Table 2.

Significant correlations between gut microbial phyla, alpha-diversity, total bacterial abundance, barrier integrity, and gene expression.

	Cldn3	Muc2	ZO1	Ki67	Lyz1	Shannon	Chao1	16S total abundance	Barrier integrity (%)
	Pearson R (p-value)
Proteobacteria	−0.555 (p = 0.032)	0.360 (p = 0.188)	0.853 (p = 0.00005)	−0.162 (p = 0.565)	−0.564 (p = 0.028)	−0.864 (p = 0.00003)	−0.928 (p = 5.92e-7)	−0.947 (p = 2.858e-7)	−0.715 (p = 0.003)
Bacteroidetes	0.669 (p = 0.006)	−0.234 (p = 0.401)	−0.836 (p = 0.0001)	−0.042 (p = 0.881)	0.581 (p = 0.023)	0.859 (p = 0.00004)	0.898 (p = 0.00005)	0.857 (p = 0.00008)	0.817 (p = 0.0001)
Verrucomicrobia	−0.205 (p = 0.465)	−0.572 (p = 0.026)	−0.328 (p = 0.233)	0.783 (p = 0.001)	−0.037 (p = 0.895)	0.222 (p = 0.425)	0.409 (p = 0.129)	0.504 (p = 0.066)	−0.046 (p = 0.870)
Epsilonbacteraeota	0.314 (p = 0.254)	−0.070 (p = 0.805)	−0.569 (p = 0.026)	−0.319 (p = 0.247)	0.173 (p = 0.537)	0.626 (p = 0.012)	0.621 (p = 0.013)	0.527 (p = 0.052)	0.671 (p = 0.006)
Deferribacteres	0.497 (p = 0.059)	−0.001 (p = 0.997)	−0.549 (p = 0.033)	−0.322 (p = 0242)	0.273 (p = 0.324)	0.726 (p = 0.002)	0.716 (p = 0.002)	0.547 (p = 0.042)	0.783 (p = 0.001)
Patescibacteria	0.817 (p = 0.0002)	0.214 (p = 0.444)	−0.381 (p = 0.161)	−0.447 (p = 0.095)	0.634 (p = 0.011)	0.653 (p = 0.008)	0.542 (p = 0.036)	0.434 (p = 0.120)	0.734 (p = 0.002)
Shannon	0.741 (p = 0.002)	−0.241 (p = 0387)	−0.795 (p = 0.0003)	−0.228 (p = 0.414)	0.672 (p = 0.006)	1.000	0.951 (p = 5.701e-8)	0.852 (p = 0.0001)	0.929 (p = 5.506e-7)
Chao1	0.598 (p = 0.019)	−0.375 (p = 0.168)	−0.799 (p = 0.0003)	−0.056 (p = 0.844)	0.532 (p = 0.041)	0.951 (p = 5.701e-8)	1.000	0.878 (p = 0.00003)	0.836 (p = 0.0001)
16S total abundance	0.563 (p = 0.036)	−0.272 (p = 0.347)	−0.834 (p = 0.0002)	0.126 (p = 0.667)	0.586 (p = 0.028)	0.852 (p = 0.0001)	0.878 (p = 0.00003)	1.000	0.739 (p = 0.003)