Table 1.
Primer Sequences for Quantitative RT-PCR Analysis
Gene symbol | Species | Forward primer | Reverse primer |
---|---|---|---|
Adgre1 | Mouse | 5′-TGACTCACCTTGTGGTCCTAA-3′ | 5′-CTTCCCAGAATCCAGTCTTTCC-3′ |
Nlrp3 | Mouse | 5′-GGAGAGACCTTTATGAGAAAGCAA-3′ | 5′-GCTGTCTTCCTGGCATATCACA-3′ |
Casp1 | Mouse | 5′-AACACTTTGAAGTGCCCAAGC-3′ | 5′-CACTCCTTGTTTCTCTCCACG-3′ |
Il18 | Mouse | 5′-CCTTTGAGGCATCCAGGACAA-3′ | 5′-CGGGGCCTGAGGATTATAGC-3′ |
Tnf | Mouse | 5′-ATGGCCTCCCTCTCATCAGT-3′ | 5′-TTTGCTACGACGTGGGCTAC-3′ |
Ccl2 | Mouse | 5′-CAGGTCCCTGTCATGCTTCT-3′ | 5′-GTGGGGCGTTAACTGCATCT-3′ |
Ppia | Mouse | 5′-CCCACCGTGTTCTTCGACAT-3′ | 5′-CCAGTGCTCAGAGCTCGAAA-3′ |
Tgfb1 | Mouse | 5′-TTGCTTCAGCTCCACAGAGA-3′ | 5′-TGGTTGTAGAGGGCAAGGAC-3′ |
Col1a1 | Mouse | 5′-GGGGCAAGACAGTCATCGAA-3′ | 5′-GAGGGAACCAGATTGGGGTG-3′ |
Col2a1 | Mouse | 5′-ACTTGCCAAGACCTGAAACTCTG-3′ | 5′-AAACTTTCATGGCGTCCAAGG-3′ |
Mmp2 | Mouse | 5′-GCCCCCATGAAGCCTTGTTT-3′ | 5′-GGTCATAGTCCTCGGTGGTG-3′ |
Mmp9 | Mouse | 5′-CAGCCGACTTTTGTGGTCTTC-3′ | 5′-CGGTACAAGTATGCCTCTGCCA-3′ |
Apoa1 | Mouse | 5′-GGCAGAGACTATGTGTCCCAGT-3′ | 5′-GCTGACTAACGGTTGAACCCAG-3′ |
Abca1 | Mouse | 5′-GGAGCCTTTGTGGAACTCTTCC-3′ | 5′-CGCTCTCTTCAGCCACTTTGAG-3′ |
Abcg1 | Mouse | 5′-GACACCGATGTGAACCCGTTTC-3′ | 5′-GCATGATGCTGAGGAAGGTCCT-3′ |
Nceh1 | Mouse | 5′-CGGTATTTCTGGAGACAGTGCTG-3′ | 5′-GGTGTGTTGAAGTCCAAAGCCTG-3′ |
Cyp7a1 | Mouse | 5′-CACCATTCCTGCAACCTTCTGG-3′ | 5′-ATGGCATTCCCTCCAGAGCTGA-3′ |
Cyp8b1 | Mouse | 5′-GGTACGCTTCCTCTATCGCC-3′ | 5′-GAGGGATGGCGTCTTATGGG-3′ |
Cyp2c70 | Mouse | 5′-AAGCTCTGATTGACCAGGGAG-3′ | 5′-GCCGGGTTTGTTTCCATGTT-3′ |
Abcb11 | Mouse | 5′-CCTTGGTAGAGAAGAGGCGACA-3′ | 5′-ATGGCTACCCTTTGCTTCTGCC-3′ |
Srebf1 | Mouse | 5′-CGACTACATCCGCTTCTTGCAG-3′ | 5′-CCTCCATAGACACATCTGTGCC-3′ |
Scd1 | Mouse | 5′-GCAAGCTCTACACCTGCCTCTT-3′ | 5′-CGTGCCTTGTAAGTTCTGTGGC-3′ |
Fasn1 | Mouse | 5′-CACAGTGCTCAAAGGACATGCC-3′ | 5′-CACCAGGTGTAGTGCCTTCCTC-3′ |
Fads2 | Mouse | 5′-TTCCTGGAGAGCCACTGGTTTG-3′ | 5′-GAAGAAGGACTGCTCCACATTGC-3′ |
Srebf2 | Mouse | 5′-AGAAAGAGCGGTGGAGTCCTTG-3′ | 5′-GAACTGCTGGAGAATGGTGAGG-3′ |
