Table 4.

Gene expression analysis between CD56^bright and CD56^dim NK cells using Generalized Linear Models and controlling for Age and Sex.

Gene	CD56bright vs. CD56dim					Cases vs. Controls
	Intercept	Beta	P-value*	CD56bright	CD56dim	Intercept	Beta	P-value*	Controls	Long-term treatment	Short-term treatment	No treatment
NKG7	38972	-08639	134E-09	3.166 ± 0.504	4.028 ± 0.313	4009	-0196	153E-04	4.135 ± 0.221	3.903 ± 0.080	3.713 ± 0.286	3.577 ± 0.325
NCAM1 (CD56)	01240	02777	421E-09	0.423 ± 0.195	0.145 ± 0.064	0178	-0033	153E-02	0.206 ± 0.063	0.160 ± 0.063	0.161 ± 0.085	0.113 ± 0.075
FCGR3A (CD16)	06225	-04943	172E-07	0.085 ± 0.143	0.580 ± 0.386	0691	-0199	248E-03	0.751 ± 0.365	0.388 ± 0.181	0.265 ± 0.182	0.270 ± 0.119
KLRC1 (KLRC1)	02479	05604	111E-05	0.906 ± 0.542	0.344 ± 0.218	0512	-0103	218E-02	0.495 ± 0.245	0.319 ± 0.131	0.364 ± 0.232	0.172 ± 0.131
NCR3 (CD337)	04770	-02598	489E-05	0.233 ± 0.190	0.492 ± 0.229	0495	-0081	481E-02	0.534 ± 0.145	0.383 ± 0.142	0.499 ± 0.378	0.276 ± 0.127
KIR2DL1	01049	-00689	534E-05	0.026 ± 0.053	0.095 ± 0.064	0123	-0012	261E-01	0.097 ± 0.051	0.073 ± 0.041	0.085 ± 0.079	0.084 ± 0.095
KLRC3 (NKG2E)	01552	02564	534E-05	0.453 ± 0.271	0.195 ± 0.125	0238	-0025	369E-01	0.239 ± 0.119	0.200 ± 0.158	0.211 ± 0.174	0.164 ± 0.078
B3GAT1 (CD57)	00134	-00165	124E-04	0.000 ± 0.000	0.016 ± 0.020	0015	-0007	438E-02	0.024 ± 0.022	0.009 ± 0.008	0.005 ± 0.011	0.006 ± 0.008
KIR2DL3	00814	-00531	151E-03	0.027 ± 0.057	0.081 ± 0.056	0086	-0011	302E-01	0.082 ± 0.054	0.065 ± 0.028	0.083 ± 0.056	0.042 ± 0.043
KIR3DL2	01160	-00590	151E-03	0.033 ± 0.066	0.092 ± 0.064	0098	0010	398E-01	0.081 ± 0.062	0.084 ± 0.061	0.095 ± 0.076	0.098 ± 0.050
KLRC2	02395	02400	151E-03	0.453 ± 0.328	0.213 ± 0.160	0302	-0029	393E-01	0.277 ± 0.187	0.181 ± 0.121	0.205 ± 0.138	0.239 ± 0.239
KIR2DL4	00953	00955	206E-03	0.133 ± 0.156	0.038 ± 0.024	0085	-0005	398E-01	0.055 ± 0.044	0.050 ± 0.022	0.039 ± 0.016	0.055 ± 0.052
GNLY	45563	03235	992E-03	4.735 ± 0.366	4.415 ± 0.530	4740	-0033	713E-01	4.546 ± 0.402	4.389 ± 0.447	4.195 ± 0.769	4.534 ± 0.304
KIR3DL1	00595	-00631	992E-03	0.029 ± 0.109	0.091 ± 0.079	0075	-0019	141E-01	0.089 ± 0.080	0.095 ± 0.059	0.085 ± 0.103	0.049 ± 0.048
KLRG1	01179	-00761	992E-03	0.086 ± 0.110	0.161 ± 0.099	0150	-0035	483E-02	0.190 ± 0.108	0.132 ± 0.070	0.128 ± 0.069	0.077 ± 0.062
KLRB1 (CD161)	20964	-02592	471E-02	1.981 ± 0.616	2.239 ± 0.297	2168	-0139	614E-03	2.331 ± 0.176	2.235 ± 0.144	2.067 ± 0.388	1.873 ± 0.363
KLRK1 (NKG2D)	06562	01177	259E-01	0.791 ± 0.393	0.674 ± 0.289	0912	-0208	225E-05	0.910 ± 0.178	0.519 ± 0.154	0.487 ± 0.256	0.342 ± 0.082
NCR1	01156	-00221	549E-01	0.114 ± 0.135	0.136 ± 0.073	0147	-0030	382E-02	0.154 ± 0.059	0.137 ± 0.054	0.131 ± 0.109	0.053 ± 0.048
CD7	19797	-00354	836E-01	1.906 ± 0.457	1.941 ± 0.249	1979	0041	393E-01	1.881 ± 0.211	1.975 ± 0.221	2.018 ± 0.393	2.048 ± 0.161
KLRC4 (NKG2F)	01007	00054	847E-01	0.096 ± 0.110	0.091 ± 0.062	0113	-0033	153E-03	0.127 ± 0.037	0.047 ± 0.024	0.088 ± 0.083	0.032 ± 0.028
KLRD1 (CD94)	13727	00430	847E-01	1.378 ± 0.576	1.336 ± 0.460	1700	-0318	474E-05	1.648 ± 0.335	1.219 ± 0.130	1.113 ± 0.426	0.671 ± 0.304
KLRF1	07242	-00258	847E-01	0.888 ± 0.363	0.910 ± 0.384	0922	-0176	122E-02	1.092 ± 0.384	0.754 ± 0.245	0.815 ± 0.304	0.582 ± 0.225
KIR3DL3	00007	431E-05	966E-01	0.001 ± 0.005	0.001 ± 0.003	0002	0000	734E-01	0.000 ± 0.001	0.003 ± 0.006	0.000 ± 0.000	0.000 ± 0.000

*P-values FDR corrected for multiple comparisons. Covariates not shown due to lack of significance. Mean of means shown.