Table 2.
Case N. | ID code | Species | Lesion | MC | PCR results | CT values | Sequences | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CePV-1 | HV | CeMV | CePV-1 | HV | CeMV | CePV-1 | HV | CeMV | |||||
N = 21/55 | N = 15/55 | N = 1/55 | |||||||||||
1 | CET 566 | S. coeruleoalba | A1 | WF | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
2 | CET 601 | S. frontalis | A1 | TL-C | + | − | − | 22.89 | − | − | ON600451 | − | − |
3 | CET 642 | S. frontalis | A1 | TL-S | + | + | − | 19.24 | 27.19 | − | ON600452 | OM456331 | − |
4 | CET 663 | D. delphis | A1 | TL-O | + | − | − | 20.95 | − | − | ON600453 | − | − |
5 | CET 705 | S. coeruleoalba | A1 | TL-S | + | − | − | 22.09 | − | − | ON600454 | − | − |
6 | CET 748 | S. coeruleoalba | A1 | TL-S | + | − | − | 32.10 | − | − | ON600455 | − | − |
7 | CET 751 | G. griseus | A1 | T-LO | + | − | − | 20.06 | − | − | ON600456 | − | − |
8 | CET 947 | D. delphis | A3 | TL-O | + | + | − | 17.73 | 35.64 | − | ON600460 | OM456332 | − |
9 | CET 951 | S. coeruleoalba | A1 | TL-O | + | + | − | 34.83 | 24.17 | − | ON600461 | OM456333 | − |
10 | CET 959 | S. coeruleoalba | A1 | U | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
11 | CET 969 | G. macrorhynchus | A6 | TL-O | + | − | − | 34.72 | − | − | ON600462 | − | − |
12 | CET 983 | S. coeruleoalba | A3 | TL-C | + | − | − | 35.13 | − | − | ON600463 | − | − |
13 | CET 984 | G. griseus | A4 | TL-O | + | + | − | 36.05 | 36.83 | − | ON600464 | OM456334 | − |
14 | CET 985 | S. coeruleoalba | A1 | TL-S | + | + | − | 37.49 | 34.79 | − | ON600465 | OM456335 | − |
15 | CET 991 | S. coeruleoalba | A3 | R | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
16 | CET 995 | G. macrorhynchus | A1 | TL-O | + | − | − | 22.04 | 38.20 | − | ON600457 | − | − |
17 | CET 1020 | T. truncatus | A1 | TL-O | + | + | − | 13.79 | 35.55 | − | ON600466 | OM456336 | − |
18 | CET 1035 | S. coeruleoalba | A2 | BF | − | − | + | − | − | 22.32 | − | − | ON314830 |
19 | CET 1044 | S. frontalis | A1 | R | − | + | − | − | 29.21 | − | − | OM456337 | − |
20 | CET 1045 | D. delphis | A4 | U | − | + | − | − | 37.60 | − | − | OM456338 | − |
21 | CET 1056 | S. frontalis | A1 | BF | − | + | − | − | 24.75 | − | − | OM456339 | − |
22 | CET 1058 | S. frontalis | A1 | BF | + | + | − | 38.41 | 33.86 | − | ON600467 | OM456340 | − |
23 | CET 1067 | S. frontalis | A3 | Ts | − | + | − | 36.30 | 31.70 | − | − | ON314829 | − |
24 | CET 1069 | S. coeruleoalba | A1 | R | + | − | − | 37.21 | − | − | ON600468 | − | − |
25 | CET 1103 | T. truncatus | A2 | P | − | + | − | − | 35.31 | − | − | OM456341 | − |
26 | CET 1138 | A1 | WF | − | + | − | − | 19.27 | − | − | OM456342 | − | |
A2 | WF | − | + | − | − | 23.90 | − | − | OM456342 | − | |||
S. frontalis | A3 | T | − | + | − | − | 35.80 | − | − | OM456342 | − | ||
A4 | T | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |||
A5 | U | − | + | − | − | 21.22 | − | − | OM456342 | − | |||
27 | CET 1151 | T. truncatus | A1 | TL-S | + | + | − | 23.65 | 32.60 | − | ON600458 | OM456343 | − |
A3 | T | − | + | − | − | − | − | − | OM456344 | − | |||
A4 | U | − | + | − | − | 29.87 | − | − | OM456343 | − | |||
A6 | R | + | + | − | 31.80 | 28.52 | − | ON600458 | OM456344 | − | |||
28 | CET 1152 | A1 | Ts | − | + | − | − | 36.71 | − | − | OM456345 | − | |
A2 | WF | − | + | − | − | 21.37 | − | − | OM456345 | − | |||
S. frontalis | A3 | Ts | − | − | − | − | − | − | − | − | |||
A4 | R | − | + | − | − | 37.34 | − | − | OM456345 | − | |||
A5 | BF | − | + | − | − | 34.68 | − | − | OM456345 | − | |||
29 | CET 1153 | D. delphis | A1 | BF | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
A2 | Ts | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |||
A3 | BF | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |||
30 | CET 1173 | S. frontalis | A1 | TL-O | + | − | − | 15.65 | − | − | ON600459 | − | − |
A2 | TL-O | + | − | − | 18.08 | − | − | ON600459 | − | − | |||
A3 | TL-O | + | − | − | 16.42 | − | − | ON600459 | − | − | |||
A4 | BF | + | − | − | 33.63 | − | − | ON600459 | − | − | |||
A5 | BF | + | − | − | 25.02 | − | − | ON600459 | − | − | |||
A6 | WF | + | − | − | 33.44 | − | − | ON600459 | − | − | |||
A7 | WF | + | − | − | 31.79 | − | − | ON600459 | − | − | |||
A8 | R | + | − | − | 35.37 | − | − | ON600459 | − | − | |||
A9 | WF | + | − | − | 28.49 | − | − | ON600459 | − | − | |||
A10 | WF | + | − | − | 12.01 | − | − | ON600459 | − | − | |||
31 | CET 1181 | A1 | TL-O | + | − | − | 13.11 | − | − | ON600469 | − | − | |
G. macrorhynchus | A2 | TL-C | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ||
A3 | BF | + | − | − | 27.43 | − | − | ON600469 | − | − |
*CT, cycle threshold; CePV-1, cetacean poxvirus; CeMV, cetacean morbillivirus; HV, herpesvirus; MC, macroscopic classification; A1–A10 = skin lesion samples 1–10; BF, black-fringed; R, ring; T, target-like; Ts, tortuous; TL-C, tattoo-like, coalesced; TL-S, tattoo-like, serpiginous; TL-O, tattoo-like, oval-shaped; P, pale; U, ulcerative; WF, white-fringed; −, negative. CePV-1 and HV coinfected samples are indicated in boldface.