Hmgcr | Mouse | 5′-GTGCGTAAGCGCAGTTCCTT-3′ | 5′-CACAGTCCTTGGATCCTCCG-3′ |
Ldlr | Mouse | 5′-CCAATCGACTCACGGGTTCA-3′ | 5′-CAACCACCATTGGGGAGGAG-3′ |
Pparg1 | Mouse | 5′-GAAAGACAACGGCAAATCACC-3′ | 5′-GGGGGTGATATGTTTGAACCTG-3′ |
Pparg2 | Mouse | 5′-TGCTGTTATGGGTGAAACTCTG-3′ | 5′-CTGTGTCAACCATGGTAAATTTCTT-3′ |
Cd36 | Mouse | 5′-GATGAATGGTTGAGACCCCGT-3′ | 5′-ATTTCAGAAGGCAGCAACTTC-3′ |
Lpl | Mouse | 5′-GCGTAGCAGGAAGTCTGACCAA-3′ | 5′-AGCGTCATCAGGAGAAAGGCGA-3′ |
Pnpla2 | Mouse | 5′-ACCTTCGCAATCTCTACCGC-3′ | 5′-TGGGTTGGTTCAGTAGGCCA-3′ |
Hprt1 | Mouse | 5′-GTTGGGCTTACCTCACTGCT-3′ | 5′-TAATCACGACGCTGGGACTG-3′ |
SREBF2 | Human | 5′-CTCCATTGACTCTGAGCCAGGA-3′ | 5′-GAATCCGTGAGCGGTCTACCAT-3′ |
HMGCR | Human | 5′-TGATTGACCTTTCCAGAGCAAG-3′ | 5′-CTAAAATTGCCATTCCACGAGC-3′ |
PPARG1 | Human | 5′-GACAGGAAAGACAACAGACAAATC-3′ | 5′-GGGGTGATGTGTTTGAACCTG-3′ |
PPARG2 | Human | 5′-TCCATGCTGTTATGGGTGAA-3′ | 5′-TGTGTCAACCATGGTATTTTC-3′ |
CD36 | Human | 5′-GGCTGTGACCGGAACTGTG-3′ | 5′-AGGTCTCCAACTGGCATTAGAA-3′ |
FATP5 | Human | 5′-TGGAGGAGATCCTTCCCAAGC-3′ | 5′-TGGTCCCCGAGGTATAGATGAA-3′ |
FGF21 | Human | 5′-CTGTGGGTTTCTGTGCTGG-3′ | 5′-CCGGCTTCAAGGCTTTCAG-3′ |
ABCA1 | Human | 5′-ACCCACCCTATGAACAACATGA-3′ | 5′-GAGTCGGGTAACGGAAACAGG-3′ |
APOB | Human | 5′-TGCTCCACTCACTTTACCGTC-3′ | 5′-TAGCGTCCAGTGTGTACTGAC-3′ |
APOE | Human | 5′-GTTGCTGGTCACATTCCTGG-3′ | 5′-GCAGGTAATCCCAAAAGCGAC-3′ |
TM6SF2 | Human | 5′-GCATTGATGAGCGCCCTAATC-3′ | 5′-AGTGGGTCATAGGAGACCTCG-3′ |
HPRT1 | Human | 5′-CCTGGCGTCGTGATTAGTGA-3′ | 5′-CGAGCAAGACGTTCAGTCCT-3′ |
FITM2 | Human | 5′-GTCTGTGCTGCATGAGGTGAA-3′ | 5′-CCAGATGAAAGTCAGAATGCCC-3′ |
BECN1 | Human | 5′-GAAGACGTGGAAAAGAACCGC-3′ | 5′-CAGCCTGAAGTTATTGATTGTGC-3′ |
ATG3 | Human | 5′-GCCGTTAAAGAGATCACACTGG-3′ | 5′-CATAGCCAAACAACCATAATCGTGG-3′ |
ATG5 | Human | 5′-CAGCTCTTCCTTGGAACATC-3′ | 5′-GGCTGTGGGATGATACTAATATG-3′ |
ATG12 | Human | 5′-CTGCTGGCGACACCAAGAAA-3′ | 5′-CGTGTTCGCTCTACTGCCC-3′ |
LC3 | Human | 5′-AAGGCGCTTACAGCTCAATG-3′ | 5′-CTGGGAGGCATAGACCATGT-3′ |
SQSTM1 | Human | 5′-ATCGGAGGATCCGAGTGT-3′ | 5′-TGGCTGTGAGCTGCTCTT-3′ |