Table 4.
Molecular docking study of the target compounds with DHFR.
| Compound codes | Binding Affinity (Kcal/mol) | Hydrogen bond | Hydrophobic bond Amino acid | Neutral amino acid | |
|---|---|---|---|---|---|
| Amino acid | Bond length (A˚) | ||||
| 1 | − 8.029 | – | – | TYR A: 167, LEU | |
| A:162, ILEA:10, | |||||
| PHE A:171, ALA | NDP A: | ||||
| A:12, TYR A:179, | 1239, | ||||
| ILE A:13, ILE A: | CP A:61,240 | ||||
| 172, LEU A:45, | |||||
| ALA A:15, TRP | |||||
| A:47, ALA A:12 | |||||
| 2 | − 7.997 | – | – | ALA A:15, CYS A: | |
| 14, TYR A: 179, | |||||
| ALA A:12, ILE A: | NDP A: | ||||
| 172, VAL A: 112, | 1239, CP A: | ||||
| LEU A: 158, ILE | 61,240 | ||||
| A:10, LEU A: 162, | |||||
| CYS A: 170, VAL | |||||
| A:110 | |||||
| 3 | − 6.031 | CP A: 6124 | 2.30 |
ILE A:172, ALA A:12, ILE A:13 |
– |
| TYR A: 11 TYR A:179 |
3.10 2.75 |
||||
| TYR A: 11 | 2.85 | ||||
| Std | − 7.813 | ILE A:13 | 2.93 |
ILE172, ILE188, |
– |
|
ILE A:10, CYS | |||||
| A:182, ALA A: 12, | |||||
| VAL A: 178, TYR A | |||||
| :179, TYR A: 56 | |||||
N.B. “–” indicates no interactions.