TABLE 2.

The gene expression levels (by FPKM values) of virulence-associated proteins in three T. gondii strains obtained by RNA-sequencing

	T. gondii genotype I			T. gondii genotype II			T. gondii genotype III
Proteins	RH_1	RH_2	RH_3	PRU_1	PRU_2	PRU_3	VEG_1	VEG_2	VEG_3
MIC1	742,20	691,76	586,63	406,09	397,44	459,82	414,23	407,55	552,20
MIC2	1612,68	1829,70	1689,79	864,34	887,59	1210,56	999,26	1008,88	1123,36
MIC3	393,37	363,63	296,67	71.85	60.82	51.75	73.43	69.58	78.76
MIC4	485,71	503,78	387,07	191,61	189,69	266,26	235,93	222,00	239,04
MIC5	1877,62	2289,03	1992,45	743,75	747,82	858,77	938,54	826,90	1068,63
MIC6	458,09	486,41	431,34	293,88	305,28	382,36	266,86	270,98	308,66
MIC7	380,12	314,92	293,98	290,84	284,93	290,44	274,17	274,55	300,14
MIC8	283,79	275,72	245,90	250,43	249,31	304,99	323,68	318,08	360,52
MIC9	139,63	95.59	87.13	108,07	87.43	63.89	79.14	71.70	74.98
MIC10	1595,01	2485,11	1748,25	1034,88	1097,62	1487,47	1262,61	1122,16	1380,74
MIC11	1135,84	1297,94	1034,08	712,62	652,48	770,41	595,76	544,44	614,00
MIC12	50.20	33.84	36.42	59.37	54.89	48.59	27.40	29.71	28.72
AMA1	1100,79	900,04	774,68	740,93	706,45	850,24	767,37	714,62	771,94
ROP1	105,24	137,46	109,72	152,89	166,73	165,73	206,38	194,89	387,66
ROP4	37.16	35.80	38.90	44.15	45.12	53.56	157,05	154,52	310,25
ROP5	53.06	71.43	56.25	75.05	80.65	94.89	78.73	77.15	135,99
ROP7	114,28	113,79	111,86	139,60	156,77	167,39	374,36	365,67	680,37
ROP8	154,55	153,87	115,43	71.84	75.59	48.30	112,77	104,30	191,24
ROP9	125,27	157,48	137,17	141,42	141,90	149,76	112,80	108,62	155,01
ROP16	34.73	31.01	26.72	28.45	29.70	35.63	23.61	23.28	46.55
ROP18	46.72	76.82	59.65	47.45	55.19	54.06	0,02	0,14	0,28
GRA1	5856,57	8982,31	7109,92	3993,54	4038,92	4835,14	3911,45	3553,69	4749,21
GRA2	2863,13	4220,26	3288,61	2692,43	2615,24	2822,64	2568,24	2172,37	2874,98
GRA3	605,98	1191,87	1032,24	537,74	495,44	649,20	500,09	456,57	451,86
GRA4	565,55	655,76	546,27	560,72	532,24	682,80	660,92	617,55	770,56
GRA5	2742,94	4505,21	3322,54	1139,32	1151,59	1406,29	1620,10	1469,45	2189,75
GRA6	588,98	959,83	788,02	739,51	764,11	1032,38	944,93	885,45	1087,05
GRA7	1128,41	1177,73	958,94	870,25	857,30	1031,65	694,87	642,50	751,05
GRA8	419,79	747,90	592,12	460,01	476,01	686,78	378,49	346,22	433,64
GRA9	131,61	106,49	108,17	214,63	200,35	193,16	302,57	290,22	209,33
SAG2	8,70	20.59	18.03	1,60	1,27	1,22	1,87	1,81	1,73
PKG	24.10	24.42	26.32	20.39	21.49	21.30	23.06	23.34	22.64
CDPK1	111,68	98.80	92.93	67.91	73.07	78.57	69.83	69.67	84.58