Table 5.
Binding scores, hydrogen bonds, and bond distance for studied compounds against Plasmodium falciparum proteins 5DYL and 7JGD
| Interaction | Binding affinity (kcal/mol) | Hydrogen bond | Residue | Bond distance |
|---|---|---|---|---|
| 5DYL + A | -7.6 | 2 | A:ASN:183 | 2.25 |
| A:ARG:685 | 4.05 | |||
| B | -4.8 | 6 | A:THR:182 | 2.64 |
| A:CYS:185 | 2.68 | |||
| A:ASN:160 | 2.02 | |||
| A:ARG:685 | 2.18 | |||
| A:ARG:685 | 2.15 | |||
| A:ARG:685 | 2.40 | |||
| C | -6.9 | 2 | A:GLY:707 | 3.02 |
| A:ARG:685 | 3.88 | |||
| D | -7.3 | 2 | A:ARG:685 | 2.44 |
| A:ASN:183 | 3.03 | |||
| E | -9.0 | 1 | A:ASN:652 | 2.62 |
| F | -6.7 | 5 | A:ASN:183 | 2.57 |
| A:CYS:708 | 2.81 | |||
| A:THR:709 | 2.59 | |||
| A:GLY:707 | 2.74 | |||
| A:THR:709 | 2.61 | |||
| G | -6.8 | 4 | A:CYS:708 | 3.06 |
| A:GLY:707 | 2.85 | |||
| A:THR:709 | 3.02 | |||
| A:ASN:183 | 2.28 | |||
| I | -8.3 | 2 | A:ASN:183 | 2.26 |
| A:GLN:772 | 2.09 | |||
| J | -4.1 | 2 | A:ASN:156 | 2.85 |
| A:THR:182 | 2.37 | |||
| K | -6.7 | 3 | A:THR:709 | 2.57 |
| A:GLY:707 | 2.47 | |||
| A:ARG:685 | 4.91 | |||
| L | -7.1 | 2 | A:ARG:685 | 1.80 |
| A:GLY:705 | 2.79 | |||
| M | -3.1 | |||
| N | -5.4 | 2 | A:LYS:786 | 2.38 |
| A:LYS:786 | 2.74 | |||
| O | -5.3 | 9 | A:LYS:704 | 2.34 |
| A:ASN:183 | 2.18 | |||
| A:ARG:685 | 2.21 | |||
| A:ASN:156 | 2.37 | |||
| A:ASN:156 | 2.24 | |||
| A:CYS:185 | 2.21 | |||
| A:CYS:185 | 2.12 | |||
| A:ASN:156 | 2.50 | |||
| A:GLN:772 | 2.61 | |||
| P | -4.9 | 5 | A:LYS:704 | 2.29 |
| A:ASN:56 | 2.45 | |||
| A:ASN:56 | 2.65 | |||
| A:ARG:685 | 6.38 | |||
| A:ASN:183 | 2.52 | |||
| Q | -3.9 | 2 | A:ASN:156 | 2.10 |
| A:ARG:685 | 6.09 | |||
| R | -4.6 | 4 | A:GLY:707 | 4.54 |
| A:THR:709 | 2.76 | |||
| A:CYS:708 | 4.74 | |||
| A:THR:709 | 4.54 | |||
| S | -8.4 | 10 | A:GLU:59 | 2.50 |
| A:LYS:704 | 1.90 | |||
| A:LYS:704 | 2.57 | |||
| A:GLY:705 | 2.55 | |||
| A:ARG:685 | 2.63 | |||
| A:ARG:685 | 2.05 | |||
| A:ARG:685 | 2.54 | |||
| A:THR:182 | 2.24 | |||
| A:CYS:185 | 2.02 | |||
| A:ASN:156 | 2.83 | |||
| T | -5.6 | 5 | A:ASN:156 | 5.01 |
| A:ARG:685 | 6.35 | |||
| A:ARG:685 | 2.26 | |||
| A:ARG:685 | 2.93 | |||
| A:GLN:772 | 2.88 | |||
| U | -5.4 | 5 | A:SER 75 | 2.00 |
| A:SER:75 | 2.02 | |||
| A:ASP:75 | 2.78 | |||
| V | -4.9 | 2 | A:ARG:685 | 6.35 |
| A:GLN:772 | 2.70 | |||
| W | -8.3 | 2 | A:GLN:772 | 2.09 |
| A:ASN:183 | 2.26 | |||
| X | -9.1 | 2 | A:LYS:407 | 2.41 |
| A:LEU:415 | 2.69 | |||
| Y | -5.7 | 1 | A:ASN:183 | 2.91 |
