TABLE 4.
Specificity evaluation of multiplex HRM method
| No. | Sample | No. of samples | Result with assayb: |
|||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Assay 1 | Assay 2 | Assay 3 | Assay 4 | |||
| 1 | Adenovirus | 2 | − | − | − | − |
| 2 | Human enterovirus | 2 | − | − | − | − |
| 3 | Human coronavirus OC43 | 2 | − | − | − | − |
| 4 | Human coronavirus 229E | 2 | − | − | − | − |
| 5 | Human coronavirus NL63 | 2 | − | − | − | − |
| 6 | Human coronavirus HKU1 | 2 | − | − | − | − |
| 7 | Middle East respiratory syndrome CoV | 1 | − | − | − | − |
| 8 | Human bocavirus 1 | 2 | − | − | − | − |
| 9 | Human metapneumovirus A | 2 | − | − | − | − |
| 10 | Human metapneumovirus B | 2 | − | − | − | − |
| 11 | Human rhinovirus | 2 | − | − | − | − |
| 12 | Influenza A virus H1N1 | 3 | − | − | − | − |
| 13 | Influenza A virus H3N2 | 2 | − | − | − | − |
| 14 | Influenza B virus | 2 | − | − | − | − |
| 15 | Parainfluenza virus 1 | 2 | − | − | − | − |
| 16 | Parainfluenza virus 2 | 2 | − | − | − | − |
| 17 | Parainfluenza virus 3 | 2 | − | − | − | − |
| 18 | Parainfluenza virus 4 | 2 | − | − | − | − |
| 19 | Respiratory syncytial virus A | 2 | − | − | − | − |
| 20 | Respiratory syncytial virus B | 2 | − | − | − | − |
| 21 | SARS-like coronavirusa | 1 | − | − | − | − |
| 22 | Legionella pneumophila | 2 | − | − | − | − |
| 23 | Bordetella pertussis | 2 | − | − | − | − |
| 24 | Mycoplasma pneumoniae | 2 | − | − | − | − |
| 25 | Chlamydophila pneumoniae | 1 | − | − | − | − |
| 26 | Haemophilus influenzae | 2 | − | − | − | − |
| 27 | Staphylococcus aureus | 2 | − | − | − | − |
| 28 | Moraxella catarrhalis | 1 | − | − | − | − |
| 29 | Klebsiella pneumoniae | 3 | − | − | − | − |
| 30 | Pseudomonas aeruginosa | 2 | − | − | − | − |
| 31 | Acinetobacter baumannii | 2 | − | − | − | − |
| 32 | Streptococcus pneumoniae | 1 | − | − | − | − |
| 33 | Escherichia coli | 2 | − | − | − | − |
| 34 | Neisseria meningitidis | 1 | − | − | − | − |
a
This sample was collected from a bat.
b
Assays 1 to 4 are the variant detection assays of the multiplex HRM method. +, positive detection; −, negative detection.