Table 6. Interactions of the top 10 binding affinity phytoconstituents with PPAR-α.
Ligand | Binding affinity (Kcal/mole) | Ligand-macromolecule interactions |
---|---|---|
Bezafibrate (control) | -7.6 | MET A:220*, CYS A:276*, TYR A:314*, ILE A:317*, PHE A:318*, LEU A:321*, VAL A:324*, LEU A:331* |
C_8 | -8.7 | GLU A:286, MET A:220*, VAL A:324*, TYR A:334 |
C_26 | -8.6 | TYR A:334, THR A:283, THR A:279, MET A:320 |
C_27 | -8.5 | SER A:323, MET A:220*, VAL A:332, TYR A:334, LEU A:321*, VAL A:324*, TYR A:214, THR A:283 |
C_48 | -8.5 | THR A:283, TYR A:334, THR A:279, VAL A:324*, MET A:320 |
C_50 | -8.4 | TYR A:334, THR A:279, VAL A:324*, MET A:320 |
C_54 | -8.4 | THR A:283, TYR A:214, VAL A:324*, MET A:320 |
C_15 | -8.3 | THR A:283, GLU A:286, MET A:320, LEU A:321*, CYS A:276*, MET A:220*, TYR A:334 |
C_44 | -8.3 | TYR A:334, TYR A:214, MET A:220*, THR A:279, MET A:320, VAL A:324* |
C_51 | -8.3 | THR A:283, GLU A:286, THR A:279, LEU A:321*, ASN A:219, MET A:220* |
C_31 | -8.2 | THR A:283, TYR A:334, GLU A:286, MET A:220*, THR A:279, SER A:323, MET A:320 |
Interactions common with the control*