Skip to main content
. 2019 Dec 19;11(1):17–33. doi: 10.1007/s12672-019-00372-3

Table 2.

The p values of the paired t-test analysis for each pair of molecules among the top 20 molecules ranked by applying the random forest to all 181 molecules

SCF MAD HOMOLOG 5 PPY FASLG FGF-5 CXCL1 MMP-10 XPNPEP2 ESM-1 PHOSPHORIC ACID PD-L1 EPHA2 FLT3L 4E-BP1 TRAIL MCP-1 TLR3 CD27 FGF-BP1 HK14
SCF 0 0.6963 0.0017 0.0006 0.0004 0.0023 0.3286 0.361 0.0003 0.0859 0.0333 0.0073 0.0056 0.1307 0.1309 0.0148 0.0432 0.0116 0.1303 0.1215
MAD HOMOLOG 5 0.6963 0 0.0038 0.0014 0.0013 0.0153 0.6643 0.5633 0.0006 0.1622 0.146 0.0305 0.0442 0.2792 0.5298 0.0506 0.0586 0.0252 0.2913 0.2387
PPY 0.0017 0.0038 0 0.9554 0.7183 0.4656 0.0033 0.0054 0.8852 0.0413 0.0721 0.1935 0.2713 0.0397 0.0096 0.1833 0.2008 0.2943 0.0166 0.0205
FASLG 0.0006 0.0014 0.9554 0 0.6618 0.4225 0.0018 0.0015 0.9137 0.0376 0.0732 0.142 0.2782 0.0277 0.0039 0.166 0.1646 0.2553 0.0112 0.0051
FGF-5 0.0004 0.0013 0.7183 0.6618 0 0.3008 0.002 0.0018 0.6315 0.0209 0.0378 0.1085 0.1423 0.0145 0.0033 0.0857 0.0983 0.1787 0.01 0.0147
CXCL1 0.0023 0.0153 0.4656 0.4225 0.3008 0 0.0115 0.0376 0.5516 0.2144 0.2567 0.5558 0.6492 0.1072 0.0076 0.4841 0.5033 0.691 0.0583 0.0429
MMP-10 0.3286 0.6643 0.0033 0.0018 0.002 0.0115 0 0.9115 0.0073 0.3345 0.1225 0.0486 0.0419 0.5293 0.8731 0.0542 0.1309 0.0226 0.5308 0.4234
XPNPEP2 0.361 0.5633 0.0054 0.0015 0.0018 0.0376 0.9115 0 0.0125 0.3469 0.2814 0.1044 0.0921 0.5733 0.9708 0.1341 0.1636 0.0719 0.6209 0.519
ESM-1 0.0003 0.0006 0.8852 0.9137 0.6315 0.5516 0.0073 0.0125 0 0.0593 0.114 0.1401 0.3336 0.0335 0.0061 0.2512 0.2426 0.3007 0.013 0.0129
PHOSPHORIC ACID 0.0859 0.1622 0.0413 0.0376 0.0209 0.2144 0.3345 0.3469 0.0593 0 0.829 0.4717 0.446 0.7561 0.422 0.517 0.5868 0.3887 0.6436 0.762
PD-L1 0.0333 0.146 0.0721 0.0732 0.0378 0.2567 0.1225 0.2814 0.114 0.829 0 0.5517 0.4038 0.5749 0.1934 0.5838 0.7439 0.415 0.5413 0.547
EPHA2 0.0073 0.0305 0.1935 0.142 0.1085 0.5558 0.0486 0.1044 0.1401 0.4717 0.5517 0 0.8913 0.3318 0.0648 0.9749 0.9147 0.7529 0.2438 0.2666
FLT3L 0.0056 0.0442 0.2713 0.2782 0.1423 0.6492 0.0419 0.0921 0.3336 0.446 0.4038 0.8913 0 0.2581 0.0333 0.8507 0.8279 0.94 0.2181 0.2617
4E-BP1 0.1307 0.2792 0.0397 0.0277 0.0145 0.1072 0.5293 0.5733 0.0335 0.7561 0.5749 0.3318 0.2581 0 0.5541 0.1918 0.4236 0.2596 0.924 0.9861
TRAIL 0.1309 0.5298 0.0096 0.0039 0.0033 0.0076 0.8731 0.9708 0.0061 0.422 0.1934 0.0648 0.0333 0.5541 0 0.066 0.1962 0.0647 0.6469 0.5674
MCP-1 0.0148 0.0506 0.1833 0.166 0.0857 0.4841 0.0542 0.1341 0.2512 0.517 0.5838 0.9749 0.8507 0.1918 0.066 0 0.9421 0.8181 0.2741 0.3109
TLR3 0.0432 0.0586 0.2008 0.1646 0.0983 0.5033 0.1309 0.1636 0.2426 0.5868 0.7439 0.9147 0.8279 0.4236 0.1962 0.9421 0 0.7566 0.3418 0.3587
CD27 0.0116 0.0252 0.2943 0.2553 0.1787 0.691 0.0226 0.0719 0.3007 0.3887 0.415 0.7529 0.94 0.2596 0.0647 0.8181 0.7566 0 0.1532 0.1312
FGF-BP1 0.1303 0.2913 0.0166 0.0112 0.01 0.0583 0.5308 0.6209 0.013 0.6436 0.5413 0.2438 0.2181 0.924 0.6469 0.2741 0.3418 0.1532 0 0.8822
HK14 0.1215 0.2387 0.0205 0.0051 0.0147 0.0429 0.4234 0.519 0.0129 0.762 0.547 0.2666 0.2617 0.9861 0.5674 0.3109 0.3587 0.1312 0.8822 0

The paired t test assesses the pairwise dependencies of the most discriminative 20 molecules. Pairs with p > 0.05 show strong dependency within that pair