Table 1.

HCMV and cellular host factors controlling latency in HPCs.

Gene region	HPC Source					Cell Line				Reference
	Embryonic	Fetal liver	Cord blood	Bone marrow	mPB	Kasumi-3	KG-1	RS4;11	in vivo
Viral Genes
UL7										Crawford et al., 2018
										Hancock et al., 2021
										Crawford et al., 2021
UL111A										Poole et al., 2014
UL122/UL123
promoters										Collins-McMillen et al., 2019
										Hale et al., 2020
IE1										Saffert et al., 2010
IE1x4										Tarrant-Elorza et al., 2014
UL133										Umashankar et al., 2011
										Petrucelli et al., 2012
UL135										Umashankar et al., 2014
										Buehler et al., 2016
										Rak et al., 2018
UL136										Caviness et al., 2014
										Caviness et al., 2016
UL138										Petrucelli et al., 2009
										Umashankar et al., 2011
										Petrucelli et al., 2012
										Lee et al., 2015; Lee et al., 2016
										Buehler et al., 2016
US28										Humby and O’Connor, 2015
										Crawford et al., 2019
										Krishna et al., 2019; Krishna et al., 2020; Krishna et al., 2022
LUNA										Poole et al., 2018
Viral miRNAs
miR-US5-1										Hancock et al., 2021
miR-US5-2										Hancock et al., 2020a; Hancock et al., 2020b
miR-US22										Mikell et al., 2019
miR-US25-1										Diggins et al., 2021a
miR-UL22A										Hancock et al., 2020a
miR-UL112										Hancock et al., 2021
miR-UL148D										Lau et al., 2016
										Pan et al., 2016
Cellular Genes
AP-1										Krishna et al., 2020
EGFR										Kim et al., 2017
										Rak et al., 2018
EGR-1										Buehler et al., 2016
										Buehler et al., 2019
										Mikell et al., 2019
FOXO										Hale et al., 2020
IFI16										Elder et al., 2019
IL-10										Poole et al., 2015
KAP-1										Rauwel et al., 2015
miRNAs										Poole et al., 2011
SAMHD1										Kim et al., 2019
TGF-β										Hancock et al., 2020a
TNF-α										Forte et al., 2018
Transcriptomic Profiling
Bulk										Goodrum et al., 2002; Goodrum et al., 2007
										Rossetto et al., 2013
										Cheng et al., 2017
										Forte et al., 2021
Single Cell										Shnayder et al., 2018
miRNAs										Lau et al., 2016
										Mikell et al., 2019

[References for Table 1: (Goodrum et al., 2002; Goodrum et al., 2007; Petrucelli et al., 2009; Poole et al., 2011; Umashankar et al., 2011; Petrucelli et al., 2012; Rossetto et al., 2013; Caviness et al., 2014; Poole et al., 2014; Tarrant-Elorza et al., 2014; Umashankar et al., 2014; Humby and O'Connor, 2015; Lee et al., 2015; Poole et al., 2015; Rauwel et al., 2015; Buehler et al., 2016; Lau et al., 2016; Lee et al., 2016; Pan et al., 2016; Cheng et al., 2017; Kim et al., 2017; Krishna et al., 2017; Crawford et al., 2018; Forte et al., 2018; Poole et al., 2018; Rak et al., 2018; Shnayder et al., 2018; Buehler et al., 2019; Collins-McMillen et al., 2019; Crawford et al., 2019; Elder et al., 2019; Kim et al., 2019; Krishna et al., 2019; Mikell et al., 2019; Hale et al., 2020; Hancock et al., 2020a; Krishna et al., 2020; Crawford et al., 2021; Diggins et al., 2021a; Forte et al., 2021; Hancock et al., 2021; Krishna et al., 2022)].