Table 2.
Alterations of CDKN2A/CCND1/CDK4/RB1genes in head and neck lesions (+ Positive for the particular alteration, − negative for the particular alteration, P CDKN2A polymorphism, ND not done, L loss of heterozygosity, MA1 microsatellite size alteration of one allele, MA2 microsatellite size alterations of both alleles, LMA loss of one allele and size alteration of the other allele, RH retention of heterozygosity, NI non-informative, AMP amplification, D dysplastic lesions)
| Parameter | L15 | L25 | 4248 | 2024 | L13 | L14 | L26 | L28 | L33 | L47 | L38 | L39 | 4188 | 292 | 222 | 7428 | 1047 | 558 | 6290 | 1295 | 7216 | 5959 | 410 | 939 | 3216 | 825 | 149 | 2592 | 1367 | 326 | 7059 | 5325 | 308 | 4332 | 2086 | 7783 | 693 | 5364 | 1068 | 311 | 5011 | 2618 | 802 | 2030 | 5184 | 1445 | 4904 | 1491 | 7286 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CDKN2A mutation | Exon-1 | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Exon-2 | + | − | + | + | + | + | + | + | + | P | P,+ | + | + | + | + | + | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CDKN2A methylation | − | − | + | − | − | + | − | + | − | − | − | + | + | − | − | + | − | + | + | − | − | + | + | − | − | − | − | + | + | − | − | − | + | − | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + | − | − | ND | − | − | |
| CDKN2A homozygous deletion | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | − | − | − | − | − | − | |
| D9S942 status | MA2 | L | RH | NI | LMA | RH | MA2 | L | RH | RH | MA2 | L | RH | L | RH | RH | RH | RH | L | L | RH | RH | RH | RH | MA2 | MA2 | LMA | RH | RH | RH | L | L | RH | MA2 | LMA | MA2 | MA1 | MA1 | ND | RH | NI | RH | RH | L | MA2 | MA2 | MA1 | MA2 | L | |
| CCND1 amplification | AMP | AMP | AMP | AMP | ND | AMP | AMP | AMP | AMP | AMP | AMP | AMP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CDK4 Arg24Cys mutation | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | |
| RB1 status | NI | RH | RH | NI | RH | RH | NI | ND | RH | ND | NI | NI | L | NI | NI | NI | RH | RH | ND | NI | NI | ND | NI | NI | RH | L | NI | NI | RH | NI | RH | NI | NI | NI | NI | RH | NI | MA2 | NI | NI | NI | L | NI | RH | L | NI | NI | NI | L | |
| Stage | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | D | I | I | I | II | II | II | II | II | II | II | II | II | II | II | II | III | III | III | III | III | III | III | III | III | III | III | III | IV | IV | IV | IV | IV | IV | IV | IV | IV | IV | |