TABLE 1.

Bacterial strains and primers

Strain or primer	Genotype, relevant characteristics, or nucleotide sequence	Reference
Strains
S. aureus
DSM20231	Wild-type standard laboratory strain (DSMZ)	41
SH1000	8325-4 rsbU+	21
PBM001	DSM20231 clpC::ermB	This study
HCH001	SH1000 clpC::ermB	This study
MGM001	PBM001(pCX19clpC)	This study
GP266	RN4220 rsbU+sigB1(Am) Tcr	4
MB290	DSM20231 sigB1(Am) Tcr	This study
MB288	PBM001 sigB1(Am) Ermr Tcr	This study
SA113	Restriction-negative mutant of S. aureus 8325-4	23
S. carnousus TM300	Invasion-negative control strain	40
Primers
Cloning
MclpCForw	5′-ATATGGATCCTGTAGAATGATAACTATGGAAGAGG-3′
MclpC2Rev	5′-ATATGGATCCCAAATTCACCACGATATTTAGTACC-3′
clpC2	5′-ATATGGTACCTGGACTGTTTTATATTATGCTTGC-3′
ermBFor	5′-ATGAACAAAAATATAAAATATTCTCAAAAC-3′
ermBRev	5′-TTATTTCCTCCTCCCGTTAAATAATAGATAAC-3′
KclpC1A	5′-ATATGGATCCAGTAGGAGGTCATTATTTATGTTATT-3′
KclpC2Sma	5′-ATATCCCGGGTGGACTGTTTTATAATTATGCTTGC-3′
Real-time RT-PCR
acsA f1	5′-AAGATATGCAACGGTTATCTAATAAAGCA-3′
acsA r1	5′-AGGTGTACGCGACATAAATATAAATACTCT-3′
asp23 f1	5′-CAAGAACAAAATCAAGAGCCTCAAT-3′
asp23 r1	5′-CTTCACGTGCAGCGATACCA-3′
citB f1	5′-CATTACCACAAGGCGCAACA-3′
citB r1	5′-GAACTCCACAAATTTACCAACAACA-3′
clpB f1	5′-AGTAGCAGTTAGTGAGCCTGATG-3′
clpB r1	5′-TCTATCTTGAATACGCACACCATG-3′
clpC f1	5′-GAAGAAGCAATTCGTTTAAATCATTCA-3′
clpC r1	5′-CTTTCTAATACTTTTGCAGCAATTCCTT-3′
clpP f1	5′-TGACAACGTAGCAAATTCAATCGTAT-3′
clpP r1	5′-CACTTCCACCTGGTGAATTAATGTAT-3′
gyrB f1	5′-GACTGATGCCGATGTGGA-3′
gyrB r1	5′-AACGGTGGCTGTGCAATA-3′