Skip to main content
. 2024 Mar 18;25:117. doi: 10.1186/s12859-024-05689-7

Table 2.

The simulation results for the case when the network structure depends on age covariate

p n δ1 δ2 Precision Recall F1 Accuracy
SOHPIE NetCoMi MDiNE SOHPIE NetCoMi MDiNE SOHPIE NetCoMi MDiNE SOHPIE NetCoMi MDiNE
40 20 0.05 0.05 0.26 0.25 0.23 0.64 0.27 0.68 0.68 0.26 0.31 0.44 0.07 0.37
0.05 0.10 0.34 0.33 0.27 0.64 0.28 0.68 0.43 0.30 0.40 0.46 0.09 0.41
0.05 0.20 0.50 0.47 0.46 0.66 0.24 0.64 0.55 0.31 0.60 0.50 0.12 0.49
0.10 0.05 0.35 0.34 0.35 0.65 0.28 0.59 0.44 0.30 0.48 0.46 0.09 0.48
0.10 0.10 0.42 0.40 0.35 0.65 0.27 0.38 0.49 0.32 0.35 0.48 0.11 0.49
0.10 0.20 0.53 0.50 0.54 0.67 0.24 0.50 0.58 0.32 0.51 0.51 0.13 0.52
0.20 0.05 0.50 0.47 0.47 0.65 0.23 0.58 0.55 0.31 0.58 0.50 0.12 0.51
0.20 0.10 0.53 0.51 0.57 0.66 0.24 0.38 0.57 0.32 0.60 0.51 0.13 0.49
0.20 0.20 0.58 0.57 0.59 0.69 0.22 0.84 0.62 0.32 0.69 0.53 0.13 0.58
50 0.05 0.05 0.25 0.26 0.26 0.83 0.44 0.57 0.38 0.31 0.35 0.34 0.11 0.48
0.05 0.10 0.34 0.34 0.33 0.84 0.45 0.67 0.48 0.37 0.42 0.40 0.15 0.44
0.05 0.20 0.50 0.48 0.49 0.84 0.40 0.65 0.62 0.41 0.53 0.50 0.20 0.50
0.10 0.05 0.34 0.34 0.36 0.83 0.44 0.64 0.47 0.36 0.42 0.39 0.15 0.45
0.10 0.10 0.41 0.41 0.44 0.84 0.48 0.63 0.54 0.41 0.48 0.44 0.19 0.49
0.10 0.20 0.53 0.52 0.53 0.84 0.43 0.69 0.64 0.44 0.55 0.52 0.23 0.51
0.20 0.05 0.49 0.48 0.49 0.84 0.40 0.65 0.61 0.41 0.50 0.50 0.20 0.50
0.20 0.10 0.53 0.51 0.55 0.83 0.41 0.52 0.64 0.43 0.45 0.52 0.22 0.50
0.20 0.20 0.58 0.57 0.51 0.84 0.40 0.55 0.68 0.44 0.48 0.56 0.23 0.49
200 0.05 0.05 0.25 0.26 0.25 0.95 0.65 0.92 0.39 0.36 0.39 0.28 0.16 0.29
0.05 0.10 0.34 0.35 0.33 0.95 0.70 0.92 0.50 0.45 0.48 0.36 0.24 0.35
0.05 0.20 0.50 0.50 0.49 0.95 0.64 0.93 0.65 0.53 0.63 0.50 0.32 0.49
0.10 0.05 0.34 0.35 0.34 0.95 0.69 0.93 0.50 0.44 0.49 0.36 0.23 0.36
0.10 0.10 0.41 0.42 0.42 0.95 0.72 0.95 0.57 0.51 0.58 0.42 0.30 0.43
0.10 0.20 0.53 0.53 0.55 0.95 0.68 0.95 0.68 0.57 0.69 0.53 0.36 0.54
0.20 0.05 0.49 0.49 0.49 0.95 0.63 0.95 0.64 0.52 0.64 0.49 0.31 0.49
0.20 0.10 0.52 0.53 0.53 0.95 0.67 0.94 0.67 0.57 0.67 0.52 0.35 0.52
0.20 0.20 0.58 0.58 0.57 0.95 0.63 0.93 0.71 0.58 0.70 0.57 0.37 0.57
500 0.05 0.05 0.25 0.25 0.24 0.98 0.78 0.99 0.39 0.37 0.38 0.26 0.20 0.24
0.05 0.10 0.34 0.35 0.35 0.97 0.82 0.99 0.50 0.47 0.51 0.35 0.28 0.35
0.05 0.20 0.49 0.50 0.50 0.98 0.80 0.98 0.65 0.59 0.65 0.49 0.39 0.50
0.10 0.05 0.34 0.35 0.33 0.98 0.82 0.99 0.50 0.48 0.49 0.35 0.28 0.34
0.10 0.10 0.41 0.41 0.40 0.98 0.85 0.98 0.57 0.54 0.56 0.41 0.35 0.40
0.10 0.20 0.52 0.53 0.53 0.98 0.83 1.00 0.68 0.63 0.68 0.52 0.43 0.53
0.20 0.05 0.50 0.50 0.52 0.98 0.79 1.00 0.65 0.59 0.68 0.50 0.39 0.52
0.20 0.10 0.52 0.52 0.51 0.98 0.84 0.99 0.67 0.63 0.67 0.52 0.44 0.51
0.20 0.20 0.58 0.57 0.58 0.98 0.81 1.00 0.72 0.65 0.73 0.57 0.47 0.58

The binary group variable in the multivariable regression model (continuous age and binary group) using pseudo-value approach is compared with NetCoMi and MDiNE with 1000 replicates. A random network with network size p=40 is generated at each simulation replicate. The best results are highlighted in boldface. The null case is when the effect sizes for each groups are equally adjusted