TABLE 3.
Detection sensitivities of LAMP
| Primer set (min) | Detection of genomic DNA (fg/tube) witha:
|
|||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No loop primers
|
Loop primers
|
|||||||||||||||||||||
| 0 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 1010 | 0 | 101 | 102 | 103 | 104 | 105 | 106 | 107 | 108 | 109 | 1010 | |
| P. gingivalis | ||||||||||||||||||||||
| 0 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 10 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 20 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 30 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ± | ± | ± | ± | ± | ± | + | + |
| 40 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
| 50 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ± | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
| 60 | − | − | − | − | − | ± | ± | ± | ± | + | + | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
| T. forsythia | ||||||||||||||||||||||
| 0 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 10 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 20 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
| 30 | − | ± | ± | ± | ± | ± | ± | ± | ± | ± | ± | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
| 40 | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
| 50 | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
| 60 | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
| T. denticola | ||||||||||||||||||||||
| 0 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 10 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 20 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ± | + |
| 30 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + |
| 40 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ± | ± | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | + |
| 50 | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | − | − | − | + | + | + | + | + | + | + | + |
| 60 | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | − | − | + | + | + | + | + | + | + | + | + |
a
+, clearly visible; ±, visible but not clear; −, not visible.