Table 4.

vacA genotyping of H. pylori strains isolated from Alaskans, 1998–2005 and 2011–2013

vacA region genotype		Total (n=263)	No/mild gastritis (n=22)	Moderate gastritis (n=121)	Severe gastritis (n=40)	PUD* (n=38)	IM* (n=30)	GC* (n=12)
									P-value clinical spectrum	P-value gastritis vs PUD vs. IM/GC	P-value IM/GC vs others
Signal (s) region (n=250)	s1	140 (56 %)	11 (50 %)	61 (52 %)	20 (53 %)	20 (57 %)	17 (68 %)	11 (92 %)	0.02	0.006	0.002
	s2	98 (39 %)	11 (50 %)	50 (42 %)	17 (45 %)	14 (40 %)	6 (24 %)	0 (0 %)
	s1/s2†	12 (5 %)	0 (0 %)	7 (6 %)	1 (2 %)	1 (3 %)	2 (8 %)	1 (8 %)
Intermediate (i) region (n=247)	i1	103 (42 %)	8 (36 %)	41 (36 %)	13 (35 %)	16 (43 %)	16 (64 %)	9 (82 %)	0.003	0.0004	0.0001
	i2	127 (51 %)	14 (64 %)	66 (57 %)	18 (49 %)	21 (57 %)	7 (28 %)	1 (9 %)
	i1/i2†	17 (7 %)	0 (0 %)	8 (7 %)	6 (16 %)	0 (0 %)	2 (8 %)	1 (9 %)
Mid (m) region (n=257)	m1	112 (44 %)	9 (41 %)	45 (38 %)	16 (41%)	16 (43 %)	17 (57 %)	9 (90 %)	0.02	0.01	0.003
	m2	136 (53 %)	13 (59 %)	69 (58 %)	21 (54 %)	20 (54 %)	13 (43 %)	0 (0 %)
	m1/m2†	9 (3 %)	0 (0 %)	5 (4 %)	2 (5 %)	1 (3 %)	0 (0 %)	1 (10 %)
vacA genotype (n=234)	s1/i1/m1	94 (40 %)	8 (36 %)	38 (34 %)	12 (34 %)	15 (45 %)	13 (57 %)	8 (80 %)	0.02	0.03	0.004
	s1/i2/m2	18 (8 %)	2 (9 %)	9 (8 %)	4 (11 %)	2 (6 %)	1 (4 %)	0 (0 %)
	s2/i2/m2	86 (37 %)	11 (50 %)	45 (41 %)	11 (31 %)	13 (39 %)	6 (26 %)	0 (0 %)
	Other‡	10 (4 %)	1 (5 %)	5 (5 %)	2 (6 %)	2 (6 %)	0 (0 %)	0 (0 %)
	mixed†	26 (11 %)	0 (0 %)	14 (13 %)	6 (17 %)	1 (3 %)	3 (13 %)	2 (20 %)

Significant P-values are bolded.

^*PUD, peptic ulcer disease; IM, intestinal metaplasia; GC, gastric cancer.

^†Mixed infections removed from statistical analyses.

^‡Other includes s1/i1/m2 (n=4) and s1/i2/m1 (n=6).