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. 2023 Sep 8;13:14808. doi: 10.1038/s41598-023-41668-3

Table 4.

Molecular docking study of the target compounds with DHFR.

Compound codes Binding Affinity (Kcal/mol) Hydrogen bond Hydrophobic bond Amino acid Neutral amino acid
Amino acid Bond length (A˚)
1  − 8.029 TYR A: 167, LEU
A:162, ILEA:10,
PHE A:171, ALA NDP A:
A:12, TYR A:179, 1239,
ILE A:13, ILE A: CP A:61,240
172, LEU A:45,
ALA A:15, TRP
A:47, ALA A:12
2  − 7.997 ALA A:15, CYS A:
14, TYR A: 179,
ALA A:12, ILE A: NDP A:
172, VAL A: 112, 1239, CP A:
LEU A: 158, ILE 61,240
A:10, LEU A: 162,
CYS A: 170, VAL
A:110
3  − 6.031 CP A: 6124 2.30

ILE

A:172,

ALA A:12, ILE A:13

TYR A: 11 TYR A:179

3.10

2.75

TYR A: 11 2.85
Std  − 7.813 ILE A:13 2.93

ILE172,

ILE188,

ILE

A:10,

CYS

A:182, ALA A: 12,
VAL A: 178, TYR A
:179, TYR A: 56

N.B. “” indicates no interactions.