TABLE 2.

Sizes of hybridizing restriction fragments

Probe used	Enzyme tested	Fragmenta (kb)	Presence of fragment in strainb:
			MG1363	NCDO712	NCDO763	NCDO2031	LM0230	LM2301
ISS1	SmaI	130 [Sm6]	+	+	+ (160)	+	+	+ (105)
		55	−	+	−	+	−	−
	ApaI	75 [Ap10C]	+	+	+	+	+	+ (120)
		55	−	+	+	+	−	−
φT712	SmaI	220* [Sm4]	+	+	+	+	+	+
		180* [Sm5]	+	−	+	−	+	+
		105 [Sm8]	+	+	+	+	−	−
		22 [Sm14]	+	+	+	+	+	+
	ApaI	165*	−	+	−	+	−	−
		160* [Ap3]	+	−	+	−	+	+
		49 [Ap14]	+	+	+	+	−	−
		13 [Ap27]	+	+	+	+	−	−
		12 [Ap28]	+	+	+	+	−	−
		33 [Ap19]	+	+	+	+	+	+
Sm8	SmaI	105 [Sm8]	+	+	+	+	+ (58)	+ (58)
	ApaI	205 [Ap1]	+	+	+	+	+	+
		49 [Ap14A]	+	+	+	+	+ (29)	+ (29)
		13 [Ap27B]	+	+	+	+	−	−
		12 [Ap28]	+	+	+	+	−	−
		8 [Ap29]	+	+	+	+	+	+
Ap3	SmaI	180 [Sm5A]	+	+ (220)	+	+ (220)	+	+
	ApaI	160 [Ap3]	+	+ (165)	+	+ (165)	+	+
No2	NotI	230 [No2]	+	+	+ (200)	+ (175)	+ (175)	+ (175)
	SmaI	610 [Sm1]	+	+	+ (580)	+ (550)	+ (550)	+ (550)
	ApaI	205 [Ap1]	+	+	+	+	+	+
		145 [Ap4]	+	+	+ (120)	+ (100)	+ (100)	+ (100)
		16 [Ap26]	+	+	+	−	−	−
5′-cluA	SmaI	610 [Sm1]	+	+	+ (580)	−	−	−
	ApaI	50*	+	+	+ (25)	−	−	−
		16 [Ap26]	+	+	+	−	−	−
5′-oppD	SmaI	130 [Sm6]	+	+	+ (160)	+	+	−
		55	−	+	−	+	+	−
	ApaI	75 [Ap10C]	+	+	+	+	+	−
		69* [Ap11]	+	+	+ (19)	+	+ (67)	−
		55	−	+	−	+	+ (65)	−
oppFBc	SmaI	130 [Sm6]	+	+	+ (160)	+	+	−
		55	−	+	−	+	+ (58)	−
	ApaI	75 [Ap10C]	+	+	+	+	+	−
		55	−	+	−	+	+ (65)	−

^aFragment names are given in brackets. Asterisks indicate a weak hybridization signal. Sizes different from the size given in this column are shown in parentheses. 

^bNCDO712 refers to NCDO712 and NCDO505 genomes; NCDO763 refers to NCDO763 and MMS36 genomes; and NCDO2031 refers to NCDO2031 and C2 genomes. 

^cProbes oppCA and pepO gave the same hybridization pattern as oppFB.