Table 2.

Primer sequences and cycle conditions of RAMS and REP-PCR

Primer	Sequence	Temperature cycle	References
RAMS
CCA	5'DD(CCA)5	95 °C 10 min 95 °C 30 s 64 °C 45 s 72 °C 2 min 72 °C 7 min- 35 cycles	Hantula et al. (1996)
GT	5'YHY(GT)5G	95 °C 10 min 95 °C 30 s 53 °C 45 s 72 °C 2 min 72 °C 7 min- 35 cycles	Hantula et al. (1996)
ACA	5'BDB(ACA)5	95 °C 10 min 95 °C 30 s 49 °C 45 s 72 °C 2 min 72 °C 7 min- 35 cycles	Hantula et al. (1996)
CGA	5'DHB(CGA)5	95 °C 10 min 95 °C 30 s 60 °C 45 s 72 °C 2 min 72 °C 7 min- 35 cycles	Hantula et al. (1996)
REP-PCR
BOX1A	5′-CTACGGCAAGGCGACGCTGACG-3′	95 °C 7 min, 94 °C 1 min, 53 °C 1 min, 65 °C 8 min, 65 °C 16 min- 30 cycles	Versalovic et al. (1991)
ERIC1R	5′-ATGTAAGCTCCTGGGGATTCAC-3′
ERIC2	5′-AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCG-3′	95 °C 7 min 94 °C 1 min 52 °C 1 min 65 °C 8 min 65 °C 16 min- 30 cycles	Versalovic et al. (1991)
REP1R-I	5′-IIIICGICGICATCIGGC-3′
REP2-I	5′-ICGICTTATCIGGCCTAC-3′	94 °C 7 min 94 °C 1 min 40 °C 1 min 65 °C 8 min 65 °C 16 min- 35 cycles	Versalovic et al. (1993)
M13	5′-GAGGGTGGCGGTTCT-3′	93 °C 3 min 93 °C 1 min 55 °C 1 min 72 °C 1 min 72 °C 10 min- 45 cycles	Zaccardelli et al. (2008)