TABLE 1.
Bacterial strains used in this study and their lysine decarboxylase activity
Strain | Serotype | DEC no.a | LDC test | Strain | Serotype | DEC no.a | LDC test | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
EPEC strains | ||||||||
572-56 | O55:H6 | 1A | + | |||||
C54-58 | O55:H6 | 1B | + | |||||
F196-5 | O55:H6 | 1C | + | |||||
F563-55 | O55:H6 | 1D | + | |||||
AC-C2 | O55:H6 | 1E | + | |||||
3787-62 | O55:H6 | 2A | + | |||||
5513-56 | O55:NM | 2B | + | |||||
607-54 | O55:H6 | 2C | + | |||||
F60-51 | O55:H6 | 2D | + | |||||
2087-77 | O55:H6 | 2E | + | |||||
5624-50 | O55:H7 | 5A | + | |||||
660-79 | O55:H7 | 5B | + | |||||
5380-66 | O55:H7 | 5C | + | |||||
C586-65 | O55:H7 | 5D | + | |||||
C997-63 | O55:H7 | 5E | + | |||||
5338-66 | O111:H21 | 6A | + | |||||
C142-54 | O111:H12 | 6B | + | |||||
2277-67 | O111:H12 | 6C | + | |||||
F436-51 | O111:H12 | 6D | + | |||||
184-83 | O111:NM | 6E | + | |||||
2254-75 | O128a:H2 | 11A | + | |||||
3733-71 | O128a:H2 | 11B | + | |||||
A9619-C2 | O45:H2 | 11C | + | |||||
EHEC strains | ||||||||
3299-85 | O157:H7 | 3A | + | |||||
46240 | O157:H7 | 3B | + | |||||
3104-88 | O157:H7 | 3C | + | |||||
3009-88 | O157:H7 | 3D | + | |||||
3077-88 | O157:H7 | 3E | + | |||||
493/89 | O157:H- | + | ||||||
C1520-77 | O157:H7 | 4A | + | |||||
C999-87 | O157:H7 | 4B | + | |||||
C374-83 | O157:H7 | 4C | + | |||||
C681-87 | O157:H7 | 4D | + | |||||
C7-88 | O157:H7 | 4E | + | |||||
EDL-933 | O157:H7 | + | ||||||
2198-77 | O111a:NM | 8A | − | |||||
3030A-86 | O111:H8 | 8B | − | |||||
86-10049 | O111:NM | 8C | + | |||||
C130-53 | O111:H11 | 8D | + | |||||
C194-65 | O111:H8 | 8E | − | |||||
Texas outbreakb | O111:H8 | − | ||||||
3323-61 | O26:H11 | 9A | + | |||||
2262-79 | O26:N | 9B | − | |||||
C240-52 | O26:N | 9C | + | |||||
C814-67 | O26:H11 | 9D | + | |||||
45 | O26:H11 | 9E | + | |||||
E335021/OF | O128:H2 | 11D | ||||||
WM63 | O128:H2 | 11E | + | |||||
F1-50 | O111:H2 | 12A | ||||||
2966-56 | O111:H2 | 12B | + | |||||
3942-67 | O111:NM | 12C | + | |||||
9101-83 | O111:H2 | 12D | ||||||
3291-86 | O111:N | 12E | + | |||||
C916-70 | O128:H21 | 14A | + | |||||
C691-71 | O128:H21 | 14B | + | |||||
9088-83 | O128a:H21 | 14C | + | |||||
1791-79 | O128:NM | 14D | + | |||||
C639-77 | O128:H21 | 14E | + | |||||
5430-66 | O111:H21 | 15A | + | |||||
448-71 | O111:H21 | 15B | + | |||||
2660-77 | O111:H21 | 15C | + | |||||
2708-78 | O111:H21 | 15D | + | |||||
2394-80 | O111:H21 | 15E | + | |||||
RDEC strain | ||||||||
RDEC-1 | O15:NM | + | ||||||
H30 | O26:H11 | + | ||||||
3047-86 | O26:H11 | 10B | + | |||||
1557-77 | O26:H11 | 10C | + | |||||
C12-52 | O26:H11 | 10D | + | |||||
900105 | O26:H11 | 10E | + | |||||
ETEC strains | ||||||||
75001 | O157:H43 | 7A | + | |||||
902034 | O149:NM | 7B | + | |||||
820691 | O157:H43 | 7C | + | |||||
831015 | O157:H43 | 7D | + | |||||
861575 | O157:NM | 7E | + | |||||
3350-73 | O128:H7 | 13A | + | |||||
5024-71 | O128:H7 | 13B | + | |||||
C500-74 | O128:H7 | 13C | + | |||||
C1083-79B | O128:H7 | 13D | + | |||||
2384-81 | O128:H47 | 13E | + | |||||
E. coli K-12 strains | ||||||||
MG1655c | + |