Table 3.
Description of 42 shared types (SITs; n = 186 isolates) registered in the SITVIT2 or SpolDB4 database and the corresponding spoligotyping defined lineages/sub‐lineages isolated from the Central, Eastern and Southeastern Ethiopia.
| Octal code | Binary code | SITVIT2 | CBN | SNP-based lineage | SIT | Number of isolates |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 777000377760771 | ■■■■■■■■■□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | T3-ETH | EA | EA (L4) | 149 | 49 |
| 777777777760771 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | T1 | EA | EA (L4) | 53 | 33 |
| 703377400001771 | ■■■□□□□■■□■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■ | CAS1-Kili | EAI | EAI (L3) | 21 | 24 |
| 777777404760771 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□■□□■■■■■□□□□■■■■■■■ | Turkey | EA | EA (L4.2.2.1) | 41 | 11 |
| 777737777760771 | ■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | T3 | EA | EA (L4) | 37 | 9 |
| 777776777760731 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■ | X1 | EA | EA (L4.1.1) | 336 | 6 |
| 703777740003171 | ■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■□□■■■■■ | CAS1-Delhi | EAI | EAI (L3) | 25 | 5 |
| 777777777760731 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■ | T2 | EA | EA (L4) | 52 | 4 |
| 000000000003711 | □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■□□■■ | Beijing | EAS | EAS (L2) | 541 | 4 |
| 703777740003771 | ■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■ | CAS1-Delhi | EAI | EAI (L3) | 26 | 3 |
| 777777777420771 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□■□□□□■■■■■■■ | Ural-1 | EA | EA (L4.2.1) | 777 | 3 |
| 677737777760771 | ■■□■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | T3 | EA | EA (L4) | 1163 | 2 |
| 776737407760771 | ■■■■■■■■□■■■□■■■■■■□□□□□■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | LAM5 | EA | EA (L4.3) | 3325 | 2 |
| 717777777760771 | ■■■□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | T1 | EA | EA (L4) | 358 | 2 |
| 777777777720771 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■□□□□■■■■■■■ | H3 | EA | EA (L4.1.2) | 50 | 2 |
| 000000000003771 | □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■ | Beijing | EAS | EAS (L2) | 1 | 1 |
| 777776777760771 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | X1 | EA | EA (L4.1.1) | 119 | 1 |
| 777777775720771 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■□■□□□□■■■■■■■ | H3 | EA | EA (L4.1.2) | 121 | 1 |
| 777617777760771 | ■■■■■■■■■■■□□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | T3 | EA | EA (L4) | 1214 | 1 |
| 703777740003131 | ■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■□□■□■■■ | CAS1-Delhi | EAI | EAI (L3) | 1312 | 1 |
| 777777777720631 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■□□□□■■□□■■■ | H3 | EA | EA (L4.1.2) | 134 | 1 |
| 777776777760601 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■□□□□■ | X2 | EA | EA (L4.1.1) | 137 | 1 |
| 703777700003771 | ■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■ | CAS1-Delhi | EAI | EAI (L3) | 142 | 1 |
| 777377777761771 | ■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□■■■■■■■■ | UKN | EA | UNK | 1516 | 1 |
| 757777777760731 | ■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■ | T2 | EA | EA (L4) | 153 | 1 |
| 377777607760771 | □■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | LAM9 | EA | EA (L4.3) | 177 | 1 |
| 777737777760371 | ■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□■■■■■■ | T3 | EA | EA (L4) | 2040 | 1 |
| 777736777760771 | ■■■■■■■■■■■■□■■■■□■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | X1 | EA | EA (L4.1.1) | 217 | 1 |
| 703777400001771 | ■■■□□□□■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■ | CAS1_Dehi | EAI | EAI (L3) | 22 | 1 |
| 777777777760601 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■□□□□■ | T1 | EA | EA (L4) | 244 | 1 |
| 777737377720771 | ■■■■■■■■■■■■□■■■■■□■■■■■■■■■■■□■□□□□■■■■■■■ | H3 | EA | EA (L4.1.2) | 3134 | 1 |
| 177000377760771 | □□■■■■■■■□□□□□□□□□□■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | T3-ETH | EA | EA (L4) | 3141 | 1 |
| 006737777760771 | □□□□□□■■□■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | T3 | EA | EA (L4) | 3314 | 1 |
| 376777737760771 | □■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | T1 | EA | EA (L4) | 3315 | 1 |
| 703417740003771 | ■■■□□□□■■■□□□□■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■ | CAS1-Delhi | EAI | EAI (L3) | 3319 | 1 |
| 703177740003771 | ■■■□□□□■■□□■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■ | CAS1-Delhi | EAI | EAI (L3) | 3835 | 1 |
| 000000007760771 | □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | UKN | EA | EA (L4.3) | 4 | 1 |
| 777777770000000 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ | UKN | EA | UKN | 46 | 1 |
| 777775777760731 | ■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■ | T2 | EA | EA (L4) | 584 | 1 |
| 777177777760771 | ■■■■■■■■■□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■ | T1 | EA | EA (L4) | 613 | 1 |
| 777777777420731 | ■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□■□□□□■■■□■■■ | Ural-1 | EA | EA (L4.2.1) | 817 | 1 |
| 700000007177771 | ■■■□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■□□■■■■■■■■■■■■■■ | ETH | MA | ETH (L7) | 910 | 1 |
EA = Euro-American, EA = East-Asian, EAI = East-African-Indian, IO=Indo-Oceanic, ETH = Ethiopian, UKN=Unknown, WA=West Africa, MA = Mycobacterium Africanum, ND=Not-defined.