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. 2024 Feb 22;14:4344. doi: 10.1038/s41598-024-54663-z

Table 5.

Mean dice score coefficient (DSC), precision, and recall values between two methods, DLS and Freesurfer with manual correction methods in control, SCN1A patients, and total patients.

Dice coefficient Precision Recall
Total Healthy control SCN1A patients Total Healthy control SCN1A patients Total Healthy control SCN1A patients
Total brain 0.79 0.79 0.80 0.80 0.79 0.80 0.80 0.80 0.81
Total GM 0.80 0.80 0.80 0.81 0.80 0.81 0.80 0.80 0.81
 Cortical GM 0.78 0.77 0.78 0.78 0.78 0.78 0.79 0.78 0.79
 Subcortical GM 0.82 0.82 0.82 0.83 0.83 0.83 0.82 0.81 0.82
Total WM 0.95 0.95 0.95 0.94 0.94 0.95 0.96 0.96 0.96
Total cerebellum 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90 0.90
 Cerebellar WM 0.87 0.87 0.87 0.89 0.89 0.88 0.86 0.85 0.87
 Cerebellar GM 0.92 0.92 0.92 0.90 0.90 0.91 0.94 0.94 0.93
Cortical volume analysis
 Frontal
  Superior frontal gyrus, left 0.87 0.87 0.88 0.88 0.88 0.89 0.86 0.86 0.87
  Superior frontal gyrus, right 0.87 0.87 0.88 0.86 0.86 0.86 0.89 0.88 0.89
  Rostral middle frontal, left 0.85 0.85 0.85 0.86 0.86 0.85 0.84 0.84 0.85
  Rostral middle frontal, right 0.83 0.83 0.84 0.89 0.89 0.89 0.78 0.78 0.79
  Caudal middle frontal, left 0.80 0.79 0.81 0.78 0.77 0.80 0.82 0.82 0.82
  Caudal middle frontal, right 0.78 0.79 0.77 0.73 0.73 0.73 0.85 0.86 0.82
  Pars opercularis, left 0.81 0.81 0.82 0.82 0.81 0.83 0.81 0.81 0.81
  Pars opercularis, right 0.77 0.78 0.75 0.81 0.81 0.80 0.74 0.75 0.71
  Pars triangularis, left 0.82 0.82 0.81 0.83 0.83 0.83 0.81 0.81 0.80
  Pars triangularis, right 0.82 0.82 0.82 0.80 0.80 0.79 0.84 0.84 0.85
  Pars orbitalis, left 0.76 0.76 0.76 0.81 0.81 0.81 0.72 0.73 0.72
  Pars orbitalis, right 0.77 0.77 0.75 0.83 0.84 0.82 0.72 0.73 0.70
  Lateral orbitofrontal, left 0.85 0.84 0.86 0.82 0.82 0.82 0.89 0.88 0.90
  Lateral orbitofrontal, right 0.84 0.83 0.84 0.79 0.79 0.79 0.89 0.89 0.90
  Medial orbitofrontal, left 0.76 0.76 0.77 0.77 0.76 0.78 0.76 0.76 0.77
  Medial orbitofrontal, right 0.78 0.78 0.79 0.78 0.78 0.77 0.80 0.79 0.81
  Precentral, left 0.84 0.83 0.86 0.83 0.82 0.85 0.85 0.84 0.87
  Precentral, right 0.84 0.85 0.82 0.84 0.85 0.82 0.84 0.86 0.82
  Paracentral, left 0.78 0.77 0.79 0.78 0.76 0.81 0.79 0.78 0.80
  Paracentral, right 0.77 0.77 0.77 0.80 0.79 0.83 0.75 0.76 0.73
  Frontal pole, left 0.65 0.65 0.65 0.76 0.75 0.78 0.58 0.59 0.57
  Frontal pole, right 0.66 0.67 0.66 0.78 0.77 0.80 0.59 0.60 0.58
  Rostral anterior cingulate, left 0.78 0.78 0.79 0.76 0.76 0.75 0.82 0.81 0.83
  Rostral anterior cingulate, right 0.76 0.76 0.75 0.75 0.76 0.73 0.77 0.77 0.78
  Caudal anterior cingulate, left 0.72 0.72 0.73 0.75 0.75 0.73 0.71 0.70 0.74
  Caudal anterior cingulate, right 0.74 0.73 0.76 0.80 0.78 0.82 0.71 0.70 0.72
 Parietal
  Superior parietal, left 0.83 0.82 0.85 0.82 0.80 0.85 0.84 0.84 0.86
  Superior parietal, right 0.81 0.80 0.83 0.79 0.78 0.82 0.84 0.84 0.84
  Inferior parietal, left 0.82 0.81 0.84 0.83 0.82 0.84 0.82 0.80 0.84
  Inferior parietal, right 0.83 0.82 0.84 0.85 0.85 0.86 0.81 0.80 0.82
  Supramarginal, left 0.81 0.81 0.83 0.83 0.82 0.85 0.80 0.79 0.81
  Supramarginal, right 0.82 0.83 0.81 0.85 0.86 0.85 0.80 0.81 0.79
