表 1. Cancer prognosis models based on deep learning.
基于深度学习的癌症预后模型
| 文献 | 癌症类型 | 数据类型 | 网络架构 | 模型性能 | 预后临床终点 |
| 注:DNN:深度神经网络(deep neural networks);CNN:卷积神经网络(convolutional neural network);VGG:视觉几何群网络(visual geometry group network);LSTM:长短时记忆网络(long short-term memory);CT:计算机断层扫描(computed tomography);MRI:磁共振成像(magnetic resonance imaging);PET:正电子发射计算机断层显像(positron emission tomography);RNA:核糖核酸(ribonucleic acid);“—”:文献没有提及相应指标 | |||||
| Sun 等(2018) | 乳腺癌 | 临床、基因、
拷贝数变异 |
DNN | ACC:82.6%;AUC:0.845 | 5 年生存 |
| Lai 等(2020) | 非小细胞肺癌 | 基因、临床数据 | DNN | ACC:75.4%;AUC:0.816 | 5 年生存 |
| Lee 等(2020) | 非小细胞肺癌 | 临床、病理数据 | DNN | C-index:0.731;
AUC:0.768 |
术后无复发生存 |
| Zhu 等(2017) | 肺癌 | 病理图像 | CNN | C-index:0.629 | 总体生存 |
| Mobadersany 等(2018) | 脑胶质瘤 | 组织切片、
基因标志物 |
VGG-19 | C-index:0.754 | 总体生存 |
| Nagpal 等(2018) | 前列腺癌 | 组织切片 | Inception V3 | ACC:70.0% | 无进展间隔、复发 |
| Paul 等(2016) | 非小细胞肺癌 | CT 图像 | CNN_F | ACC:90.0%;AUC:0.935 | 总体生存 |
| Hosny 等(2018) | 非小细胞肺癌 | CT 图像 | 3D-CNN | AUC:0.700 | 2 年总体生存 |
| Diamant 等(2019) | 头颈部鳞状细胞癌 | CT 图像 | CNN | AUC:0.880 | 远处转移 |
| Lao 等(2017) | 脑胶质母细胞瘤 | MRI 图像、
临床数据 |
CNN_S | C-index:0.739 | 1 年、2 年、3 年生存 |
| Han 等(2020) | 高级别胶质瘤 | MRI 图像 | VGG-19 | — | 生存 |
| Tang 等(2020) | 胶质母细胞瘤 | MRI 图像 | CNN | — | 总体生存 |
| Bizzego 等(2018) | 头颈部鳞状细胞癌 | CT、PET 图像 | 3D-CNN | ACC:94.0%;SEN:67.0%;SPE:91.0%;MCC:0.748 | 局部复发 |
| Nie 等(2019) | 神经胶质瘤 | MRI 图像、
人口学特征 |
3D-CNN | ACC:90.7% | 生存 |
| Bychkov 等(2018) | 结直肠癌 | 组织切片 | VGG-16 +LSTM | AUC:0.690 | 5 年疾病特异性生存 |
| Zhang 等(2018) | 乳腺癌 | 基因数据 | Autoencoder | ACC:77.0%;SEN:84.0%;SPE:55.0%;MCC:0.320;AUC:0.740 | 5 年内远处转移 |
| Maggio 等(2018) | 神经母细胞瘤 | 转录组学 | Autoencoder | — | 5 年内的无事件生存、
总体生存 |
| Chaudhary 等(2018) | 肝癌 | RNA、miRNA 测序、
甲基化数据 |
Autoencoder | C-index:0.740 | 生存亚群分类 |
| Wong 等(2019) | 脑胶质母细胞瘤 | 基因数据 | DBN | C-index:0.690 | 生存 |
| Xie 等(2019) | 14 种癌症 | 多组学数据、
临床数据 |
DBN | — | 生存 |