Table 2.

Description of 35 orphan strains (n = 37) and the corresponding spoligotyping defined lineages/sub‐lineages recorded among MTB strains isolated from Central, Eastern and Southeastern Ethiopia.

Octal code	Binary code	SITVIT2	CBN	SNP-based lineage
525252525240521	■□■□■□■□■□■□■□■□■□■□■□■□■□■□■□■□□□□□■□■□■□■	ND	EA	EA (L4.1.1)
007777777760771	□□□□□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	T1	EA	EA (L4)
500177740003171	■□■□□□□□□□□■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■□□■■■■■	ND	EAI	EAI (L3)
501252500002121	■□■□□□□□■□■□■□■□■□■□■□□□□□□□□□□□□□■□□□■□■□■	ND	EAI	EAI (L3)
777000377777771	■■■■■■■■■□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■	ND	IO	UNK
700006037177661	■■■□□□□□□□□□□□□■■□□□□□■■■■■□□■■■■■■■■■□■■□■	ND	MA	WA (L5 and L6)
703757740003171	■■■□□□□■■■■■■□■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■□□■■■■■	ND	EAI	EAI (L3)
713247664001661	■■■□□■□■■□■□■□□■■■■■□■■□■□□□□□□□□□□■■■□■■□■	ND	IO	UNK
777777777000171	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□■■■■■	UKN	EA	UNK
771046024100261	■■■■■■□□■□□□■□□■■□□□□□■□■□□□□■□□□□□□□■□■■□■	ND	EA	UNK
773777776000771	■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□■■■■■■■	ND	EA	UNK
774242525042000	■■■■■■■□□□■□■□□□■□■□■□■□■□■□□□■□□□■□□□□□□□□	ND	MA	UNK
703357740003071	■■■□□□□■■□■■■□■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■□□□■■■■	ND	EAI	EAI (L3)
703777710003771	■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■■□□■□□□□□□□□□□■■■■■■■■■	ND	EAI	UNK
777737777360771	■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■□■■■■□□□□■■■■■■■	ND	EA	EA (L4)
777775477760731	■■■■■■■■■■■■■■■■□■■□□■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■	ND	EA	EA (L4)
777777404060771	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□■□□□□□■■□□□□■■■■■■■	ND	EA	EA (L4.3)
477777376413771	■□□■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■□■□□□□■□■■■■■■■■■	ND	IO	IO (L1)
777737377750771	■■■■■■■■■■■■□■■■■■□■■■■■■■■■■■■□■□□□■■■■■■■	ND	EA	UNK
510047236343661	■□■□□■□□□□□□■□□■■■□■□□■■■■□□■■■□□□■■■■□■■□■	ND	MA	WA (L5 and L6)
525252500000000	■□■□■□■□■□■□■□■□■□■□■□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□	ND	EA	UNK
551246236340261	■□■■□■□□■□■□■□□■■□□■□□■■■■□□■■■□□□□□□■□■■□■	ND	EA	EA (L4)
511047236340261	■□■□□■□□■□□□■□□■■■□■□□■■■■□□■■■□□□□□□■□■■□■	ND	EA	EA (L4)
777347777763771	■■■■■■■■■□■■■□□■■■■■■■■■■■■■■■■■□□■■■■■■■■■	Manu2	EA	UNK
511046637561671	■□■□□■□□■□□□■□□■■□■■□□■■■■■■□■■■□□□■■■□■■■■	ND	EA	UNK
603777700003771	■■□□□□□■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■	ND	EAI	UNK
311000377760771	□■■□□■□□■□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	ND	EA	EA (L4)
777000377730771	■■■■■■■■■□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■□■■□□□■■■■■■■	ND	EA	UNK
713357776363771	■■■□□■□■■□■■■□■■■■■■■■■■■■□□■■■■□□■■■■■■■■■	ND	EA	UNK
777347636361771	■■■■■■■■■□■■■□□■■■■■□□■■■■□□■■■■□□□■■■■■■■■	ND	EA	UNK
777775777760721	■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■□■	ND	EA	EA (L4)
774177770000021	■■■■■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□□■□■	ND	EA	UNK
520000377760771	■□■□■□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	ND	EA	EA (L4)
700000017760771*	■■■□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	ND	EA	EA (L4)
777357677761771	■■■■■■■■■□■■■□■■■■■■□■■■■■■■■■■■□□□■■■■■■■■	ND	EA	UNK

EA = Euro-American, EA = East-Asian, EAI = East-African-Indian, IO=Indo-Oceanic, UKN=Unknown, WA=West Africa, MA = Mycobacterium Africanum, ND=Not defined,*n=3.