Table 1.
Real-time PCR for 758, 1123, and 1380 SNPs and their probes. SNP: single nucleotide polymorphisms.
| SNPs | Primers | Sequences |
|---|---|---|
| 758 | SNP_758_F SNP_758_R Probe_G1 Probe_G3 |
5′-GGTTTATGTTGTTGAAGTTGATTGTTTTGT-3′ 5′-AAAACCTAACAACACCTAAATACTCTCAAAGAA-3′ VIC-5′-TGTTGGTATGTAGTGGTGAT-3′ FAM-5′-TGTTGGTATGTACTGGTGAT-3′ |
| 1123 | SNP_1123_F SNP_1123_R Probe_G1 Probe_G3 |
5′-CTGGTGTTTGGTTTGTTATGCGTTA-3′ 5′-CCAGTAATAAAAACCGTCAACAAAAGCA-3′ VIC-5′-CGACCTACCAAAATG-3′ FAM-5′-CCGACCTACTAAAATG-3′ |
| 1380 | SNP_1380_F SNP_1380_R Probe_G1 Probe_G3 |
5′-GTGATGTGATGAGCGGTAGGG-3′ 5′-CACGACCCATACAAAACAGACCTAT-3′ VIC-5′-CAGGCTAGGAATTGT-3′ FAM-5′-CAGGCTAGAAATTGT-3′ |