TABLE 1.
Sequence detected or purpose | Primer | Nucleotide sequence | Location (size [bp]) of PCR producta | Annealing temp (°C) |
---|---|---|---|---|
23S rRNA | 5gb | 5′-TCAGGGTGATGGACTGC-3′ | 1027–2665 (1,639) | 56 |
ZGE23b | 5′-CACAGGCCAGTTAGCTA-3′ | |||
A2142 G | 5gb | 5′-TCAGGGTGATGGACTGC-3′ | 1027–2530 (1,504) | 60 |
DP4b | 5′-AGGTCCACGGGGTCTTC-3′ | |||
A2143G | 5gb | 5′-TCAGGGTGATGGACTGC-3′ | 1027–2531 (1,505) | 59 |
DP5b | 5′-AAGGTCCACGGGGTCTC-3′ | |||
A2142C | 5gb | 5′-TCAGGGTGATGGACTGC-3′ | 1027–2535 (1,509) | 65 |
DP6 | 5′-AGTAAAGGTCCACGGGGTCTTG-3′ | |||
Sequencing | 2451-F | 5′-TCAACCAGAGATTCAGT-3′ | 2451–2665 (215) | 50 |
ZGE23b | 5′-CACAGGCCAGTTAGCTA-3′ |