Table 2.

Coxiella burnetii genotyping based on multiple spacer sequence typing.

Sample category	Sample number	Intergenic spacer										MST genotype
		COX2	COX5	COX18	COX20	COX22	COX37	COX51	COX56	COX57	COX61
1	55	8	4	9	5	7	5	2	3	11	6	Novel
2	2	8	4	9	5	7	5	2	3	NA	6	NI
3	1	8	4	9	5	7	5	2	NA	11	6	NI
4	4	8	4	9	NA	7	5	2	3	11	6	NI
5	7	8	4	NA	5	7	5	2	3	11	6	NI
6	1	8	4	NA	5	7	5	2	NA	11	6	NI
7	1	8	4	NA	5	7	5	2	3	11	NA	NI
8	2	8	4	NA	NA	7	5	2	3	11	6	NI
9	1	8	NA	9	5	7	5	2	3	11	6	NI
10	1	8	NA	9	NA	NA	5	2	NA	NA	6	NI
11	1	8	NA	9	NA	NA	NA	2	3	11	6	NI
12	1	8	NA	NA	5	7	5	2	3	NA	6	NI
13	1	8	NA	NA	NA	7	5	2	3	11	6	NI
14	1	8	NA	NA	NA	NA	NA	2	NA	11	NA	NI
15	1	8	NA	NA	5	7	5	2	3	11	6	NI
16	4	NA	4	9	5	7	5	2	3	11	6	NI
17	1	NA	4	9	5	7	NA	NA	3	NA	6	NI
18	1	NA	4	9	NA	7	5	2	3	11	6	NI
19	1	NA	4	9	NA	NA	5	NA	3	NA	NA	NI
20	2	NA	NA	9	5	7	5	2	3	11	6	NI
21	1	NA	NA	NA	5	NA	NA	2	NA	NA	NA	NI

NA, not amplified; NI, not identified.