Skip to main content
. 1998 Apr;64(4):1180–1187. doi: 10.1128/aem.64.4.1180-1187.1998

TABLE 4.

Genetic distances between strains calculated with AFLP and RAPD data

Strain Genetic distancesa
1321 1427st 1920 2212 TE951 UCRD JN16-5 JN20-1 JN5nb 1657 1637 1740 1738 2744 JN8-5 JN8-10 1726 1392 1777 1620 1727 2440 2346 1573 2215 1390 2107
1321 0.065 0.094 0.235 0.111 0.097 0.097 0.062 0.048 0.207 0.745 0.312 0.233 0.25 0.219 0.188 0.167 0.729 0.138 0.179 0.25 0.276 0.29 0.2 0.39 0.789 0.745
1427st 0.111 0.062 0.235 0.079 0.097 0.129 0.031 0.079 0.241 0.782 0.281 0.267 0.219 0.188 0.188 0.2 0.763 0.172 0.214 0.281 0.276 0.298 0.236 0.424 0.754 0.745
1920 0.062 0.079 0.229 0.046 0.062 0.062 0.061 0.046 0.233 0.789 0.303 0.258 0.242 0.212 0.182 0.194 0.738 0.167 0.241 0.242 0.267 0.288 0.263 0.41 0.729 0.754
2212 0.354 0.375 0.385 0.275 0.176 0.235 0.229 0.246 0.25 0.77 0.286 0.273 0.257 0.2 0.2 0.242 0.723 0.219 0.355 0.286 0.219 0.27 0.311 0.323 0.683 0.705
TE951 0.097 0.148 0.097 0.365 0.111 0.111 0.108 0.062 0.254 0.786 0.323 0.311 0.262 0.231 0.231 0.246 0.767 0.22 0.228 0.262 0.322 0.276 0.25 0.433 0.759 0.75
UCRD 0.048 0.129 0.111 0.344 0.148 0.065 0.094 0.111 0.207 0.782 0.25 0.233 0.188 0.156 0.156 0.167 0.729 0.138 0.214 0.219 0.241 0.263 0.236 0.356 0.719 0.745
JN16.5 0.085 0.172 0.119 0.4 0.123 0.103 0.125 0.079 0.241 0.745 0.312 0.2 0.25 0.219 0.188 0.167 0.763 0.138 0.179 0.25 0.241 0.298 0.2 0.39 0.719 0.782
JN20.1 0.129 0.049 0.129 0.365 0.133 0.148 0.228 0.077 0.233 0.789 0.273 0.258 0.242 0.212 0.182 0.194 0.705 0.167 0.241 0.242 0.267 0.322 0.263 0.41 0.729 0.754
JN5nb 0.1 0.153 0.133 0.377 0.138 0.119 0.164 0.172 0.22 0.75 0.323 0.246 0.262 0.231 0.2 0.18 0.733 0.153 0.193 0.231 0.288 0.276 0.214 0.4 0.759 0.75
1657 0.415 0.438 0.446 0.303 0.429 0.406 0.467 0.429 0.41 0.765 0.333 0.071 0.167 0.133 0.1 0.214 0.745 0.185 0.269 0.3 0.259 0.245 0.294 0.309 0.811 0.765
1637 0.742 0.77 0.774 0.683 0.8 0.77 0.754 0.767 0.828 0.778 0.614 0.736 0.754 0.754 0.754 0.698 0.846 0.725 0.714 0.825 0.765 0.76 0.708 0.692 0.84 0.708
1740 0.424 0.448 0.424 0.467 0.509 0.448 0.481 0.474 0.455 0.5 0.474 0.355 0.273 0.242 0.273 0.29 0.672 0.3 0.379 0.364 0.333 0.356 0.404 0.41 0.695 0.789
1738 0.541 0.5 0.541 0.419 0.525 0.533 0.536 0.525 0.509 0.161 0.831 0.536 0.194 0.161 0.129 0.207 0.754 0.179 0.259 0.355 0.25 0.309 0.283 0.333 0.782 0.774
