | . | . | . | *** | *** | . | . | . | . | . | *** | . | . | *** | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| − | − | − | − | − | + | − | + | + | − | − | − | + | − | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| fclust | *** | *** | *** | *** | *** | *** | *** | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| B+ | A+ | E | C | B+ | C | E | D+ | D+ | A+ | D+ | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| straw | 7 d | lm | . | . | *** | *** | *** | *** | . | *** | *** | . | *** | *** | . | . | *** | . | *** | *** | . | . | . | . | . | . | *** | . | . | . | *** | . | *** | *** | . | . | . | *** | *** | *** | |||||||||||||||||||||||
| − | + | − | − | − | + | + | + | + | − | + | + | − | − | + | − | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| fclust | *** | *** | *** | *** | *** | *** | *** | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| E | B− | B− | E | C | B− | A+ | D | B− | D | B− | A+ | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 42 d | lm | *** | . | *** | *** | *** | . | *** | . | . | . | . | . | . | . | . | *** | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| − | − | + | + | − | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| fclust | *** | *** | *** | *** | *** | *** | *** | *** | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A+ | A+ | B+ | A+ | B+ | E | C | C | A+ | E | D | A+ | A+ | D | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| priming effect |
7 d | lm | *** | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | *** | . | *** | *** | *** | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| + | + | + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| fclust | *** | *** | *** | *** | *** | *** | *** | *** | *** | *** | *** | *** | *** | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| B− | A+ | D | B− | F | C− | A+ | E | E | B− | A+ | A+ | C− | D | F | A+ | A+ | B− | E | C− | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 42 d | lm | *** | . | *** | . | . | . | . | *** | *** | *** | . | *** | . | . | *** | *** | *** | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| − | + | − | − | − | − | + | − | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| fclust | *** | *** | *** | *** | *** | *** | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A+ | D+ | E | A+ | E | C+ | E | E | D+ | D+ | B | E | B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Fungi | Unclassified | Unknown | Tricholomataceae | Environmental | Glomeraceae | Herpotrichiellaceae | Mortierellaceae | Tubeufiaceae | Phaeosphaeriaceae | Myxotrichaceae | Trichocomaceae | Chaetomiaceae | Coniophoraceae | Teratosphaeriaceae | Davidiellaceae | Nectriaceae | Strophariaceae | Endogonaceae | Lyophyllaceae | Hypocreaceae | Pleurotaceae | Bulgariaceae | Mycosphaerellaceae | Entolomataceae | Pyronemataceae | Pluteaceae | Boletaceae | Helotiaceae | Tremellaceae | Coniochaetaceae | Cordycipitaceae | Hyaloscyphaceae | Clavicipitaceae | Pleosporaceae | Lycoperdaceae | Gomphaceae | Marasmiaceae | Corticiaceae | Monoblepharidaceae | Stereaceae | Plectosphaerellaceae | Magnaporthaceae | Ajellomycetaceae | Didymellaceae | Agaricaceae | Massariaceae | Agyriaceae | Orbiliaceae | Pezizaceae | Ophiocordycipitaceae | Montagnulaceae | Rhizophydiaceae | Trechisporaceae | Ophiostomataceae | Kickxellaceae | Bionectriaceae | Sarcosomataceae | Ambisporaceae | Ustilaginaceae | Auriculariaceae | |||
| soil | 7 d | lm | . | . | . | . | . | . | . | . | *** | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| fclust | . | . | . | . | . | . | . | . | *** | *** | . | . | . | . | . | . | *** | *** | *** | . | *** | . | . | *** | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| F | F | F | F | F | F | F | F | A+ | A+ | D | F | F | F | E | D | C | B+ | A+ | F | B+ | F | E | B+ | E | D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 42 d | lm | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | *** | *** | *** | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| + | + | + | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| fclust | . | *** | *** | . | . | *** | . | . | . | *** | . | *** | *** | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| E | D− | B+ | E | E | A+ | C | E | C | A+ | E | B+ | D− | C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| straw | 7 d | lm | . | . | . | . | . | *** | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| − | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| fclust | *** | *** | . | *** | *** | *** | . | . | *** | . | *** | . | . | . | *** | . | . | . | . | . | . | *** | *** | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| B− | C+ | F | B− | C+ | B− | F | D | A+ | D | C+ | F | F | E | B− | D | F | F | E | F | F | A+ | A+ | F | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 42 d | lm | *** | . | . | . | *** | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| − | − | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| fclust | *** | . | *** | *** | *** | *** | . | *** | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A− | B | A− | A− | A− | A− | B | A− | B | B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| priming effect |
7d | lm | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | . | *** | . | . | *** | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| fclust | *** | . | *** | *** | . | *** | . | . | *** | . | . | *** | *** | *** | . | *** | *** | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A+ | E | A+ | A+ | E | A+ | C | C | A+ | C | E | D− | B | D− | C | B− | B− | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 42 d | lm | . | . | . | . | . | . | . | . | *** | . | . | . | . | . | . | . | *** | . | . | . | . | . | *** | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| + | − | − | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| fclust | *** | . | . | . | . | . | . | *** | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| B+ | A | C | D | A | D | A | B+ |
A midpoint (·) indicates that the family was identified as key by the variable selection procedure and (***) indicates that the significance was at p < 0.001. Cells are colored depending on if the family is identified as key by (pink) both the multi-linear and clustering models, (yellow) the multi-linear model alone, (green) the clustering model alone, (blue) as negligible by both the multi-linear and clustering models, or (white) as not analyzed by the multi-linear model. The sign indicates the direction, positive (+) or negative (−), of the family’s contribution to SOM decomposition activity. For clustering analysis, the letter (A to F) indicates the most significant functional group to which a class of relative abundance of the family was assigned. Families were ranked from left to right in descending order of relative abundance.