TABLE 2.
Comparative identification and susceptibility to antimicrobial agents of 28 GRE isolated at the University Hospital of Geneva
Patient | Isolate | Organism identified (identification score)a
|
Genotypic identificationb | MIC (mg/liter)c
|
||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
API 20 STREP | Rapid ID 32 STREP | Vitek GPI | P | AM | E | GM | SM | VA | TEI | |||
1 | 1 | E. faecium (2) | E. faecium (2) | E. faecium (1) | E. faecium | 8 | 1 | ≥256 | 16 | 96 | ≥256 | ≥256 |
2 | 2 | E. faecium (2) | E. gallinarum (3) | E. faecium (1) | E. faecium | ≥256 | 16 | ≥256 | 24 | ≥1,024 | ≥256 | 64 |
3 | E. faecium (2) | E. gallinarum (3) | E. faecium (1) | E. faecium | ≥256 | 16 | ≥256 | 24 | ≥1,024 | ≥256 | 64 | |
3 | 4 | E. faecium (2) | E. faecium (3) | E. faecium (1) | E. faecium | ≥256 | 16 | ≥256 | 24 | ≥1,024 | ≥256 | 64 |
5 | E. faecium (2) | E. gallinarum (1) | E. faecium (1) | E. faecium | ≥256 | 16 | ≥256 | 24 | ≥1,024 | ≥256 | 64 | |
4 | 6 | E. faecium (2) | E. faecium (2) | E. faecium (1) | E. faecium | ≥256 | ≥256 | ≥256 | 24 | ≥1,024 | ≥256 | ≥256 |
5 | 7 | E. faecium (2) | E. gallinarum (3) | E. faecium (3) | E. gallinarum | 0.5 | 0.5 | 0.38 | 8 | 32 | 8 | 0.5 |
6 | 8 | E. faecium (2) | E. gallinarum (1) | E. gallinarum (1) | E. gallinarum | 1 | 0.5 | 0.38 | 12 | 48 | 8 | 0.12 |
7 | 9 | E. faecium (2) | E. gallinarum (1) | E. faecium (1) | E. gallinarum | 1 | 0.75 | 2 | 12 | 32 | 4 | 0.25 |
8 | 10 | E. faecalis (1) | E. faecalis (1) | E. faecalis (1) | E. faecalis | 1.5 | 0.25 | ≥256 | ≥1,024 | ≥1,024 | 64 | 4 |
9 | 11 | E. durans (2) | E. hirae (1) | E. hirae (1) | NR | 0.75 | 0.5 | 0.5 | 16 | ≥256 | ≥256 | 0.25 |
10 | 12 | E. faecium (2) | E. gallinarum (3) | E. faecium (1) | E. faecium | 8 | 1.5 | 8 | 24 | 128 | ≥256 | 4 |
11 | 13 | E. faecium (3) | E. faecium (1) | E. faecium (1) | E. faecium | 0.125 | 0.125 | ≥256 | 6 | 48 | ≥256 | 64 |
12 | 14 | E. casseliflavus (3) | E. gallinarum (3) | E. faecium (3) | E. gallinarum | 1 | 0.75 | 1 | 6 | 24 | 16 | 2 |
13 | 15 | E. casseliflavus (3) | E. gallinarum (1) | E. gallinarum (3) | E. gallinarum | 4 | 1.5 | ≥256 | 6 | 16 | ≥256 | 3 |
14 | 16 | E. faecium (2) | E. gallinarum (3) | E. faecium (3) | E. gallinarum | 0.5 | 0.5 | 0.25 | 8 | 32 | 16 | 0.2 |
15 | 17 | E. casseliflavus (1) | E. gallinarum (1) | E. cass/gall (1) | E. gallinarum | 0.75 | 0.75 | 2 | 12 | 32 | 8 | 0.25 |
16 | 18 | E. faecium (2) | E. faecium (1) | E. faecium (1) | E. faecium | 16 | 2 | ≥256 | 24 | 128 | ≥256 | 64 |
17 | 19 | E. faecium (2) | E. faecium (3) | E. faecium (1) | E. faecium | ≥256 | 24 | ≥256 | 24 | ≥1,024 | ≥256 | 64 |
20 | E. faecium (2) | E. faecium (1) | E. faecium (1) | E. faecium | ≥256 | 24 | ≥256 | 24 | ≥1,024 | ≥256 | 64 | |
21 | E. faecalis (1) | E. faecalis (1) | E. faecalis (1) | E. faecalis | 1.5 | 0.38 | ≥256 | 8 | ≥1,024 | ≥256 | 64 | |
18 | 22 | E. faecium (2) | E. faecium (3) | E. faecium (1) | E. faecium | ≥256 | 24 | ≥256 | 24 | ≥1,024 | ≥256 | 64 |
23 | E. faecalis (1) | E. faecalis (1) | E. faecalis (1) | E. faecalis | 1.5 | 0.25 | ≥256 | 24 | ≥1,024 | ≥256 | 64 | |
24 | E. faecalis (1) | E. faecalis (1) | E. faecalis (1) | E. faecalis | 1.5 | 0.25 | ≥256 | 24 | ≥1,024 | ≥256 | 64 | |
25 | E. faecium (2) | E. faecium (1) | E. faecium (1) | E. faecium | ≥256 | 4 | ≥256 | 24 | ≥1,024 | ≥256 | 64 | |
19 | 26 | E. faecium (2) | E. faecium (1) | E. faecium (1) | E. faecium | ≥256 | 24 | ≥256 | 16 | ≥1,024 | 32 | 0.5 |
27 | E. casseliflavus (3) | E. gallinarum (1) | E. cass/gall (3) | E. gallinarum | 2 | 1 | ≥256 | 16 | ≥1,024 | 64 | 2 | |
28 | E. faecium (2) | E. faecium (1) | E. faecium (1) | E. faecium | ≥256 | 24 | ≥256 | 16 | ≥1,024 | 32 | 0.5 |
Identification scores of phenotypic identifications: 1, excellent or very good identification; 2, good identification; 3, uncertain identification to the species level. E. cass/gall, E. casseliflavus/gallinarum.
NR, no result obtained.
P, penicillin; AM, ampicillin; E, erythromycin; GM, gentamicin; SM, streptomycin; VA, vancomycin; TEI, teicoplanin.