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[Preprint]. 2025 Sep 25:2024.02.04.578824. Originally published 2024 Feb 8. [Version 4] doi: 10.1101/2024.02.04.578824

Table 3.

Correlation coefficients between the distances of key interactions (32 features) and volume of active-site pocket.

WT V211A V211G G214A G214R E219A E219G E219K Y221A Y221H
K67(NZ)-S64(OG) 0.01 0.09 0.11 0.11 0.08 0.17 0.24 0.47 0.25 0.04
K67(NZ)-G220(O) 0.07 0.11 0.05 0.22 0.16 0.16 0.34 0.36 0.33 0.05
K67(NZ)-N152(OD1) 0.11 0.17 0.20 0.22 0.26 0.23 0.23 0.44 0.47 0.09
Y150(OH)-N152(OD1) −0.02 −0.16 −0.16 0.38 0.12 0.10 0.01 −0.12 0.10 −0.09
Y150(N)-A292(O) 0.28 0.30 0.27 0.43 0.25 0.35 0.38 0.30 0.22 0.31
S154(OG)-S151(O) −0.01 −0.05 −0.08 −0.11 −0.14 −0.09 −0.19 −0.42 −0.08 −0.05
G156(N)-N152(O) 0.11 0.12 0.13 0.18 0.36 0.25 0.21 0.47 0.10 0.12
G204(N)-R207(O) 0.08 0.02 0.02 0.30 0.15 0.09 0.43 0.03 0.39 0.10
L209(N)-G202(O) 0.10 0.02 0.00 0.33 0.20 0.12 0.44 0.34 0.50 0.16
G220(N)-D217(O) 0.00 0.01 −0.01 0.04 0.10 −0.05 −0.05 0.31 0.14 0.02
G222(N)-D217(O) 0.07 0.03 0.03 0.14 0.14 0.12 0.02 0.40 0.40 0.09
Y260(OH)-I298(O) −0.00 0.02 0.10 0.18 −0.16 −0.05 −0.34 −0.44 −0.36 −0.04
Y274(OH)-A285(O) 0.20 0.15 −0.01 0.49 0.24 0.37 0.08 0.32 0.43 0.29
G286(N)-R282(O) −0.08 −0.13 0.11 −0.45 −0.18 −0.34 0.24 −0.33 −0.39 −0.24
N287(ND2)-L283(O) 0.02 0.09 0.27 0.05 0.11 −0.04 0.38 0.02 −0.01 −0.00
N287(ND2)-N314(OD1) 0.22 0.26 0.37 0.41 0.33 0.30 0.45 0.21 0.38 0.31
N287(N)-L283(O) −0.06 0.02 0.27 −0.27 −0.05 −0.23 0.39 −0.20 −0.28 −0.13
S288(N)-A285(O) −0.06 −0.10 0.15 −0.45 −0.14 −0.31 0.28 −0.27 −0.35 −0.18
L293(N)-T289(O) 0.05 −0.06 0.05 −0.09 0.02 0.14 0.36 −0.09 −0.15 −0.05
Q294(N)-M291(O) 0.21 0.00 0.16 −0.01 0.04 0.13 0.39 0.04 −0.04 0.13
R300(N)-G145(O) 0.01 −0.09 −0.02 0.06 0.06 −0.12 −0.12 −0.42 −0.35 −0.04
L307(N)-H256(O) 0.01 0.10 0.10 −0.03 0.23 0.17 0.27 0.35 −0.00 0.02
S318(OG)-F322(O) −0.10 −0.10 −0.10 −0.13 −0.05 −0.09 −0.11 −0.31 −0.10 −0.10
G331(N)-G309(O) −0.01 0.26 0.04 0.26 0.09 0.28 0.06 0.32 0.52 0.09
K48(NZ)-D206(OD2) −0.02 0.07 0.07 0.23 0.01 0.05 0.40 −0.08 −0.02 0.01
K48(NZ)-D206(OD1) −0.02 0.07 0.06 0.23 0.01 0.05 0.40 −0.08 −0.02 0.02
R300(NE)-D108(OD1) 0.03 −0.04 −0.10 0.01 0.11 −0.16 −0.10 −0.32 −0.35 −0.04
R300(NE)-D108(OD2) 0.01 −0.05 −0.08 0.01 0.12 −0.14 −0.10 −0.36 −0.33 −0.03
R342(NH2)-D206(OD2) 0.10 −0.07 −0.01 0.21 0.07 0.06 0.38 0.02 0.31 0.06
R342(NH1)-D206(OD2) 0.10 −0.05 −0.00 0.22 0.07 0.04 0.38 −0.02 0.32 0.05
R342(NH2)-D206(OD1) 0.10 −0.07 −0.01 0.20 0.08 0.05 0.38 0.02 0.30 0.06
R342(NH1)-D206(OD1) 0.10 −0.05 0.01 0.21 0.08 0.02 0.38 −0.02 0.31 0.04