Table 3.
Number of non-retroviral EVE sequence identified and estimated number of germline incorporation events in distinct vertebrate classes
| Virus group | # EVEs identified (estimated # germline incorporation events) | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Total | Mammalia | Aves | Reptilia | Amphibia | Actinopterygii | Chondrichthyes | Agnatha | |||||||||
| ssRNA-ve | ||||||||||||||||
| Bornaviridae | 2566 | (383) | 2434 | (292) | 30 | (11) | 27 | (14) | 52 | (44) | 22 | (21) | - | - | 1 | (1) |
| Chuviridae | 182 | (164) | 24 | (24) | - | - | 23 | (23) | 9 | (9) | 119 | (108) | - | - | 7 | - |
| Filoviridae | 390 | (69) | 389 | (68) | - | - | - | - | 1 | (1) | - | - | - | - | - | - |
| Paramyxoviridae | 19 | (17) | - | - | - | - | - | - | 4 | (3) | 14 | (3) | 1 | (1) | - | - |
| ssRNA + ve | ||||||||||||||||
| Flaviviridae | 8 | (11) | 1 | (1) | - | - | - | - | - | - | 7 | (10) | - | - | - | - |
| DNArt | ||||||||||||||||
| Hepadnaviridae | 993 | (108) | - | - | 897 | (89) | 93 | (17) | 2 | (1) | - | - | 1 | (1) | - | - |
| DNAss | ||||||||||||||||
| Circoviridae | 1198 | (131) | 918 | (29) | 32 | (15) | 91 | (19) | 82 | (24) | 68 | (38) | - | - | 7 | (6) |
| Parvoviridae | 689 | (238) | 534 | (199) | 34 | (10) | 34 | (13) | 12 | (7) | 12 | (6) | 3 | (3) | - | - |
| DNAds | ||||||||||||||||
| Herpesviridae | 13 | (8) | 11 | (6) | 1 | (1) | 1 | (1) | - | - | - | - | - | - | - | - |
| Alloherpesviridae | 28 | (8) | - | - | - | - | - | - | 15 | (3) | 13 | (5) | - | - | - | - |
| Total | 6087 | (1137) | 4311 | (619) | 994 | (126) | 269 | (87) | 177 | (92) | 255 | (191) | 5 | (5) | 15 | (7) |
Germline incorporation here implies both integration and fixation in the germline