Table II. Co-localizations of TRIM proteins with compartment-specific markers.
Name | Recycling endosomesa |
Mitochondriaa |
Endocytic vesiclesa |
Clathrin-coated pitsa |
Golgia |
TGNa |
Intermediate filamentsa |
Microtubulesa |
Actina |
PML bodiesa |
BRCA-1 bodiesa |
Coil bodiesa |
Spliceosomesa |
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Transferrinb | Mito Trackerb | Cytochrome cb | mtHSP70b | AP2b | Clathrinb | Giantinb | Rab2b | Vimentinb | β-tubulinb | Phalloidinb | PMIb | BRCA-1b | p80 coilinb | SC35b | |
TRIM1 | yes | ||||||||||||||
TRIM2 | no | no | no | ||||||||||||
TRIM3 | no | no | no | ||||||||||||
TRIM4 | no | no | no | no | no | no | |||||||||
TRIM8 | no | no | no | no | |||||||||||
TRIM10 | no | no | no | ||||||||||||
TRIM12 | no | no | no | no | no | no | no | ||||||||
TRIM13 | no | no | no | ||||||||||||
TRIM14 | no | no | no | no | |||||||||||
TRIM18 | yes | ||||||||||||||
TRIM19 | yes | ||||||||||||||
TRIM21 | no | no | no | ||||||||||||
TRIM22 | no | no | |||||||||||||
TRIM23 | no | no | no | no | |||||||||||
TRIM25 | no | no | no | no | no | no | |||||||||
TRIM26 | no | no | no | no | no | no | |||||||||
TRIM27 | no | ||||||||||||||
TRIM29 | no | no | no | ||||||||||||
TRIM30 | no | no | no | no | no | no | |||||||||
TRIM32 | no | no |
aTested subcellular compartment.
bMarker used in the colocalization experiments.