Table 1.
CMC miRNA genes (n = 165) with points from each of the criteria [I–VII] and CMC score
| CMC miRNA genes | [I] | [II] | [III] | [IV] | [V] | [VI] | [VII] | CMC score | O/TS | CMC miRNA genes | [I] | [II] | [III] | [IV] | [V] | [VI] | [VII] | CMC score | O/TS |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MIR21 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 7 | O | MIR122 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 3.5 | ||||
| MIR101-1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 6 | TS | MIR128-1 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | ||||
| MIR101-2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 6 | TS | MIR128-2 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | ||||
| MIR143 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 6 | TS | MIR146A | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 3.5 | |||||
| MIR145 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 6 | TS | MIR192 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | ||||
| MIR16-1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 6 | MIR194-1 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | |||||
| MIR26A1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 6 | TS | MIR194-2 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | ||||
| MIR26A2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 6 | TS | MIR210 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | O | |||
| MIR29C | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 6 | TS | MIR224 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | O | |||
| MIR155 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5.5 | O | MIR23A | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | ||||
| MIR30A | 1 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 5.5 | TS | MIR26B | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | ||||
| MIR100 | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 5 | TS | MIR27B | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | ||||
| MIR106B | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 5 | O | MIR301A | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | O | |||
| MIR10B | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR32 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | ||||||
| MIR126 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR335 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | ||||||
| MIR15A | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR342 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | ||||||
| MIR16-2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR497 | 1 | 1 | 0.5 | 1 | 3.5 | TS | ||||||
| MIR17 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | O | MIR96 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3.5 | O | ||||
| MIR181A1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIRLET7E | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 3.5 | TS | ||||||
| MIR181A2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIRLET7I | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 3.5 | |||||||
| MIR199A1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR103A1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3 | O | ||||||
| MIR199A2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR103A2 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3 | O | ||||||
| MIR19A | 1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 5 | O | MIR107 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3 | |||||
| MIR205 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR10A | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3 | |||||||
| MIR221 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR124-1 | 1 | 1 | 1 | 3 | ||||||||
| MIR29B1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR124-2 | 1 | 1 | 1 | 3 | ||||||||
| MIR29B2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR124-3 | 1 | 1 | 1 | 3 | ||||||||
| MIR30E | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR130B | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 3 | ||||||
| MIR31 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR133B | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3 | TS | ||||||
| MIR34A | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | MIR144 | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 3 | TS | ||||||
| MIR99A | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 5 | TS | MIR148A | 1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 3 | |||||
| MIRLET7B | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | TS | MIR152 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3 | |||||
| MIRLET7C | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 5 | TS | MIR193B | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3 | |||||
| MIR133A1 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | TS | MIR199B | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3 | ||||||
| MIR133A2 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | TS | MIR204 | 1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 3 | TS | |||||
| MIR141 | 1 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4.5 | MIR218-1 | 1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 3 | TS | ||||||
| MIR183 | 1 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4.5 | O | MIR218-2 | 1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 3 | TS | |||||
| MIR195 | 1 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4.5 | TS | MIR23B | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3 | ||||||
| MIR200A | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR24-1 | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 3 | |||||||
| MIR200B | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR24-2 | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 3 | |||||||
| MIR200C | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR28 | 1 | 1 | 1 | 3 | ||||||||
| MIR203A | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR30B | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3 | |||||||
| MIR20A | 1 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4.5 | O | MIR30D | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 3 | ||||||
| MIR222 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | O | MIR324 | 1 | 1 | 1 | 3 | |||||||
| MIR29A | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR378A | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 3 | |||||||
| MIR30C1 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | TS | MIR93 | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 3 | O | |||||
| MIR30C2 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | TS | MIRLET7G | 1 | 1 | 1 | 3 | |||||||
| MIR451A | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | TS | MIR129-1 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2.5 | TS | ||||
| MIR7-1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR129-2 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2.5 | TS | ||||||
| MIR7-2 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR130A | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2.5 | |||||||
| MIR7-3 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR135B | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2.5 | O | ||||||
| MIR9-1 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR137 | 1 | 0.5 | 1 | 2.5 | ||||||||
| MIR9-2 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR146B | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2.5 | |||||||
| MIR92A1 | 1 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4.5 | MIR181C | 0.5 | 1 | 1 | 2.5 | ||||||||
| MIR92A2 | 1 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4.5 | MIR193A | 1 | 0.5 | 1 | 2.5 | ||||||||
| MIR9-3 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR22 | 0.5 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2.5 | |||||||
| MIRLET7A1 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR34B | 0.5 | 1 | 1 | 2.5 | ||||||||
| MIRLET7A2 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR34C | 0.5 | 1 | 1 | 2.5 | ||||||||
| MIRLET7A3 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4.5 | MIR423 | 0.5 | 1 | 1 | 2.5 | ||||||||
| MIR1-1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4 | TS | MIR455 | 0.5 | 1 | 1 | 2.5 | |||||||
| MIR1-2 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4 | TS | MIR106A | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | |||||||
| MIR125A | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | TS | MIR132 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | |||||||
| MIR125B1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | MIR135A1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | |||||||||
| MIR125B2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | MIR135A2 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | |||||||||
| MIR139 | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | TS | MIR138-1 | 1 | 0.5 | 0.5 | 2 | TS | ||||||
| MIR140 | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | TS | MIR138-2 | 1 | 0.5 | 0.5 | 2 | TS | ||||||
| MIR142 | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | MIR148B | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | ||||||||
| MIR150 | 1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | MIR149 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | ||||||||
| MIR15B | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | MIR206 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | TS | |||||||
| MIR181B1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4 | MIR215 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | ||||||||
| MIR181B2 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4 | MIR320A | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | ||||||||
| MIR182 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | O | MIR331 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | ||||||||
| MIR18A | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | O | MIR345 | 1 | 1 | 2 | ||||||||
| MIR19B1 | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | MIR373 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | ||||||||
| MIR19B2 | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | MIR449A | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | ||||||||
| MIR214 | 1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | MIR483 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | ||||||||
| MIR223 | 1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | MIR486-1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | TS | |||||||
| MIR25 | 0.5 | 1 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | O | MIR486-2 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | TS | ||||||
| MIR27A | 1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 4 | MIR494 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | ||||||||
| MIR375 | 1 | 1 | 1 | 1 | 4 | MIR625 | 1 | 1 | 2 | ||||||||||
| MIRLET7D | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4 | MIR98 | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | ||||||||
| MIRLET7F1 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4 | MIR99B | 0.5 | 0.5 | 1 | 2 | ||||||||
| MIRLET7F2 | 0.5 | 0.5 | 1 | 1 | 1 | 4 |
O – oncogene, TS - tumor suppressor.