Table 2.

Correlation analysis between LAYN expression and immune marker sets of various immune cells in HPV-related HNSCC through GEPIA database

Description	Gene markers	HNSCC(n = 520)		HNSCC-HPVpos(n = 97)		HNSCC-HPVneg(n = 419)
		r	P	r	P	r	P
CD8 + T cell	CD8A	− 0.008	0.859	− 0.075	0.461	0.030	0.540
	CD8B	− 0.017	0.703	− 0.103	0.311	0.032	0.508
T cell (general)	CD3D	0.033	0.448	− 0.029	0.776	0.070	0.151
	CD3E	0.085	0.052	0.033	0.750	0.122	0.012
	CD2	0.069	0.117	0.044	0.663	0.097	0.048
B cell	CD19	0.036	0.414	− 0.040	0.695	0.074	0.129
	CD79A	0.095	0.030	0.075	0.462	0.126	0.010
Monocyte	CD86	0.231	***	0.136	0.180	0.257	***
	CD115 (CSF1R)	0.228	***	0.150	0.141	0.253	***
TAM	CCL2	0.283	***	0.245	0.015	0.296	***
	CD68	0.185	***	− 0.061	0.552	0.244	***
	IL10	0.205	***	0.147	0.148	0.217	***
M1 Macrophage	INOS (NOS2)	0.230	***	0.092	0.365	0.299	***
	IRF5	0.126	*	− 0.219	0.030	0.215	***
	COX2(PTGS2)	0.079	0.073	0.303	*	0.037	0.444
M2 Macrophage	CD163	0.217	***	0.092	0.369	0.243	***
	VSIG4	0.230	***	0.057	0.577	0.264	***
	MS4A4A	0.231	***	0.119	0.243	0.253	***
Neutrophils	CD66b (CEACAM8)	0.054	0.217	0.187	0.065	0.051	0.297
	CD11b (ITGAM)	0.234	***	0.121	0.234	0.283	***
	CCR7	0.131	*	0.051	0.616	0.171	**
Natural killer cell	KIR2DL1	0.032	0.460	− 0.126	0.216	0.079	0.104
	KIR2DL3	− 0.050	0.259	− 0.213	0.035	− 0.003	0.945
	KIR2DL4	− 0.031	0.485	− 0.150	0.141	0.006	0.895
	KIR3DL1	− 0.079	0.073	− 0.244	0.016	− 0.021	0.667
	KIR3DL2	0.069	0.116	− 0.087	0.394	0.124	0.011
	KIR3DL3	− 0.042	0.340	− 0.029	0.775	− 0.032	0.519
	KIR2DS4	− 0.050	0.258	− 0.099	0.334	− 0.024	0.622
Dendritic cell	HLA-DPB1	0.115	*	− 0.033	0.744	0.158	*
	HLA-DQB1	0.092	0.035	− 0.046	0.652	0.128	*
	HLA-DRA	0.133	*	− 0.040	0.698	0.186	**
	HLA-DPA1	0.141	*	− 0.022	0.831	0.186	**
	BDCA-1(CD1C)	0.137	*	0.077	0.453	0.163	*
	BDCA-4(NRP1)	0.283	***	0.198	0.050	0.289	***
	CD11c (ITGAX)	0.224	***	0.075	0.462	0.263	***
Th1	T-bet (TBX21)	0.034	0.444	− 0.119	0.242	0.089	0.068
	STAT4	0.265	***	0.103	0.311	0.303	***
	STAT1	0.043	0.323	0.053	0.606	0.036	0.457
	IFN-γ (IFNG)	− 0.057	0.190	− 0.155	0.128	− 0.019	0.700
	TNF-α (TNF)	0.159	**	0.255	0.011	0.145	*
Th2	GATA3	0.023	0.598	0.057	0.578	0.022	0.653
	STAT6	0.128	*	0.070	0.492	0.156	*
	STAT5A	0.160	**	− 0.132	0.195	0.260	***
	IL13	0.029	0.514	0.023	0.826	0.044	0.365
Tfh	BCL6	0.275	***	0.026	0.799	0.347	***
	IL21	0.028	0.519	-0.035	0.734	0.061	0.209
Th17	STAT3	0.223	***	0.240	0.017	0.251	***
	IL17A	0.075	0.086	0.140	0.169	0.087	0.074
Treg	FOXP3	0.241	***	0.241	0.017	0.273	***
	CCR8	0.295	***	0.332	**	0.307	***
	STAT5B	0.271	***	0.056	0.582	0.320	***
	TGFβ(TGFB1)	0.216	***	0.191	0.060	0.218	***
T cell exhaustion	PD-1 (PDCD1)	0.023	0.600	− 0.111	0.275	0.077	0.114
	CTLA4	0.131	*	0.079	0.442	0.158	*
	LAG3	− 0.006	0.895	− 0.055	0.590	0.021	0.664
	TIM-3 (HAVCR2)	0.201	***	0.070	0.493	0.240	***
	GZMB	− 0.045	0.303	− 0.114	0.261	− 0.015	0.754

r: Value of Spearman’s correlation (*P < 0.05, **P < 0.001, ***P < 0.0001)