Table 3. Nucleotide bases in cob, nad2 and cox1 genes detected in Slovak isolates in polymorphic sites determined for European E1 –E5 haplotypes of Echinococcus multilocularis [12].

	cob	cob	603 bp	nad2	nad2	882 bp	cox1	cox1	cox1	cox1	789 bp	2,274 bp
Isolate No.	244 G/T	369 A/G	Haplotype (cob)	72 A/G	486 A/G	Haplotype (nad2)	22 C/T	40 T/G	44 T/C	203 A/G	Haplotype (cox1)	Final Haplotype
SK1	G	G	E5	G	G	E5	T	G	C	A	E2, E4, E5	E5
SK2	G	A	E1, E2, E4	A	A	E1, E2	–	–	–	–	–	E1/E2
SK3	G	G	E5	G	G	E5	T	G	C	A	E2, E4, E5	E5
SK4	G	G	E5	G	G	E5	T	G	C	G*	E2, E4, E5	E5a
SK5	G	A	E1, E2, E4	G	A	E3, E4	T	G	C	A	E2, E4, E5	E4
SK6	G	G	E5	G	G	E5	T	G	C	A	E2, E4, E5	E5
SK7	G	A	E1, E2, E4	G	A	E3, E4	T	G	C	A	E2, E4, E5	E4
SK8	G	A	E1, E2, E4	G	A	E3, E4	T	G	C	A	E2, E4, E5	E4
SK9	G	G	E5	G	G	E5	–	–	–	–	–	E5
SK10	G	G	E5	G	G	E5	T	G	C	A	E2, E4, E5	E5
SK11	G	G	E5	G	G	E5	T	G	C	A	E2, E4, E5	E5
SK12	G	G	E5	–	–	–	–	–	–	–	–	E5
SK13	G	G	E5	G	G	E5	T	G	C	A	E2, E4, E5	E5
SK14	G	G	E5	G	G	E5	T	G	C	G*	E2, E4, E5	E5a
SK15	G	A	E1, E2, E4	G	A	E3, E4	T	G	C	A	E2, E4, E5	E4
SK16	G	G	E5	G	G	E5	T	G	C	A	E2, E4, E5	E5
SK17	–	–	–	G	G	E5	–	–	–	–	–	E5
SK18	G	G	E5	G	G	E5	T	G	C	A	E2, E4, E5	E5
SK19	G	G	E5	G	G	E5	T	G	C	A	E2, E4, E5	E5
SK20	G	G	E5	G	G	E5	T	G	C	A	E2, E4, E5	E5
SK21	G	G	E5	G	G	E5	–	–	–	–	–	E5

The dash ("–") with a grey background indicates that no satisfactory amplification was achieved with this gene.

*Additional polymorphism (behind the referenced E1 –E5 polymorphism) in cox1.