TABLE 5.
Detection of homologs of avr genes on 31 P. syringae plasmids
| Plasmid | Hybridizationd for:
|
|||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| avrA | virPphApgy | avrD | avrPphDpgy | avrPphE | avrPpiB2 | avrPphB1 | avrRps4 | hopPmaD | hopPmaA | avrRpm1 | 4 avr genese | |
| pDC3000Aa,b | − | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − |
| pDC3000Ba,b | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| pPT23A | − | − | + | − | − | − | − | + | − | + | − | − |
| pPT23B | − | − | + | + | − | − | − | − | − | + | − | − |
| pOK1A | + | + | + | + | − | − | − | − | − | + | − | − |
| pFKNa | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | + | − |
| pPMA4326Aa | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| pPMA4326Ba | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − |
| pPSM8810 | − | − | − | − | + | + | + | − | − | − | − | − |
| pPSM9032A | − | − | − | − | − | + | + | − | − | + | − | − |
| pPSM9032B | − | − | − | − | − | + | + | − | − | + | − | − |
| pPSA1089A | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
| pPSTA0893 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| pPSE | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − |
| pPP3364 | − | − | + | + | − | ± | − | + | ± | − | − | − |
| pPSPh1449B | − | + | + | + | − | − | − | + | − | − | − | − |
| pPh1448Aa,c | − | − | + | + | − | − | − | + | − | + | − | − |
| pPh1448Ba | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| pPG2708 | − | − | − | − | − | ± | − | − | + | − | − | − |
| pPSR1 | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − |
| pB8617A | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| pCG131 | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | − | − |
| pPSS4918 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| pPSL1188 | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| pPS0485A | − | − | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| pPS0485B | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
| pPS0485C | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| pPS0693A | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| pPA0893A | + | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − |
| pPA0893B | + | − | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − |
| pPA0893C | − | − | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
a
In silico analysis.
b
Other avr genes on pDC3000 are hopPtoS1 and hopPtoT1.
c
The other avr gene on pPh1448 is holPtoQ.
d
+, strong hybridization; ±, weak hybridization; −, negative.
e
avrE, avrF, avrPto, and avrRpt2.