Table 3.

the clean reads analysis of six samples(C1, C2, C3,P1, P2 and P3)

	raw_reads	reads_trimmed_length	reads_trimmed_Q20	reads_trimmed_N	clean_reads	clean_reads_uniq
C1	11.56 M	10.72 M	10.72 M	10.72 M	10.72 M	0.30 M
C2	14.92 M	13.29 M	13.28 M	13.28 M	13.28 M	0.39 M
C3	15.22 M	14.18 M	14.17 M	14.17 M	14.17 M	0.41 M
P1	16.58 M	14.90 M	14.89 M	14.89 M	14.89 M	0.38 M
P2	15.36 M	13.76 M	13.75 M	13.75 M	13.75 M	0.38 M
P3	16.93 M	15.27 M	15.26 M	15.26 M	15.26 M	0.41 M