Table 3.
PARMs-PCR primer sequences and fluorescent signal types.
SNP | Primer | Primer Sequences (5′–3′) | Fluorescent Signal | Genotype |
---|---|---|---|---|
g.21455859 T>C | Ft | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTCTGCAGCCTTTCCGACGT | FAM | T |
Fc | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGCAGCCTTTCCGACGC | HEX | C | |
R | GACAGAGGAGGATCAGGGTCAG | / | / | |
g.21455953 G>A | Rc | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTCAGGCTGGCAGATGTAACCC | FAM | G |
Rt | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTCCAGGCTGGCAGATGTAACCT | HEX | A | |
F | GACCCTGATCCTCCTCTGTCAG | / | / | |
g.21455976 T>C | Ft | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTCATCTGCCAGCCTGGGGT | FAM | T |
Fc | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTATCTGCCAGCCTGGGGC | HEX | C | |
R | GCTAGTTGGGTGGTAGGTGGTG | / | / | |
g.21456106 G>A | Rc | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTCAGCCAGGCGGCTGTTC | FAM | G |
Rt | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTCAGCCAGGCGGCTGTTT | HEX | A | |
F | GCAACGAGAAGGAGACCCTG | / | / | |
g.21460798 G>A | Fg | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGCAGGGCCTGGTCACCG | FAM | G |
Fa | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGCAGGGCCTGGTCACCA | HEX | A | |
R | GGTCACAGCGGATCTCAGCC | / | / | |
g.21460884 A>G | Fg | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGCAGGGCCTGGTCACCG | FAM | A |
Fa | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGCAGGGCCTGGTCACCA | HEX | G | |
R | GGTCACAGCGGATCTCAGCC | / | / | |
g.21463485 T>C | Ft | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTCTGGTGCTTCCTGAGGCTGT | FAM | T |
Fc | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGGTGCTTCCTGAGGCTGC | HEX | C | |
R | GCCCTGCTCTTTTGGTGG | / | / | |
g.21463503 C>G | Rg | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTCTGCTCTTTTGGTGGCCG | FAM | C |
Rc | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTCTGCTCTTTTGGTGGCCC | HEX | G | |
F | ACTGGGTGGCTGGTGCTTC | / | / |