TABLE 6.
Amino acid conservation in FMDV and ERAV Lpro
| Position no.a | 1 | 6 | 30, 31 | 37 | 40 | 42 | 44-47 | 51-55 | 58-63 | 66, 67 | 73 | 75, 76 | 80 | |||||||||||||||
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| FMDVb | M | C | ME | G | K | F | SRPN | NCWLN | QLFRY | EP | Y | SP | T | |||||||||||||||
| FMDV/ERAVc | M | NCWLN | QL | T | ||||||||||||||||||||||||
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| Position no. | 87 | 91 | 93 | 95 | 98-102 | 104 | 106 | 108-110 | 112 | 114, 115 | 117, 118 | 121-124 | 126 | 130 | ||||||||||||||
| FMDV | L | T | L | L | GGPPA | V | W | IK(H/D) | L | TG | GT | RPSE | C | G | ||||||||||||||
| FMDV/ERAV | T | L | G PP | V | GT | P | G | |||||||||||||||||||||
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| Position no. | 133-143 | 145, 146 | 149-153 | 156 | 159, 160 | 162 | 164-166 | 169-173 | 175 | 178, 179 | 183-185 | 187-189 | ||||||||||||||||
| FMDV | M(C/T)LADFHAGIF | KG | HAVFA | T | GW | A | DDE | YPWTP | P | VL | VPYD | EP | ||||||||||||||||
| FMDV/ERAV | L DF A | K | HAVF | T | GW | DD | YP TP | VL | PYD | |||||||||||||||||||
Numbers indicate Lpro amino acid positions from the first polyprotein AUG of Dialign-aligned FMDV polyproteins.
Invariant Lpro residues among 133 FMDV isolates. The proteolytic active sites C52 and H149 are shown in bold.
Invariant Lpro residues between FMDV and ERAV sequences (38).