TABLE 2.

Oligonucleotides used in this work

Oligo-nucleotide	Sequence
R27-3	5′ GGGGAGCTCATCTTCATATTACTGACGG 3′
R27-5	5′ GGGGAGCTCATTTAATGAAATTTCGTAAGT 3′
Tn5-3	5′ GCTACTTGTGTATAAGAGTCAG 3′
164P1	5′ CAAAGTATTCTATTGATTTTATTTATTACTCTTAGTGAGGGTGTAGGCTGGAGCTGCTTC 3′
164P2	5′ GTGGCTTTTGAACTGAGCTGTTCGCGATTTTAATTTCAACCATATGAATATCCTCCTAGT 3′
164H1	5′ GATTTTATTTATTACTCTTAGTGA 3′
164H2	5′ GAACTGAGCTGTTCGTCGCGATT 3′
PtraH	5′ TTTTAAAAGTGGCACTATGCGT 3′
traH-5	5′ GTCTAAATCGAAGCTATTAAAG 3′
traH-3	5′ TCATTGTGCCACCTCTGATT 3′
PtraJ	5′ CCGACAATCTGGCGCAGT 3′
traJ-5	5′ GCGGATAATTCTGCTCGTG 3′
traJ-3	5′ GTTTTTGAAAGTTAGACCACA 3′
PtrhR	5′ TTTCACGAACGGGACTTTTT 3′
trhR-5	5′ CAGAATCAGATAACATCACG 3′
trhR-3	5′ TCAATAATCCTTCAAGAGCAC 3′
PtrhA	5′ CGTTTGGCCAGAAAGCATTT 3′
trhA-5	5′ GGAACTGACATTGAATACTAA 3′
trhA-3	5′ TCACAGAGGAATACCAGCAT 3′
PtrhE	5′ CGTGAAAATCGGTGTTTAGTA 3′
trhE-5	5′ GAAACTTCTCAGCAGGTTAAA 3′
trhE-3	5′ AGTTACCTATTGACGGGCGG 3′
16S-1	5′ GCTGCATGGCTGTCGTCAG 3′
16S-3	5′ CGCAGGTTCCCCTACGGTT 3′
HlyS	5′ CAGACCACACCTGGAAAAAC 3′
HlyE	5′ GACTTCGCTTGGAATTCGCA 3′
HlyP	5′ GTCATGCGTGGCGACATTGA 3′
HlyH	5′ GGGCTTCACTGCGAAATTCA 3′
5oriT	5′ CGCGCATTTTTCCCTAAGGT 3′
123-3	5′ AGCATTGACATAAAGAAAAACTTG 3′