| 7JGD + A | -8.6 | 2 | A:ILE:1732 | 2.17 |
| A:ARG:1736 | 2.99 | |||
| B | -4.9 | 6 | A:GLU:674 | 2.14 |
| A:GLU:674 | 2.28 | |||
| A:GLU:674 | 3.22 | |||
| A:GLU:678 | 5.99 | |||
| A:GLU:678 | 2.66 | |||
| A:SER:148 | 2.46 | |||
| C | -5.1 | 3 | A:ARG:583 | 3.45 |
| A:ARG:583 | 2.40 | |||
| A:LYS:555 | 2.22 | |||
| D | -7.9 | 4 | A:THR:956 | 2.93 |
| A:TYR:960 | 2.09 | |||
| A:ARG:959 | 2.70 | |||
| A:ASN:948 | 2.37 | |||
| E | -9.7 | 1 | A:LYS:887 | 2.40 |
| F | -5.8 | 4 | A:LYS:1703 | 5.74 |
| A:LYS:1703 | 2.67 | |||
| A:ASN:1705 | 5.06 | |||
| A:LYS:850 | 2.45 | |||
| G | -5.9 | 4 | A:SER:148 | 2.72 |
| A:GLN:678 | 2.84 | |||
| A:SER:232 | 1.95 | |||
| A:ARG:231 | 4.01 | |||
| I | -6.8 | A:THR:1739 | 2.25 | |
| A:LYS:850 | 2.14 | |||
| J | -3.9 | 1 | A:ARG:1767 | 2.75 |
| K | -5.8 | 3 | A:THR:1739 | 2.29 |
| A:THR:1739 | 2.52 | |||
| A:ASN:1705 | 2.33 | |||
| A:ASN:1705 | 3.04 | |||
| L | -7.0 | 4 | A:ARG:1736 | 2.20 |
| A:ASP:891 | 2.15 | |||
| A:ASN:1705 | 2.31 | |||
| A:ARG:853 | 2.92 | |||
| M | -4.3 | 1 | A:ASN:948 | 2.63 |
| N | -5.2 | 3 | A:ASN:1705 | 2.85 |
| A:ASN:1705 | 2.37 | |||
| A:THR:1739 | 1.93 | |||
| O | -5.9 | 9 | A:ASP:705 | 2.15 |
| A:LEU:704 | 2.58 | |||
| A:HIS:143 | 2.88 | |||
| A:SER:148 | 2.63 | |||
| A:GLN:678 | 5.84 | |||
| A:GLN:678 | 2.19 | |||
| A:GLN:674 | 2.48 | |||
| A:ARG:231 | 2.20 | |||
| A:SER:3.55 | 3.55 | |||
| P | -5.1 | 5 | A:LEU:755 | 3.01 |
| A:SER:880 | 1.75 | |||
| A:ASP:881 | 2.34 | |||
| A:THR:857 | 2.11 | |||
| A:SER:884 | 2.64 | |||
| Q | -4.5 | 3 | A:ASP:955 | 1.90 |
| A:THR:956 | 3.69 | |||
| A:THR:921 | 1.83 | |||
| R | -4.2 | 3 | A:ASP:705 | 2.20 |
| A:LEU:704 | 2.41 | |||
| A:ARG:231 | 2.22 | |||
| S | -8.7 | 10 | A:ALA:1791 | 2.34 |
| A:LYS:850 | 2.46 | |||
| A:LYS:1703 | 2.50 | |||
| A:ASN:1705 | 2.51 | |||
| A:ILE:1732 | 2.90 | |||
| A:ARG:1736 | 2.27 | |||
| A:ASP:891 | 2.53 | |||
| A:ILE:890 | 2.84 | |||
| A:ASN:1871 | 2.75 | |||
| A:ALA:1791 | 2.34 | |||
| T | -5.8 | 4 | A:SER:148 | 2.64 |
| A:SER:232 | 1.96 | |||
| A:SER:232 | 3.64 | |||
| A:ARG:231 | 2.15 | |||
| U | -5.5 | 5 | A:ARG:231 | 2.10 |
| A:GLN:678 | 2.62 | |||
| A:GLN:678 | 2.82 | |||
| A:ASP:705 | 2.80 | |||
| A:ARG:231 | 2.10 | |||
| V | -6.4 | 3 | A:ARG:1627 | 2.68 |
| A:ARG:1627 | 2.48 | |||
| A:TYR:1904 | 2.23 | |||
| W | -6.7 | 2 | A:TYR:1904 | 2.32 |
| A:ARG:851 | 5.08 | |||
| X | -8.6 | 2 | A:ASN:1871 | 2.65 |
| A:ILE:890 | 2.40 | |||
| Y | -5.7 | 1 | A:ASP:891 | 2.81 |