TABLE 2.
Strain | Yr | Source | Serogroup | MIC (μg/ml)
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Sequence typeb
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PenG | AMX | CTX | CRO | 1a | 1b | 2a | 2b | 2x | 3 | MurM | ||||
5204 | 1999 | Sputum | 14 | 6.0 | 6.0 | 12.0 | 3.0 | C3 | A5 | A3 | D1 | C3 | A1 | A1 |
5268 | 2000 | Blood | 14 | 3.0 | 4.0 | 4.0 | 2.0 | C3 | A5 | A3 | D1′ | C3 | A1 | A1 |
4843 | 1997 | Trachea | 23 | 2.0 | 1.5 | 1.0 | 1.0 | C1 | A3 | A6 | C1 | C1 | A1 | A1 |
4790 | 1996 | Blood | 23 | 1.5 | 1.5 | 1.0 | 1.0 | C1 | A3 | A6 | C1 | C1 | A1 | A1 |
5062 | 1999 | Trachea | 14 | 1.5 | 3.0 | 2.0 | 1.0 | C3 | A5 | A3 | ND | ND | A1 | A1 |
5245 | 2000 | Sputum | 6 | 1.5 | 3.0 | 0.75 | 0.75 | C2 | A1 | A4 | E1 | C2 | A1 | C1 |
5180 | 1999 | Sputum | 15 | 1.5 | 1.0 | 2.0 | 1.0 | C1 | A3 | A6 | C1 | C1′ | A1 | A1 |
4883 | 1997 | Blood | 9 | 1.0 | 1.5 | 0.75 | 0.75 | C1 | A3 | A3 | C1 | C1 | A1 | B1 |
5047 | 1999 | Nose swab | 9 | 0.75 | 0.50 | 2.0 | 0.50 | C1 | A4 | A3 | C1 | C1 | A1 | A1 |
5104 | 1999 | Sputum | 23 | 0.50 | 0.50 | 0.75 | 0.50 | C1 | A3 | A6 | C1 | C1 | A1 | A1 |
4935 | 1998 | Blood | 3 | 0.50 | 0.25 | 0.38 | 0.25 | C1 | A3 | A6 | C1 | C1 | A1 | A1 |
5024 | 1999 | Bronchus | 15 | 0.25 | 0.094 | 0.38 | 0.38 | A1 | A2 | ND | F1 | A5 | A1 | A1 |
5031 | 1999 | Bronchus | 23 | 0.25 | 0.19 | 0.19 | 0.125 | C1 | A3 | A6 | C1 | C1 | A1 | A1 |
5259 | 2000 | Trachea | 15 | 0.19 | 0.023 | 0.094 | 0.064 | B1 | A3 | A5 | B1 | B1 | A2 | A2 |
4816 | 1997 | CSF | 15 | 0.094 | <0.016 | 0.064 | 0.032 | B1 | A3 | A5 | B1 | B1 | A2 | A2 |
5023 | 1999 | Blood | 3 | 0.064 | 0.032 | 0.032 | 0.047 | A1′′ | A1 | A1 | A3 | A3 | A1 | A1 |
4942 | 1998 | Blood | 6 | 0.047 | 0.064 | 0.032 | 0.047 | A1 | A3 | A7 | B2 | A4 | A1 | A1 |
5084 | 1999 | Eye swab | ND | 0.023 | <0.016 | <0.016 | <0.016 | A1 | ND | A8 | A1′ | A1′ | A1 | A1′ |
5074 | 1999 | Blood | 23 | 0.016 | <0.016 | <0.016 | <0.016 | A1′′ | A3 | A2 | A1 | A1 | A1 | A1 |
4910 | 1998 | Pleural liquid | 19 | <0.016 | <0.016 | <0.016 | 0.016 | A1′′ | A1 | A7 | A1′′ | A1 | A1 | A1 |
5075 | 1999 | Blood | 6 | <0.016 | <0.016 | <0.016 | <0.016 | C1 | A3 | A9 | A1 | A1 | A1 | A2 |
5223 | 2000 | Bronchus | 6 | <0.016 | <0.016 | <0.016 | <0.016 | A1′ | A1 | A4 | A2 | A2 | A1 | A1 |
R6 | <0.016 | <0.016 | <0.016 | <0.016 | A1 | A1 | A1 | A1 | A1 | A1 | A1 | |||
R65031 | 1.0 | 0.75 | 0.75 | 0.5 | C1 | A3 | A6 | C1 | C1 | A1 | A1 |
Data for isolates with identical sequences are highlighted in boldface. Abbreviations: CSF, cerebrospinal fluid; ND, not determined; PenG, penicillin G; AMX, amoxicillin; CTX, cefotaxime; CRO, ceftriaxome.
For PBP1a, PBP 2b, PBP 2x, and MurM, sequences that differed from each other by at most 10 residues are grouped under a capital letter, sequences that differed by at most a single residue are grouped under a single number, and primes denote single substitutions. For PBP 1b, PBP 2a, and PBP 3, each sequence that differs at a single position is designated by a number.