2744 0.517 0.474 0.517 0.525 0.536 0.509 0.509 0.5 0.481 0.39 0.786 0.509 0.273 0.061 0.091 0.258 0.705 0.233 0.276 0.303 0.233 0.254 0.333 0.344 0.763 0.754
JN8-5 0.517 0.509 0.517 0.525 0.536 0.509 0.509 0.536 0.481 0.424 0.786 0.509 0.345 0.115 0.03 0.226 0.705 0.167 0.241 0.273 0.2 0.186 0.298 0.279 0.763 0.754
JN8-10 0.509 0.5 0.509 0.517 0.527 0.5 0.5 0.527 0.472 0.414 0.818 0.5 0.333 0.137 0.059 0.194 0.705 0.133 0.241 0.273 0.167 0.22 0.298 0.279 0.797 0.789
1726 0.429 0.455 0.464 0.474 0.444 0.418 0.49 0.481 0.385 0.509 0.741 0.569 0.585 0.52 0.56 0.551 0.754 0.143 0.185 0.355 0.286 0.345 0.321 0.368 0.782 0.774
1392 0.821 0.782 0.786 0.719 0.778 0.782 0.804 0.815 0.769 0.789 0.778 0.765 0.811 0.88 0.88 0.878 0.75 0.745 0.736 0.705 0.745 0.815 0.885 0.714 0.593 0.731
1777 0.286 0.309 0.321 0.439 0.333 0.309 0.373 0.333 0.231 0.439 0.778 0.451 0.509 0.4 0.44 0.429 0.25 0.75 0.154 0.267 0.185 0.245 0.255 0.345 0.811 0.765
1620 0.393 0.418 0.429 0.439 0.407 0.382 0.412 0.407 0.346 0.509 0.815 0.569 0.547 0.48 0.48 0.51 0.375 0.708 0.292 0.276 0.269 0.294 0.265 0.396 0.804 0.755
1727 0.355 0.344 0.355 0.27 0.3 0.344 0.368 0.333 0.31 0.23 0.833 0.509 0.322 0.464 0.464 0.455 0.444 0.704 0.37 0.37 0.3 0.288 0.333 0.41 0.695 0.789
2440 0.356 0.379 0.39 0.367 0.439 0.345 0.444 0.368 0.382 0.367 0.719 0.444 0.429 0.472 0.472 0.5 0.412 0.725 0.294 0.333 0.368 0.245 0.333 0.345 0.811 0.804
2346 0.577 0.647 0.654 0.623 0.64 0.529 0.617 0.64 0.583 0.623 0.8 0.66 0.673 0.652 0.652 0.644 0.5 0.682 0.591 0.545 0.6 0.617 0.32 0.296 0.808 0.72
1573 0.424 0.448 0.458 0.5 0.439 0.414 0.444 0.474 0.382 0.5 0.86 0.593 0.571 0.509 0.509 0.462 0.373 0.765 0.333 0.333 0.404 0.481 0.617 0.385 0.8 0.833
2215 0.654 0.725 0.731 0.66 0.72 0.608 0.702 0.72 0.625 0.66 0.88 0.787 0.714 0.652 0.652 0.644 0.455 0.773 0.5 0.591 0.6 0.532 0.45 0.574 0.815 0.769
1390 0.692 0.75 0.723 0.636 0.746 0.75 0.733 0.746 0.738 0.788 0.714 0.733 0.774 0.729 0.695 0.724 0.789 0.789 0.789 0.825 0.778 0.7 0.811 0.867 0.811 0.76
2107 0.909 0.938 0.939 0.91 0.938 0.908 0.902 0.938 0.935 0.851 0.781 0.902 0.81 0.8 0.833 0.831 0.897 0.931 0.897 0.862 0.906 0.869 0.889 0.869 0.815 0.821
a

The values on the upper right are the genetic distances obtained by the AFLP method, and the values on the lower right are the genetic distances obtained by the RAPD method. 

b

Strains JN51, JN52, JN53, and JN54.