TABLE 6.
Analysis of the relationship between the frequency of the genes sea, seb, sec, sed and tsst-1 and the MLST-CC/ST and spa type
| MLST-CC/ST | Spa type | Sea (n = 60) | Seb (n = 2) | Sec (n = 65) | Sed (n = 24) | Tsst-1 (n = 8) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| CC7 | 16 (26.67) | 13 (20) | 6 (24,93) | |||
| t091 | 13 (21.67) | 11 (16.92) | 5 (20.83) | |||
| t1743 | 2 (3.33) | 2 (3.08) | ||||
| t1685 | 1 (1.67) | 1 (4.17) | ||||
| CC45 | 8 (13.35) | 16 (24.63) | 3 (12.51) | 2 (25) | ||
| t015 | 3 (5) | 9 (13.85) | ||||
| t2301 | 1 (1.54) | |||||
| t050 | 1 (1.67) | |||||
| t095 | 1 (1.67) | 2 (3.08) | 1 (4.17) | |||
| t282 | 1 (1.67) | 1 (4.17) | ||||
| t880 | 1 (1.67) | 1 (1.54) | 1 (4.17) | |||
| t2223 | 2 (3.08) | 2 (25) | ||||
| t230 | 1 (1.67) | 1 (1.54) | ||||
| CC15 | ||||||
| t084 | 3 (5) | 5 (7.69) | 3 (12.5) | |||
| CC97 | 8 (13.33) | 5 (7.7) | ||||
| t12375 | 3 (5) | 2 (3.08) | ||||
| t267 | 2 (3.33) | |||||
| t359 | 1 (1.67) | 1 (1.54) | ||||
| t521 | 2 (3.33) | 2 (3.08) | ||||
| CC30 | 7 (11.67) | 1 (1.54) | 1 (4.17) | 6 (75) | ||
| t012 | 1 (1.67) | 1 (1.54) | 2 (25) | |||
| t018 | 2 (3.33) | 1 (4.17) | ||||
| t021 | 1 (1.67) | 1 (12.5) | ||||
| t037 | 1 (1.67) | 1 (12.5) | ||||
| t18582 | 2 (3.33) | 2 (25) | ||||
| CC22 | ||||||
| t005 | 2 (3.08) | 2 (8.33) | ||||
| CC12 | 3 (8.33) | 1 (50) | 6 (9.23) | 2 (8.33) | ||
| t156 | 2 (3.33) | 5 (7.69) | 2 (8.33) | |||
| t160 | 1 (1.67) | 1 (50) | 1 (1.54) | |||
| CC8 | 5 (8.33) | 3 (12.5) | ||||
| t024 | 3 (5) | 3 (12.5) | ||||
| t008 | 2 (3.33) | |||||
| CC72 | ||||||
| t537 | 5 (7.69) | |||||
| CC1 | ||||||
| t127 | 2 (3.33) | 2 (3.08) | ||||
| CC88 | ||||||
| t1814 | 1 (1.67) | 1 (1.54) | ||||
| CC59 | ||||||
| t437 | 1 (1.67) | 1 (50) | 1 (1.54) | |||
| CC398 | ||||||
| t1255 | 2 (3.33) | 2 (8.33) | ||||
| CC9 | ||||||
| t209 | 1 (1.54) | |||||
| CC10 | ||||||
| t864 | 1 (1.67) | 1 (1.54) | ||||
| CC101 | ||||||
| t056 | 1 (1.67) | 1 (1.54) | ||||
| ST7425 | ||||||
| t1312 | 2 (3.33) | 2 (3.08) | 2 (8.33) |