Table 2.
Clonal Complexes, MLST, spa types and SE gene profiles of the enterotoxin-positive S. aureus isolates
| CC | MLST | Spa tpye | Enterotoxin genes profile | SCCmec Type (No. of MRSA isolates) |
|---|---|---|---|---|
| CC7 (42) | ST7 (39) | t091 (32) | sep (28) sep-sey (2) sec-sel-sep-tsst (4) | |
| t1943 (4) | sep (4) | |||
| t796 (1) | sep (1) | |||
| t867 (1) | sep (1) | |||
| t20241 (1) | sep (1) | |||
| ST943 (1) | t091 (1) | sep (1) | ||
| ST4367 (1) | t236 (1) | sec-sel-sep-tsst (1) | ||
| ST7063(1) | t091 (1) | sec-sel-sep-tsst (1) | ||
| CC1 (21) | ST1 (12) | t127 (6) | seh (2) sec-sel-seh (3) sec-sel-seh-sek-seq (1) | |
| t114 (3) | sec-sel-sek-seq-seh-tsst (3) | SCCmec V (3) | ||
| t1381 (1) | seh (1) | |||
| t1508 (1) | sea-seb-sek-seq (1) | |||
| t3324 (1) | sea-sec-sel-seh-sek-seq-tsst (1) | SCCmec V (1) | ||
| ST2990 (3) | t091 (3) | sec-sel-sey (3) | ||
| ST1920 (2) | t7589 (1) | seh (1) | ||
| t2457 (1) | seh (1) | |||
| ST493 (1) | t091 (1) | sep (1) | ||
| ST573 (1) | t4938 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | ||
| ST848 (1) | t409 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu -tsst (1) | ||
| ST5881 (1) | t1407 (1) | seh (1) | ||
| CC5 (17) | ST5 (8) | t548 (4) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (3) sed-selj-ser-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-seh (1) | |
| t002 (2) | sec-sel-sed-selj-ser-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (2) | |||
| t311 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | SCCmec V (1) | ||
| t20441 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | |||
| ST965 (5) | t062 (5) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (3) sea-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (2) | ||
| ST950 (1) | t895 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | ||
| ST6427 (1) | t954 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | ||
| ST7563 (1) | t954 (1) | sed-selj-ser-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | ||
| ST2144 (1) | t1107 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | ||
| CC59 (14) | ST59 (14) | t437 (10) | seb-sek-seq-sey (9) sea-seb-sek-seq-sey (1) | SCCmec IVa (7) |
| t3523 (1) | seb-sek-seq-sey (1) | SCCmec IVa (1) | ||
| t3527 (1) | seb-sek-seq-sey (1) | SCCmec IVa (1) | ||
| t3590 (1) | seb-sek-seq-sey (1) | SCCmec IVa (1) | ||
| t16156 (1) | sea-seb-sek-seq (1) | SCCmec IVa (1) | ||
| CC20 (13) | ST2631 (7) | t164 (7) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (7) | |
| ST1281 (4) | t164 (3) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (3) | ||
| t996 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (1) | |||
| ST1921 (1) | t164 (1) | sec-sel-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey-tsst (1) | ||
| ST20 (1) | t3277 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (1) | ||
| CC6 (13) | ST6 (12) | t701 (11) | sea (10) sea-seb (1) | |
| t20424 (1) | sea (1) | |||
| ST1551 (1) | t304 (1) | sea (1) | ||
| CC25 (9) | ST25 (8) | t078 (5) | sec-sel-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (4) sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | |
| t353 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-seh (1) | |||
| t1102 (1) | seb-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | |||
| t20426 (1) | seb- sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | |||
| ST2797 (1) | t081 (1) | seb- sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | ||
| CC72 (8) | ST72 (7) | t148 (4) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (3) sec-sel- sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-tsst (1) | |
| t901 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | |||
| t3092 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | |||
| t3169 (1) | sec-sel-sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-tsst (1) | |||
| ST544 (1) | t126 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (1) | ||
| CC88 (7) | ST88 (7) | t2592 (4) | sep (4) | |
| t3622 (1) | sep (1) | SCCmec II (1) | ||
| t10777 (1) | sep (1) | |||
| t20425 (1) | sep (1) | |||
| CC188 (5) | ST188 (4) | t189 (3) | seb (3) | |
| t2883 (1) | seb (1) | |||
| ST7562 (1) | t189 (1) | seb (1) | ||
| CC8 (3) | ST630 (2) | t377 (1) | sec-sel (1) | |
| t4047 (1) | sey (1) | |||
| ST2416 (1) | t024 (1) | sek-seq-sep (1) | ||
| CC9 (3) | ST9 (2) | t899 (2) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (1) sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu -sep-sey (1) | SCCmec IVb (2) |
| ST2423 (1) | t15045 (1) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (1) | ||
| CC1148 (3) | ST1148 (3) | t16825 (3) | sep (3) | |
| CC22 (2) | ST22 (2) | t309 (2) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (2) | |
| CC12 (1) | ST12 (1) | t213 (1) | sep (1) | |
| CC15 (1) | ST15 (1) | t2413 (1) | sec-sel-tsst (1) | |
| CC101 (1) | ST101 (1) | t2078 (1) | sep (1) | |
| CC121 (1) | ST946 (1) | t20422 (1) | seb- sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu-sey (1) | |
| CC398 (1) | ST398 (1) | t1928 (1) | sec-sel (1) | |
| CC522 (1) | ST522 (1) | t5428 (1) | sec-sel-y-tsst (1) | |
| Singletons (3) | ST672 (3) | t4336 (3) | sec-sel-seg-sei-sem-sen-seo-selu (3) |