Table 2.
Antibiotic resistance phenotype and multiple drug resistance results for bacterial genera isolated from various media for all pooled chicken and pork samples.
| Media | Meat sample | Bacterial genus | AMP | AUG2 | AXO | AZI | CHL | CIP | ERY | FIS | FOX | GEN | NAL | STR | SXT | TET | XNL | MDR n (%) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1–32 mg/mL | 0.5/1.16–32 mg/mL | 0.25–64 mg/mL | 0.12–16 mg/mL | 2–32 mg/mL | 0.015–4 mg/mL | 1–128 mg/mL | 16–256 mg/mL | 0.5–32 mg/mL | 0.25–16 mg/mL | 0.5–32 mg/mL | 2–64 mg/mL | 2–64 mg/mL | 4–32 mg/mL | 0.12–8 mg/mL | ||||
| Brilliance™ ESBL | Chicken (n = 91) | Achromobacter spp., n = 2 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Buttiauxella spp., n = 1 (%) | 1 (100) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 1 (100) | ||
| Citrobacter spp., n = 1 (%) | 1 (100) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | ||
| Enterobacter spp., n = 1 (%) | 1 (100) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 1 (100) | ||
| Proteus spp., n = 2 (%) | 1 (100) | 1 (50) | 2 (100) | 0 (0) | 2 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50) | 0 (0) | 1 (50) | 0 (0) | 1 (50) | 0 (0) | 2 (100) | ||
| Pseudomonas spp., n = 28 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (10.7) | 0 (0) | 25 (89.3) | 1 (3.5) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (3.5) | 1 (3.5) | 16 (57.4) | 0 (0) | 1 (3.5) | 0 (0) | ||
| Serratia spp., n = 56 (%) | 52 (92.8) | 42 (75) | 46 (82.1) | 0 (0) | 12 (21.4) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 32 (57.1) | 1 (1.8) | 5 (8.9) | 4 (7.1) | 6 (10.7) | 9 (16.1) | 1 (1.8) | 15 (27) | ||
| Pork (n = 41) | Aeromonas spp., n = 1 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | |
| Citrobacter spp., n = 1 (%) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 1 (100) | ||
| Pseudomonas spp., n = 6 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (33.3) | 0 (0) | 2 (33.3) | 2 (33.3) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 4 (66.6) | 2 (33.3) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Rahnella spp., n = 1 (%) | 1 (100) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | ||
| Serratia spp., n = 31 (%) | 25 (80.6) | 21 (67.7) | 25 (80.6) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (3.2) | 0 (0) | 0 (0) | 18 (58.1) | 0 (0) | 2 (6.4) | 2 (6.4) | 0 (0) | 2 (6.4) | 2 (6.4) | 2 (6.5) | ||
| Yersinia spp., n = 1 (%) | 1 (100) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | ||
| Brilliance™ CRE | Chicken (n = 30) | Acinetobacter spp., n = 13 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 5 (38.5) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (15.4) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (7.7) | 3 (23.1) | 0 (0) | 2 (15.4) | 1 (7.7) | 0 (0) | 1 (7.7) | 1 (7.7) |
| Aeromonas spp., n = 3 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (33.3) | 1 (33.3) | 1 (33.3) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (33.3) | 2 (66.7) | 0 (0) | 1 (33.3) | 0 (0) | 3 (100) | 1 (33.3) | 2 (66.7) | ||
| Enterobacter spp., n = 3 (%) | 3 (100) | 3 (100) | 1 (33.3) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (33.3) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (100) | 1 (33.3) | 0 (0) | 1 (33.3) | 1 (33.3) | 1 (33.3) | 0 (0) | 3 (100) | ||
| Escherichia spp., n = 1 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 1 (100) | ||
| Myroides spp., n = 2 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Pseudomonas spp., n = 1 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | ||
| Stenotrophomonas spp., n = 7 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (42.9) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (42.9) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Pork (n = 11) | Acinetobacter spp., n = 8 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (12.5) | 0 (0) | 1 (14.3) | 4 (62.5) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (37.5) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | |
| Aeromonas spp., n = 1 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 1 (100) | ||
| Buttiauxella spp., n = 1 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Citrobacter spp., n = 1 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Brilliance™ VRE | Chicken (n = 13) | Buttiauxella spp., n = 2 (%) | 1 (50) | 0 (0) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (100) | 0 (0) | 1 (50) |
| Myroides spp., n = 2 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50) | 2 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Serratia spp., n = 9 (%) | 6 (66.7) | 5 (55.5) | 3 (33.3) | 1 (11.1) | 1 (11.1) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (33.3) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (11.1) | 1 (11.1) | 1 (16.7) | 0 (0) | ||
| Pork (n = 4) | Serratia sp., n = 4 (%) | 2 (50) | 2 (50) | 2 (50) | 0 (0) | 3 (75) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (25) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | |
| MAC/XLD | Chicken (n = 65) | Aeromonas spp., n = 3 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (33.3) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Buttiauxella spp., n = 2 (%) | 1 (50) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Citrobacter spp., n = 1 (%) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Enterobacter spp., n = 2 (%) | 1 (50) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Escherichia spp., n = 46 (%) | 2 (4.3) | 3 (6.5) | 46 (100) | 0 (0) | 46 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (2.2) | 6 (13) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Hafnia spp., n = 8 (%) | 2 (25) | 0 (0) | 6 (75) | 0 (0) | 6 (75) | 6 (75) | 0 (0) | 0 (0) | 6 (75) | 6 (75) | 0 (0) | 0 (0) | 6 (75) | 6 (75) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Klebsiella spp., n = 1 (%) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Serratia spp., n = 2 (%) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50) | 1 (50) | 1 (50) | 0 (0) | 1 (50) | 1 (50) | 1 (50) | 1 (50) | 0 (0) | 2 (100) | 2 (100) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Pork (n = 26) | Aeromonas spp., n = 3 (%) | 1 (33.3) | 1 (33.3) | 1 (33.3) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (33.3) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | |
| Buttiauxella spp., n = 2 (%) | 2 (100) | 2 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Citrobacter spp., n = 1 (%) | 1 (100) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Escherichia spp., n = 6 (%) | 1 (16.7) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| Hafnia spp., n = 14 (%) | 3 (21.4) | 4 (28.6) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
| CAM | Chicken (n = 7) | Campylobacter spp., n = 7 (%) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (16.7) | 0 (0) | 0 (0) |
These data are pivotal for comprehending the antibiotic resistance profiles exhibited by bacterial isolates derived from the pooled chicken and pork samples. The table represents the AMR phenotype and MDR (35/288, 12%) for each isolate at the genus level. These isolates were cultured on selective media, including Brilliance™ ESBL, Brilliance™ CRE, Brilliance™ VRE agar, CAMPY, MAC, and XLD, from pooled chicken and pork samples. Specifically, for Gram-negative bacteria (CMV3AGNF Sensititre, Thermo Scientific™) 14 antibiotics comprising 9 CIAs and 5 HIAs, and for Campylobacter (EUCAMP2 Sensititre, Thermo Scientific™), 6 antibiotics comprising 5 CIAs and 1 HIA were tested against antibiotics at concentrations recommended by World Health Organization (2022). Additional details regarding selected antibiotics are provided in Supplementary Table S1.