Table 1.
Allele-Based and Genotype-Based Association with Schizophrenia, Schizoaffective Disorder, and Bipolar Disorder, Showing the Celera SNP and dbSNP Identifiers for Each Genotyping Marker[Note]
|
Association P Valuea |
Allele Frequency |
||||||
| Celera SNP | dbSNP | Allelic | Genotypic | Coding Change | Controls | Cases | Risk Ratio |
| hCV27474272 | rs3738400 | … | … | Gly5Met | … | … | … |
| hCV12001977 | rs1895225 | … | … | … | … | … | … |
| hCV12001946 | rs1572899 | … | .048c | … | .298 | .397 | 1.185 |
| hCV12001945 | rs1538975 | … | … | … | … | … | … |
| hCV25641899 | rs3738401 | … | … | Gln264Arg | … | … | … |
| hCV12001940 | rs1954175 | … | … | … | … | … | … |
| hCV9626784 | rs1340982 | … | … | … | … | … | … |
| hCV16113533 | rs2812379 | … | … | … | … | … | … |
| hCV16114160 | rs2793094 | … | … | … | … | … | … |
| hCV12001932 | rs1538977 | … | … | … | … | … | … |
| hCV16114126 | rs2793101 | … | … | … | … | … | … |
| hCV16113570 | rs2812393 | .048b | … | … | .336 | .404 | 1.203 |
| hCV12001930 | rs1322784 | .013b | .008b | … | .680 | .759 | 1.117 |
| hCV12001929 | rs1322783 | .047b | … | … | .849 | .899 | 1.059 |
| hCV1650649 | rs2255340 | .006b | .016b | … | .702 | .787 | 1.121 |
| hCV1650650 | rs2738864 | .005b | .012b | … | .700 | .787 | 1.125 |
| hCV1650657 | rs1407598 | … | .046d | … | .198 | .227 | 1.150 |
| hCV1650667 | rs6675281 | .0000023c | .000056c | Leu607Phe | .132 | .319 | 2.417 |
| hCV1650669 | rs1407598 | … | .039d | … | .195 | .221 | 1.133 |
| hCV9627536 | rs1535529 | … | .035d | … | .200 | .221 | 1.106 |
| hCV1650688 | rs1000731 | … | … | … | … | … | … |
| hCV1650709 | rs734551 | … | … | … | … | … | … |
| hCV1650713 | … | … | .024c | … | .337 | .327 | 1.031 |
| hCV9628231 | rs999710 | … | .003c | … | .691 | .612 | 1.129 |
| hCV1650723 | … | .01b | .003b,c | … | .309 | .410 | 1.326 |
| hCV9628176 | rs821723 | … | … | … | … | … | … |
| hCV1650750 | rs2038636 | … | … | … | … | … | … |
| hCV1650754 | rs821717 | … | … | … | … | … | … |
| hCV1433206 | rs821577 | … | … | … | … | … | … |
| hCV9628138 | … | … | .037b | … | .477 | .527 | 1.106 |
| hCV9628093 | rs1417866 | … | … | … | … | … | … |
| hCV9628061 | rs821592 | … | … | … | … | … | … |
| hCV1433188 | rs821597 | … | … | … | … | … | … |
| hCV1433174 | rs821653 | … | … | … | … | … | … |
| hCV9627519 | rs843979 | … | … | … | … | … | … |
| hCV1433135 | rs821616 | … | … | Cys704Ser | … | … | … |
| hCV1433111 | rs3524 | … | .037d | … | .498 | .617 | 1.240 |
| hCV26095 | rs2806465 | … | … | … | … | … | … |
| hCV9626960 | rs1411776 | … | … | … | … | … | … |
Note.— Allele frequencies and risk ratios are given for markers showing association.
a
Significant P values are shown for individual genotypes at each locus.
b
Association with schizophrenia.
c
Association with schizoaffective disorder.
d
Association with bipolar disorder.