  Postcentral, left 0.81 0.80 0.83 0.82 0.81 0.84 0.80 0.79 0.82
  Postcentral, right 0.79 0.79 0.77 0.79 0.80 0.78 0.78 0.79 0.77
  Precuneus, left 0.84 0.84 0.85 0.81 0.80 0.83 0.89 0.88 0.89
  Precuneus, right 0.83 0.83 0.84 0.80 0.79 0.81 0.87 0.87 0.88
  Posterior cingulate, left 0.79 0.78 0.80 0.77 0.76 0.79 0.80 0.80 0.82
  Posterior cingulate, right 0.78 0.77 0.78 0.74 0.75 0.74 0.82 0.81 0.83
  Isthmus cingulate, left 0.79 0.78 0.79 0.83 0.83 0.83 0.75 0.75 0.76
  Isthmus cingulate, right 0.76 0.75 0.76 0.82 0.82 0.82 0.70 0.70 0.72
 Temporal
  Superior temporal, left 0.82 0.82 0.82 0.80 0.80 0.80 0.85 0.84 0.85
  Superior temporal, right 0.85 0.85 0.86 0.81 0.82 0.81 0.90 0.89 0.91
  Middle temporal, left 0.77 0.77 0.78 0.71 0.72 0.70 0.85 0.84 0.87
  Middle temporal, right 0.81 0.81 0.82 0.77 0.78 0.77 0.86 0.84 0.88
  Inferior temporal, left 0.72 0.72 0.71 0.70 0.71 0.68 0.74 0.74 0.75
  Inferior temporal, right 0.74 0.73 0.76 0.72 0.71 0.74 0.77 0.76 0.79
  Banks of the sts, left 0.68 0.68 0.67 0.68 0.70 0.66 0.68 0.67 0.70
  Banks of the sts, right 0.71 0.69 0.73 0.71 0.69 0.75 0.71 0.71 0.72
  Fusiform, left 0.73 0.74 0.73 0.76 0.75 0.77 0.72 0.72 0.71
  Fusiform, right 0.76 0.75 0.77 0.79 0.78 0.81 0.73 0.73 0.74
  Transverse temporal, left 0.77 0.77 0.77 0.73 0.73 0.73 0.81 0.81 0.82
  Transverse temporal, right 0.76 0.75 0.77 0.77 0.77 0.77 0.76 0.75 0.77
  Entorhinal, left 0.63 0.62 0.64 0.67 0.66 0.70 0.60 0.60 0.60
  Entorhinal, right 0.62 0.62 0.62 0.56 0.55 0.56 0.74 0.75 0.71
  Temporal pole, left 0.66 0.66 0.67 0.63 0.62 0.63 0.72 0.72 0.73
  Temporal pole, right 0.64 0.63 0.66 0.67 0.67 0.67 0.62 0.60 0.65
  Parahippocampal, left 0.77 0.76 0.78 0.83 0.83 0.84 0.72 0.71 0.73
  Parahippocampal, right 0.76 0.75 0.76 0.83 0.82 0.84 0.70 0.70 0.71
 Occipital
  Lateral occipital, left 0.79 0.79 0.81 0.77 0.76 0.77 0.83 0.82 0.85
  Lateral occipital, right 0.78 0.78 0.78 0.69 0.69 0.69 0.89 0.89 0.90
  Lingual, left 0.79 0.79 0.80 0.75 0.74 0.75 0.85 0.85 0.86
  Lingual, right 0.80 0.80 0.81 0.79 0.79 0.79 0.81 0.81 0.83
  Cuneus, left 0.74 0.73 0.76 0.71 0.70 0.73 0.78 0.77 0.80
  Cuneus, right 0.75 0.75 0.75 0.77 0.76 0.77 0.73 0.73 0.73
  Pericalcarine, left 0.72 0.71 0.74 0.72 0.70 0.76 0.73 0.72 0.73
  Pericalcarine, right 0.74 0.73 0.75 0.67 0.65 0.69 0.84 0.83 0.84
  Insular cortex, left 0.84 0.84 0.84 0.81 0.81 0.80 0.88 0.87 0.89
  Insular cortex, right 0.85 0.85 0.85 0.85 0.85 0.85 0.85 0.85 0.86
 Subcortical volume analysis
  Hippocampus, left 0.85 0.85 0.86 0.86 0.86 0.86 0.85 0.84 0.86
  Hippocampus, right 0.86 0.86 0.85 0.84 0.85 0.83 0.88 0.88 0.88
  Thalamus, left 0.88 0.88 0.88 0.88 0.88 0.88 0.88 0.88 0.89
  Thalamus, right 0.91 0.91 0.91 0.91 0.91 0.91 0.90 0.90 0.90
  Putamen, left 0.84 0.84 0.84 0.91 0.91 0.91 0.79 0.79 0.79
  Putamen, right 0.86 0.86 0.87 0.94 0.94 0.94 0.80 0.79 0.81
  Caudate, left 0.88 0.88 0.89 0.92 0.92 0.93 0.85 0.84 0.86
  Caudate, right 0.88 0.88 0.88 0.87 0.87 0.87 0.89 0.89 0.89
  Pallidum, left 0.76 0.77 0.75 0.75 0.76 0.72 0.78 0.78 0.78
  Pallidum, right 0.79 0.79 0.78 0.78 0.79 0.77 0.80 0.80 0.79
  Accumbens, left 0.71 0.70 0.73 0.69 0.68 0.70 0.75 0.74 0.77
  Accumbens, right 0.64 0.64 0.66 0.77 0.76 0.78 0.56 0.56 0.57

GM gray matter, WM white matter.