Table 3 .

Shared multi-tissue eQTLs between GTEx and TCGA

Number of tissues		Multi-tissue eQTLs in GTEx and TCGA			Shared multi-tissue eQTLs
GTEx	TCGA	GTEx eQTLs	TCGA eQTL3	TCGA eQTL5	GTEx eQTL3	GTEx eQTL5	eQTL3 eQTL5	GTEx eQTL3 eQTL5
4	2	1 218 661	36 693	23 354	14 581	13 931	18 408	11 924
8	3	673 314	18 081	11 982	8128	7400	10 180	6679
12	4	449 072	10 884	7897	5242	4904	6767	4418
16	5	315 284	7189	5703	3605	3566	4824	3134
20	6	233 277	4864	4183	2521	2605	3339	2133
24	7	174 470	3234	3082	1675	1918	2298	1422
28	8	127 329	2003	2320	1057	1438	1479	887
32	9	91 346	1224	1798	550	1032	919	474
36	10	67 229	683	1015	264	502	478	218
40	11	45 594	289	599	88	340	193	80
44	12	18 593	79	204	19	63	60	19